Formation Gephi : Le logiciel Gephi

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-1-

une

applicationUne

communautéun

consortium

Gephi is an interactive visualization and exploration platform for all kinds of networks and complex systems, dynamic and

hierarchical graphs.

Like photoshoptm for graphs

100.000 téléchargements

10 ANS d’existence

d’une communauté

1.000 Membres

sur facebook

Duke Award, JavaOne 2010 (Mathieu Bastian

un consortium

• donner à la communauté une strucutre légale • fournir une infrastructure de recherche • fournir des solutions légales pour exploiter Gephi

Objectif : Un effort de R&D pour construire des parts réutilisable et générique de gephi

https://consortium.gephi.org/

Ressources-2-

Tutoriel pour gephihttp://gephi.org/users/

http://gephi.org/tutorials/gephi-tutorial-quick_start.pdf

le GEXFhttp://gexf.net/format/

marketplacehttps://marketplace.gephi.org/

Une pierre angulaire dans le cycle deproduction des cartographies

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Techniquement, la cartographie de l’information repose sur la maîtrise des différentes étapes de la chaîne de production

• Curation, Enrichissement des données• Visualisation de graphes• Spatialisation, hiérarchisation, groupement• Finalisation cartographique

ajout de méta-données ou

de descripteurs aux données natives

Patterns à explorer Nouvelles métrique

à intégrer

Vues complémentaires

à produire

GEPHI : un élément central dans le cyclede production de la cartographie

système d’information

anayse desdonnées

cartographiegraphes interface

Comment les produire ?

• manuellement à partir de GEPHI• automatiquement à partir de scripts/A.P.I.• le plus souvent, à partir de fichier Excel ou de CSV, d’où l’intérêt de Table2Net

Les structures de graphes : un moyen puissant de croiser des données

excel, ou autre tableur

Table 2 net Gephi Sigma Js ou autre plateforme

Une opération centrale : transformer des liste ou des tables de données en

structures de graphs

-4-

Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes

Accéder à Table2Net :http://webatlas.fr/table2net/

Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes :

1

2

3

4

Charger un fichier de type «CSV»

Sélectionner les options de construction d’un graphe

Télécharger le fichier au format GEXF

Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes

Accéder à Table2Net :http://webatlas.fr/table2net/

Charger un fichier de type «CSV»

Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes :

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Sélectionner les options de construction d’un graphe

Télécharger le fichier au format GEXF

Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes

Accéder à Table2Net :http://webatlas.fr/table2net/

Charger un fichier de type «CSV»

Sélectionner les options de construction d’un graphe

Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes :

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4 Télécharger le fichier au format GEXF

Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes

Accéder à Table2Net :http://webatlas.fr/table2net/

Charger un fichier de type «CSV»

Sélectionner les options de construction d’un graphe

Télécharger le fichier au format GEXF

Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes :

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Visualiser et mesurer les données

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composants(typologies et classifications)

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2

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5

Saillances(hiérarchies)

ORGANISATION(Géographies et complémentarités)

focus(localisation et contextualisation)

Spatialiser les données : les principaux algorithmes

Mode aléatoire

Vue circulaire

Fruchterman Reingold

Radias axis

OpenOrd

Force Atlas 2

Force Atlas 2 hierarchie(taille et degrés)

hierarchie(degrés colorés)

hierarchie(centralité)

Hiérarchiser et analyser les données

Couleurs(classes)

hierarchie(degrés, noeuds)

labels hierarchie(degrés, labels)

Grouper et hiérarchiser les données

Marguerite

ZephineFantine

MmeThenardier

Thenardier

Cosette

Javert

Fauchelevent

Perpetue

Simplice

Pontmercy

Boulatruelle

Eponine

Anzelma

Gillenormand

MlleGillenormandMmePontmercyMarius

Enjolras

CombeferreProuvaireCourfeyrac

BossuetJoly

Grantaire

Gueulemer

BabetClaquesous

Montparnasse

Brujon

MmeHucheloup

Marguerite

ZephineFantine

MmeThenardierThenardier

Cosette

JavertFauchelevent

Perpetue

Simplice

Pontmercy

Boulatruelle

EponineAnzelma

Gillenormand

MlleGillenormand

MmePontmercyMariusEnjolrasCombeferreProuvaireCourfeyracBossuet

JolyGrantaire

Gueulemer

BabetClaquesous

Montparnasse

Brujon

MmeHucheloup

Grouper et hiérarchiser les données

Les cinq collèges détection statistique des communcautés

les porteurs de projets (en rouge)

Variation des couleurs en fonction des partitions

sélection(zone)

nouvel espace de travail spacialisation(radiale)

Plusieurs espaces de travail

Projet VisIR, 2010pôle de compétitivité Images et Réseaux,

GeoLayout / Géo-référencement

Migrations des dossiers patients entre structures hospitalières à l’échelle des Etats-Unis (2011).

Le géo-référencement

Le géo-référencement

http://gephi.org/2010/map-geocoded-data-with-gephi/

Le géo-référencement

Time-line et structure de données

http://fr.slideshare.net/Eldarion/ic05-cours-4http://gexf.net/format/dynamics.html

Les métriquesTaille et couleur en fonction du score de PageRank

Filtrer les donnéesFiltrage en fonction du nombre de liens par noeud

Les exports (SVG, PNG, GEXF...)