OPDAGELSE → FORSTÅELSE → ANVENDELSE · (Meta)Genomik substratum 100 200 200 100 0 300 100 200...

Post on 21-Jun-2020

3 views 0 download

transcript

Forskningsprofil Mikrobiologi & Mikrobiel Økologi mikroorganismers rolle i naturen (inkl. bioteknologi og samspil med planter & dyr)

vi kender kun <1% af alle mikrober på jorden vi finder stadigvæk nye processer i jordens stofkredsløb

OPDAGELSE → FORSTÅELSE → ANVENDELSE

• Akvatisk Mikrobiel Økologi & Biogeokemi Marin sediment & den dybe biosfære N kredsløb, N2O produktion Iltsvindszoner

• Ekstreme miljøer – ”limits of life” skyer gletsjer life on Mars (exoplaneter)

• Symbioser mellem bakterier og invertebrater regnorme marine invertebrater (søpunge mm.)

• Anvendt Mikrobiologi biogas produktion spildevandsrensning biofilter biofilm off shore olieproduktion

bio-energetik (øko) fysiologi

(genom) evolution fylogeni

http://bios.medarbejdere.au.dk/fileadmin/bioscience/ Documents/2013/2013-03-07_Mikrobiologi_info_kandidatuddannelse.pdf

(Meta)Genomik

substratum

100

200

200

100

0

300

100 200 µM

µm

O2

NO3-

water

biofilm

mikrogradienter mikrobielle processer

Mikrobiel samfund fylogenetiske & funktionelle gener

in situ identifikation/imaging, biodiversitet

Biogeokemi

Aktivitet Mikromiljø

mikrokosmos-inkubationer radioisotoper

stabile isotoper

02468

101214161820

15NH

4

++

14NO

3

-nm

ol cm

-3

0

2

4

6

8

10

RF1

15NH

4

+ 29

N2

30

N2

0 1 2 3 4 5 6

0

20

40

60

80

100

12014

NH4

++

15NO

3

-

Time (hours)

Interaktioner konkurrence

symbiose biofilm

Geokemi

Anvendt mikrobiologi enzymer, biogas,

biofilter, olie, fødevareproduktion

dental biofilm

Dyrkning (øko)fysiologi

nye arter evolution

Arbejdsområder Mikrobiologi & Mikrobiel Økologi

nedbrydning af organisk stof

Arbejdsområder til dagligt på Mikrobiologi:

Arbejdsområder til dagligt på Mikrobiologi:

Data behandling, statistik, modellering, bioinformatik…

Hvilke fag anbefaler vi for at skrive speciale i mikrobiologi -1

Mikrobiologiske Fag Bachelor (mindst en af de 2 kurser som basis): • Mikrobiel Stofomsætning (Q2, 5 ECTS) • Mikrobiel Fysiologi og Identifikation (Q3+4, 10 ECTS) Kandidat: • Geomikrobiologi (Q1, 10 ECTS, NYT KURSUS) • Molekylær Mikrobiel Økologi (Q2, 5 ECTS) • Mikrobiel Fermentering & Bioteknologi (Q3, 5 ECTS) • Anvendt Mikrobiologi (Q4, 5 ECTS, NYT KURSUS)

Biologisk Projektarbejde (som bachelorprojekt eller under kandidatuddannelsen)

Andre Biologiske Fag (kandidat): • Biologisk-Fysisk Oceanografi (Q1, 5 ECTS) • Vandløbsøkologi (Q1+Q2, 10 ECTS) • Søers Økologi (Q3, 5 ECTS) • Modellering af Biologiske Processer (Q3, 5 ECTS)

Tilvalg: Generel egnet: Molekylærbiologi, Kemi, Datalogi (Bioinformatik), Jordbrugsvidenskab, evt. Geologi Specifikke kurser: • Genomer og Proteinstrukturer (Q2, 5 ECTS - BiRC) • Analyse af Genomdata (Q3, 5 ECTS - BiRC) • Medicinsk Mikrobiologi & Immunologi (Q3, 10 ECTS – Molekylærbiologi) • Eksperimentel belysning af samspillet mellem mikrober og deres værtsorganismer

(Q3, 5 ECTS – Molekylærbiologi) • Biofilm (Q4, 5 ECTS, NYT KURSUS fra 2014 – Nanoteknologi & Bioscience) • Det hydrogeokemiske kredsløb (Q1+Q2, 10 ECTS - Geoscience) • Næringsstofomsætning og miljøstyring (Q1+Q2, 10 ECTS, - Institut for Fødevarer) Særlige tilvalg: • M18 Biomasse til biobrændstoffer og energi (Q1+Q2, 10 ECTS – Ingeniørvidenskab)

Hvilke fag anbefaler vi for at skrive speciale i mikrobiologi -2

Karrieremuligheder for mikrobiologer Generel: • Biologisk rådgivning og R&D indenfor miljø, industri, og landbrug • Miljø- og bioteknologi • Miljø- og naturforvaltning • Hospitaler og medico-industri • Undervisning Census de sidste 10 år (ca. 40 kandidater): • 50% gik videre til PhD: => 2/3 private virksomheder, 1/3 academia

• konsulent- og rådgivningsvirksomheder (miljø, landbrug etc.): 7 • virksomhed, udvikling & produktion (Novo, Danisco, Arla etc. ): 3 • virksomhed, mikrobiel & molekylær analyseservice: 3 • gymnasielærer: 3 • lærer på laborantskolen: 2 • biolog ved kommunen: 1 • hospital, klinisk mikrobiel diagnostik: 1 • akademisk sekretær for PhD uddannelse: 1

Nuværende Projekter (et udsnit)

åbent lab i morgen 14:00 – 17:00: 1540 - 116

Brint omsætning i biogasanlæg

Kabelbakterier og elektriske

samfund