+ All Categories
Home > Documents > ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ...

ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ...

Date post: 06-Jun-2020
Category:
Upload: others
View: 13 times
Download: 0 times
Share this document with a friend
44
ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИ Б. АЛЬБЕРТС, Д. БРЕЙ, К. ХОПКИН, А. ДЖОНСОН, ДЖ. ЛЬЮИС, М. РЭФФ, К. РОБЕРТС, П. УОЛТЕР
Transcript
Page 1: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

ОСНОВЫМОЛЕКУЛЯРНОЙ

БИОЛОГИИКЛЕТКИ

Б. АЛЬБЕРТС, Д. БРЕЙ, К. ХОПКИН, А. ДЖОНСОН,

ДЖ. ЛЬЮИС, М. РЭФФ, К. РОБЕРТС, П. УОЛТЕР

Page 2: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙБИОЛОГИИ КЛЕТКИ

Page 3: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

third edition

ESSENTIALCELL BIOLOGY

B. Alberts, D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson,J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter

Page 4: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

МоскваБИНОМ. Лаборатория знаний

ОСНОВЫМОЛЕКУЛЯРНОЙ

БИОЛОГИИКЛЕТКИ

Б. Альбертс, Д. Брей, К. Хопкин, А. Джонсон,Дж. Льюис, М. Рэфф, К. Робертс, П. Уолтер

Перевод с английскогопод редакцией

канд. биол. наук С. М. Глаголеваи докт. биол. наук Д. В. Ребрикова

Page 5: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

УДК 577ББК 28.05

А56

Альбертс Б.

А56 Основы молекулярной биологии клетки / Б. Альбертс,Д. Брей, К. Хопкин и др. ; пер. с англ. —М. : БИНОМ. Ла-боратория знаний, 2015. — 768 с. : ил.

ISBN 978-5-9963-0542-1

Многим поколениям биологов знаком пятитомник Альбертса «Мо-лекулярная биология клетки», на русском языке впервые выпущенныйв 1987 г. С тех пор вышло пять его изданий, каждое из которых вмещалосамые последние достижения молекулярной биологии. Можно предполагать,что не в последнюю очередь именно увеличивающимся объемом книгиобусловлено решение авторов написать ее сокращенный вариант. В книгеподдержана традиция очень ясного и логичного изложения материала в видекрасочных, понятных схем и интересных иллюстраций с подробнымиподписями к ним.

Издание адресовано студентам младших курсов биологических и ме-дицинских специальностей, школьным учителям и преподавателям вузовпри подготовке лекций и семинаров, а также старшеклассникам, интере-сующимся предметом и изучающим его на профильном уровне.

УДК 577ББК 28.05

Учебное издание

Альбертс БрюсБрей Деннис

Хопкин Карен и др.

ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИ

Ведущий редактор канд. биол. наук В. В. Гейдебрехт. Редактор канд. биол. наук Т. В. Липина

Художник Н. А. Новак

Технический редактор Е. В. Денюкова

Компьютерная верстка: Т. Э. Внукова

Подписано в печать 12.03.15. Формат 60×90/8.

Усл. печ. л. 96,00. Тираж 1000 экз. Заказ

Издательство «БИНОМ. Лаборатория знаний»

125167, Москва, проезд Аэропорта, д. 3

Телефон: (499) 157-5272, e-mail: [email protected], http://www.Lbz.ru

ISBN 978-5-9963-0542-1

c© 2010 by Bruce Alberts, Dennis Bray,Karen Hopkin, Alexander Johnson, Julian Lewis,Martin Raff, Keith Roberts, and Peter WalterВсе права защищены.Авторизованный перевод англоязычногоиздания, опубликованного Garland Science,входящим в Taylor & Francis Group LLC.

c© БИНОМ. Лаборатория знаний, 2015

Page 6: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Глава 1 Общее представление о клетках 13Вкладка 1-1 Микроскопия 18–19

Вкладка 1-2 Строение клеток 35

Откуда мы знаем: главные свойства живого 39–41

Глава 2 Химический состав клеток 47Откуда мы знаем: что такое макромолекулы? 65–66

Вкладка 2-1 Химические связи и группы 70–71

Вкладка 2-2 Химические свойства воды 72–73

Вкладка 2-3 Некоторые типы сахаров 74–75

Вкладка 2-4 Жирные кислоты и другие липиды 76–77

Вкладка 2-5 Двадцать аминокислот, из которых состоят белки 78–79

Вкладка 2-6 Обзор нуклеотидов 80–81

Вкладка 2-7 Основные типы слабых нековалентных связей 82–83

Глава 3 Энергия, катализ и биосинтез 85Вкладка 3-1 Свободная энергия и биохимические реакции 96–97

Откуда мы знае м: использование кинетики для моделирования метаболических путейи манипуляций с ними 103–105

Глава 4 Структура и функции белков 117Вкладка 4-1 Функции белков 118–119

Вкладка 4-2 Четыре разных способа изображения небольшого белкового домена SH2 128–129

Вкладка 4-3 Создание и использование антител 140–141

Откуда мы знаем: анализ структуры белка 153–156

Вкладка 4-4 Разрушение клеток и первичное фракционирование клеточных экстрактов 160–161

Вкладка 4-5 Разделение белков методом хроматографии 162

Вкладка 4-6 Разделение белков с помощью электрофореза 163

Глава 5 ДНК и хромосомы 167Откуда мы знаем: гены сделаны из ДНК 169–172

Глава 6 ДНК: репликация, репарация и рекомбинация 191Откуда мы знаем: сущность репликации 193–196

Глава 7 От ДНК к белку: как клетки реализуют генетическую информацию 221Откуда мы знаем: как взломали генетический код 237–239

Краткое оглавлениеи особые разделы

Page 7: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

12 Основы молекулярной биологии клетки

Глава 8 Регуляция генной экспрессии 255Откуда мы знаем: регуляция гена — истории гена еve 266–268

Глава 9 Как эволюционируют гены и геномы 279Откуда мы знаем: как сосчитать гены 297–298

Глава 10 Анализ генов и геномов 305Откуда мы знаем: секвенирование генома человека 322–325

Глава 11 Строение мембраны 337Откуда мы знаем: измерение потоков мембран 354–355

Глава 12 Мембранный транспорт 359Откуда мы знаем: кальмар раскрывает секреты возбудимости мембраны 381–383

Глава 13 Как клетки получают энергию из пищи 391Вкладка 13-1 Стадии гликолиза 396–397

Откуда мы знаем: открытие цикла лимонной кислоты 403–405

Вкладка 13-2 Полный цикл лимонной кислоты 406–407

Глава 14 Производство энергии в митохондриях и хлоропластах 415Откуда мы знаем: хемиосмотическое сопряжение используется для синтеза АТФ 427–428

Вкладка 14-1 Редокс-потенциалы 430

Глава 15 Внутриклеточные компартменты и внутриклеточный транспорт 451Откуда мы знаем: отслеживание перемещений белков и транспорта везикул 471–472

Глава 16 Межклеточные взаимодействия 479Откуда мы знаем: распутывание сигнальных путей клетки 504–506

Глава 17 Цитоскелет 513Вкладка 17-1 Три типа белковых филаментов 514

Откуда мы знаем: погоня за моторными белками 527–529

Глава 18 Клеточный цикл 547Откуда мы знаем: открытие циклинов и Cdk 551–553

Вкладка 18-1 Основные стадии М-фазы в животной клетке 562–563

Глава 19 Генетика и пол 583Вкладка 19-1 Некоторые основные положения классической генетики 603

Откуда мы знаем: использование SNP как инструмента диагностики заболеваний человека 607–609

Глава 20 Многоклеточные сообщества: ткани, стволовые клетки и рак 615Откуда мы знаем: выявление генов, определяющих развитие онкологических заболеваний 646–648

Ответы 653

Словарь 719

Указатель терминов 751

Page 8: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Предисловие редактора перевода

Наверное, многие биологи моего поколения помнят, каким событием стало появление пятитомника «Молекулярная биология клетки», выпущенного издательством «Мир» в 1986–1987 гг. «Албертс» стоял на полке практически у каж-дого научного сотрудника, занимающегося биохимией и кле-точной биологией. Сам я в полной мере оценил эту книгу, когда в 1994 г. на русском языке вышло ее второе издание.

Первое издание книги было задумано в 1978 г. по иници-ативе Джеймса Уотсона (вошедшего в авторский коллектив) и вышло в свет на английском в 1982 г. Как отмечал один из основных авторов учебника — Брюс Албертс, в процессе его написания сами авторы узнали много нового о биологии клетки и стали лучше ее понимать.

С тех пор учебник стал одним из основных пособий для многих университетов по всему миру. Его достоинство — по-явление нового переработанного издания каждые пять лет. Авторы следят за всеми главными достижениями моле-кулярной биологии и стараются их учесть в своей работе. Оборотная сторона такого обновления — гигантский объем книги. Последнее (пятое) издание 2008 г. содержит около 1600 с., а на прилагаемом DVD размещены видео, анимации и дополнительная информация.

Четвертое издание книги доступно на английском в Интернете (это поможет тем, кто захочет подробнее ознако-миться с какими-нибудь разделами: книгу по частям можно просматривать на сайте NCBI, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21054/).

Одним из главных факторов, сподвигших авторов на на-писание сокращенного варианта — «Основ молекулярной биологии клетки», стал рост студенческой аудитории, заин-тересованной в изучении биомедицинских проблем в более широком биологическом контексте. Этот учебник рассчитан в основном на студентов-первокурсников, изучающих биоло-гию, вышел в свет в 1998 г. и выдержал три издания. Перевод третьего издания (2010) и предлагается вниманию читателей.

Учет современных достижений клеточной биологии — далеко не единственное достоинство учебника. Он очень ясно и логично написан. Одна из главных особенностей – четкое структурирование материала, разбитого на неболь-шие, удобные для восприятия порции. Книга снабжена красочными, понятными схемами и интересными иллю-страциями. На прилагаемом DVD собраны анимации, ви-деофрагменты и вопросы для самопроверки (английский язык для большинства студентов, надеюсь, перестал быть

барьером, так что они смогут воспользоваться английским текстом DVD).

Еще одна очень важная особенность книги — наличие подробных подписей к рисункам. Они занимают заметную часть объема текста и несут важнейшую смысловую нагруз-ку. Книга снабжена подробным предметным указателем и иллюстрированным словарем терминов; это позволяет бы-стро найти и понять все используемые в книге биологиче-ские термины и понятия. Вопросы по тексту и в конце глав, как отмечают и сами авторы, заставляют задумываться над прочитанным и позволяют проверить себя. Разделы «Откуда мы знаем» посвящены тому, как биологические эксперимен-ты позволяют решить сложные проблемы и как они влияют на возникновение новых идей. На специальных вкладках в оптимальной для усвоения форме даются некоторые ключе-вые сведения о клетке.

Очень важно, что книга эта доступна для любого человека, освоившего школьный курс биологии. Все необходимые све-дения из области химии, выходящие за рамки школьной про-граммы, вводятся в самом учебнике (в основном — в гл. 2).

Надеюсь, благодаря всем этим достоинствам книга ока-жется полезной для широкого круга читателей. Это прежде всего студенты младших курсов биологических и медицин-ских специальностей. Думаю, что и преподавателям вузов она окажет помощь при подготовке лекций и семинаров. Кроме того, книгу могут использовать школьные учителя биологии и старшеклассники, интересующиеся предметом и изучаю-щие его на профильном уровне.

Основную часть текста перевели канд. биол. наук С. М. Гла-голев (гл. 1, 11, 12, 15–20, «Ответы», «Словарь терминов») и канд. биол. наук Н. Ю. Усман (гл. 2–4). Кроме того, в работе над переводом приняли участие канд. биол. наук Д. А. Кнорре и старший преподаватель кафедры физиологии растений био-фака МГУ Е. С. Глаголева (гл. 7), канд. биол. наук Г. А. Базы-кин (гл. 9), научный сотрудник кафедры эмбриологии биофа-ка МГУ Н. С. Глаголева (гл. 8), канд. биол. наук П. А. Волкова (гл. 5), аспирант кафедры биохимии биофака МГУ Ю. С. Бы-ков (гл. 6) и студент 3-го курса кафедры молекулярной био-логии биофака МГУ И. М. Флямер (гл. 10, 13 и 14). В переводе нескольких глав техническую помощь оказали А. Иванова и А. Кириченко, в подготовке подписей к рисункам и оглавле-ния — канд. биол. наук Е. А. Мусаткина. Всем им редактор ис-кренне признателен за участие в проекте.

С. М. Глаголев, 2014

Page 9: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

В нашем мире вряд ли можно найти более удивительное явление, чем живая клетка. Крошечная, хрупкая, неверо-ятно сложная, постоянно самообновляющаяся, она, тем не менее, сохраняет в своей ДНК информацию, существу-ющую более 3 млрд лет — со времен, когда наша планета едва остыла после формирования Солнечной системы из раскаленной материи. Постоянно перестраиваясь и стано-вясь более разнообразными в ходе эволюции, клетки, тем не менее, сохраняют сложный самореплицирующийся хи-мический механизм. Этот механизм, общий для всех жи-вых организмов на Земле, непрерывно воспроизводится — в каждом животном, листе растения, бактерии в ломтике сыра, клетке дрожжей в кружке пива.

Не только простое любопытство должно заставлять нас изучать биологию клетки. Имеются и важные прак-тические соображения, по которым клеточная биология должна быть частью общего образования. Мы состоим из клеток, мы питаемся ими, и наш мир создан пригодным для обитания клетки. Мы должны знать клеточную био-логию, чтобы понимать работу собственного организма, обеспечивать себя пищей и сохранять находящиеся под угрозой разрушения экосистемы. Углублять знания и ис-кать пути их использования — это задачи ученых. Но каж-дый человек должен понимать устройство современного мира — от проблем охраны здоровья до общественной зна-чимости изменений окружающей среды, биомедицинских технологий, развития сельского хозяйства или эпидемий инфекционных заболеваний.

Клеточная биология — обширный раздел, связанный практически со всеми другими областями науки. Поэто-му изучение биологии клетки столь важно для научного образования. Однако здесь легко закопаться в деталях, увлечься обилием информации и специальной терми-нологии. Поэтому в данной книге мы постарались обе-спечить удобный — понятный и увлекательный — обзор главных принципов клеточной биологии. Мы постара-лись объяснить принцип работы живой клетки так, что-бы это стало понятно даже читателю, который впервые знакомится с современной биологией, и показать, как мо-лекулы живых клеток — в первую очередь белки, ДНК и РНК — взаимодействуют, образуя эту замечательную си-стему живого организма, способную питаться, отвечать на раздражители, двигаться, расти и делиться, самовос-производясь в ряду поколений.

Потребность в кратком изложении основ клеточной биологии стала ясна для нас во время написания пособия «Молекулярная биология клетки» (Molecular Biology of the Cell, MBoC), выдержавшего уже пять изданий. MBoC — объемная книга, предназначенная для продвинутых сту-дентов младших курсов и старшекурсников, изучающих биологию или медицину. Для многих студентов и специ-алистов других профессий MBoC может оказаться излиш-не подробной. «Основы молекулярной биологии клетки» (ОМБК), напротив, посвящены фундаментальным поло-жениям клеточной биологии, которые потребуются каж-дому для понимания биомедицинских и более широких биологических проблем, влияющих на нашу жизнь. В на-стоящем, третьем, издании ОМБК мы дополнили каж-дую часть современными научными данными, включили новый материал о структуре хромосом, эпигенетическом наследовании, роли микроРНК и РНК-интерференции, контроле качества белков, взаимном опознавании клеток, генетической изменчивости, стволовых клетках и пер-спективах их медицинского использования, успехах те-рапии онкологических заболеваний, эволюции геномов и по многим другим темам. Мы расширили обсуждение во-просов энергетики клетки и термодинамики, объединили в одной главе рассмотрение клеточного цикла и деления клетки и обновили разделы «Откуда мы знаем», показы-вающие, как биологические эксперименты помогают ре-шать научные проблемы и порождают новые идеи. Как и в предыдущих изданиях, в иллюстрациях в ОМБК под-черкнуты принципиальные моменты и опущены несуще-ственные детали. Ключевые термины, вводимые в каждой главе, объясняются при первом упоминании и собраны в конце книги в большой, частично иллюстрированный сло-варь терминов. Список литературы для дополнительного чтения не приводится: желающие изучить предмет более глубоко могут обратиться к спискам рекомендуемой лите-ратуры из 5-го издания MBoC или найти обзоры современ-ных источников с помощью одной из поисковых систем, например Pubmed (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) или Google Scholar (http://scholar.google.com).

Ключевая особенность этой книги — многочислен-ные вопросы, размещенные в тексте и в конце каждой главы. Они должны побуждать студентов задумываться о прочитанном и делать паузы в чтении, проверяя пони-мание текста. Многие вопросы ставят студентов перед

Предисловие авторов

Page 10: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Предисловие авторов 7

необходимостью помещать свежую информацию в более широкий биологический контекст, некоторые имеют бо-лее одного правильного ответа. При ответе на часть во-просов предполагается выдвижение и обсуждение гипо-тез. Ответы на все вопросы даны в конце книги, во мно-гих случаях они содержат комментарии или дополнения к основному тексту.

Тем, кто хочет более активно получать знания по кле-точной биологии и глубже понять то, как клеточные био-логи делают выводы на основе экспериментов, мы реко-мендуем задачник Molecular Biology of the Cell, 5th edition: A Problem Approach (авторы — John Wilson и Tim Hunt). Этот задачник написан как приложение к MBoC, но содер-жит вопросы всех уровней сложности и может служить для студентов и преподавателей полезным источником за-даний, требующих размышления. При написании ОМБК некоторые вопросы мы заимствовали оттуда, за что очень признательны его авторам.

Взрывное развитие новых технологий визуализа-ции, в том числе компьютерных, дает захватывающие возможности изображения процессов, происходящих внутри живой клетки. Зрелищность некоторых из этих достижений мы попытались показать в отредактирован-

ной и расширенной версии видеоматериалов Essential Cell Biology Interactive (прилагается к каждому экзем-пляру книги на DVD-ROM). Он содержит более 130 ви-деофрагментов, анимаций, моделей строения молекул и микрофотографий, дополняющих материал конкретных глав книги. Невозможно наблюдать за ползающими, де-лящимися и распределяющимися хромосомами, пере-страивающими свою форму клетками без восхищения перед молекулярными механизмами, обеспечивающи-ми эти процессы. Глядя на анимацию удвоения ДНК, испытываешь живое ощущение чуда, которое открывает наука при исследовании обыденных явлений. Мы на-деемся, что видеоматериалы заинтересуют студентов и мотивируют осваивать основные концепции, изложен-ные в тексте, сделав изучение биологии клетки легче и увлекательнее.

Как и в MBoC, каждая глава в ОМБК — результат со-вместной работы авторов. Кроме того, нам помогали многие другие люди; их вклад упомянут в разделе «Благодарно-сти». Несмотря на все наши старания, в книге могут встре-титься ошибки. Мы просим заметивших эти ошибки чита-телей сообщить нам о них по адресу [email protected]для исправления их в следующем издании.

Page 11: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Благодарности

Авторы благодарны многим преподавателям и студентам из разных стран мира за их вклад в создание третьего изда-ния ОМБК. Особенно мы благодарны студентам, участво-вавшим в апробации работы: они обеспечивали необходи-мую обратную связь при использовании книги и DVD, и многие их предложения были учтены при подготовке по-собия к печати.

Мы благодарим преподавателей, организовавших в своих учебных заведениях группы для апробации посо-бия, — Криса Брандла из Университета Западного Онта-рио, Дэвида Л. Гарда из Университета штата Юта, Жюли Спенсер из Университета Сан-Франциско, Кэрен Уиткин и Линду Хуан из Массачусетского университета в Босто-не. Мы очень признательны им за дружескую поддержку.

Мы также получили детальные отчеты от преподава-телей, использовавших второе издание. Это Маргарида Амарал (Лиссабонский университет), Линн Арнсон (Аме-риканский университет), Карл Ауфдерхейд (Техасский A&M университет), Дэвид К. Бэнфилд (Гонконгский уни-верситет науки и технологии), Стефен Ф. Барон (Бриджу-отерский колледж), Дебора Билсен (Университет штата Иллинойс в Урбана-Шампани), Барбара Д. Бойан (Техно-логический университет штата Джорджия), Крис Брандл (Университет Западного Онтарио), Кейт Браун (Бристоль-ский университет), Джейн Брюнер (Университет штата Калифония-Станислаус), Патрик Брайан (Медлэссекский комьюнити-колледж), Шарон К. Балок (Виргинский ком-мэнвелф-университет), Майк Клеменс (Медицинская школа госпиталя Святого Георгия, Лондонский универси-тет), Энн Кордон (Торонтский университет в Миссасуге). Эндрю Делби (Университет Эксетера), Дэн Эшел (Бру-клинский колледж), Николас Форрас (Кингстонский уни-верситет), Дэвид Л. Гард (Университет штата Юта), Марк Граймс (Университет штата Монтана), Холи Гейл-Донзи (Университет штата Луизиана), Линн Ханнум (Колби кол-ледж), Нэвил Л. Хасан (Университет Бирзейта), Жаннетт М. Луш (Университет штата Арканзас), Чарльз Мэллери (Университет Майами), Кэти Мартин-Трой (Центральный университет штата Коннектикут), Гордон Т.А. МакИвен (Институт медицинских наук, Абердинский университет), Жерар МакНейл (Йорк колледж, университет города Нью-Йорк), Роджер В. Мелволд (Университет Северной Дако-ты, школа медицинских наук), Кристина Мурга (Автоном-ный Мадридский университет), Е. Пейдж Овен, эсквайр

(Коннектикутский колледж), Мартин Рамсби (Йоркский университет), Эстер Зигфрид (Питтсбургский универ-ситет в Джонстауне), Роджер Д. Слобода (Дартмудский колледж), Джулио Сото (Универитет штата Сан-Хосе), Джульетт Спенсер (Университет Сан-Франциско), Пауль Х. Томашек (Университет штата Калифорния в Нортрид-же), Гэри Уэссел (Университет Брауна), Эстер Ф. Уиллер (Техасский технологический университет), Керен Уиткин (Массачусетский университет, Бостор). Мы рады поблаго-дарить их за проделанную работу.

Особая благодарность Дэвиду Моргану за его помощь в переработке главы о делении клетки, а также всем чита-телям, указавшим нам на найденные ими в предыдущих изданиях ошибки.

Многие сотрудники издательства Garland Science внесли свой вклад в создание этой книги и сделали приятным наш труд над ней. Прежде всего, особую признательность мы вы-ражаем Михаэлю Моралесу, нашему редактору. Он координи-ровал все предприятие: организовал начальное рецензирова-ние, тестовые группы для апробации, работал с авторами над их главами, умело и красиво выполнил основную работу по оформлению, компоновке и выпуску ОМБК. Сигрид Мессон руководила издательским процессом при выпуске книги, вы-верила весь текст и наблюдала за созданием банка вопросов. Кейт Геззи и Моника Толедо были помощниками редактора. Найгел Орме проработал исходные иллюстрации, созданные одним из авторов, Кейт Робертс, и перерисовал их с помощью компьютерной графики, а в некоторых случаях — вручную. Мэтт МакКлеменс создал графический дизайн книги и DVD. Эмма Лефкокк сделала блестящую верстку книги, аккуратно внося наши бесконечные правки. Элеонора Лоуренс и Шер-ри Грэнем осуществили литературное редактирование глав, сгладив многие шероховатости, а Элеонора не только прочи-тала книгу от начала до конца, проверяя ясность и единство изложения, но также внесла дополнения в словарь терминов. Адам Сендрофф и Люси Броди собрали отзывы пользовате-лей пособия и представили книгу широкой публике. Денис Шенк, заместитель директора Garland Science, управляла всей этой работой с огромным тактом и дипломатическим искусством. Мы искренне благодарны всем, кто упомянут в этом длинном списке.

Наконец (но не в последнюю очередь!) мы благодар-ны, конечно же, нашим семьям, нашим коллегам и тем, кто заботился о наших детях, за их поддержку и терпение.

Page 12: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Иллюстрации к третьему изданию«Основ молекулярной биологии клетки»

Иллюстрации к книге доступны в двух удобных фор-матах — Powerpoint и JPEG. Эти рисунки есть на при-лагаемом к книге DVD и могут быть загружены с сайта Classwire TM. На Classwire отдельные файлы JPEG можно найти по номеру рисунка, его названию или ключевым словам из подписи к нему.

DVD-ROM

К каждому экземпляру книги прилагается DVD-ROM со следующими ресурсами для преподавателей и студентов:

Интерактивные «Основы молекулярной биологии клетки»(Essential Cell Biology Interactive)Медиаплеер содержит более 130 видеофрагментов (ани-маций, видеофильмов и видеосхем молекулярных про-цессов), тесты для самопроверки к каждой главе и про-грамму для изучения строения клетки по фотоснимкам высокого разрешения. Ссылки на видеофрагменты даны в тексте учебника; они выделены красным цветом (напри-мер, ВИДЕО 1.1). Если вы вводите номер видеофрагмента в поисковое окно видеоплеера, автоматически запускает-ся данный фрагмент. Этот способ поиска, предложенный студентами, позволяет активнее использовать видео в ходе обучения.

Вопросы для самопроверки (Student Self-Quizzes)Наличие этого ресурса — нововведение третьего англий-ского издания. Он позволяет студентам проверить базовое усвоение материала каждой главы. Выход на него осущест-вляется через Essential Cell Biology Interactive медиаплеер.

Иллюстрации к третьему изданию«Основ молекулярной биологии клетки»Архив фолдеров содержит все рисунки из книги в виде файлов JPEG и PowerPoint (см. выше).

База данных видеофрагментовЭтот архив содержит все видеофрагменты медиаплеера Essential Cell Biology Interactive в трех удобных для ис-

пользования форматах: WMV, QuickTime и iPod. Вер-сия WMV подходит для импорта видео в PowerPoint для Windows. Версия QuickTime позволяет импортиро-вать видео в PowerPoint для Macintosh. Наконец, iPod-версия предназначена специально для использования в iPod и iTune.

Оглавление DVDСодержание DVD дано в PDF-формате и включает также текст звукового сопровождения всех видеофрагментов.

Иллюстрированноекраткое содержание лекций

Заголовки разделов, основные концепции и рисунки из текста книги скомбинированы в виде презентаций Pow-erPoint. Они будут полезны для преподавателей, гото-вящих презентации лекций своего учебного курса. Как и все наши PowerPoint-презентации, резюме лекций можно адаптировать к требованиям пользователя. Например, их можно комбинировать с видеофрагментами из DVD-ROM или с вопросами из текста книги либо «Банка заданий», чтобы создать свои собственные лекции, облегчающие ин-терактивное обучение в классе. Этот ресурс доступен на Classwire.

Банк заданий

Банк заданий, созданный Линдой Хуанг (Linda Huang), Массачусетский университет, Бостон, и Черил Воган (Cheryl D. Vaughan), Гарвардский университет, факультет непрерывного образования, в этом издании отредактиро-ван и расширен. Он содержит задания разных типов — с множественным выбором, заполнением пропусков, вы-бором «верно–неверно», установлением соответствий и причинно-следственных связей, а также сложные вопро-сы «на соображение». На каждую главу приходится при-мерно по 50–60 вопросов; значительное число вопросов с множественным выбором удобно использовать при на-личии у учеников персональных компьютеров. Создавая Банк заданий, авторы основывались на представлении, что хороший экзамен должен не только проверять способ-

Ресурсы для студентови преподавателей

Page 13: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

10 Основы молекулярной биологии клетки

ность ученика запоминать информацию: он должен так-же требовать ее осмысления и обобщения, осмысленного владения ею. Набор заданий можно использовать либо не-посредственно, либо как образец для создания преподава-телем своих собственных контрольных тестов. Получить Банк заданий преподаватель может по запросу (электрон-ная почта: [email protected]).

Изучая живую клетку (DVD-видео)

Этот уникальный DVD, созданный Кристианом Сарде (Christian Sardet), Centre National de la Recherche Scienti-fique (CNRS) под руководством Вероники Кляйнер (Vero-nique Kleiner), позволяет нам совершить путешествие вну-три основной единицы жизни: живой клетки. Используя как первые рисунки клеток, так и захватывающие своей красотой изображения, полученные с помощью современ-ных микроскопов, известные биологи и молодые ученые

объясняют суть своих исследований и делятся своими от-крытиями. Рассказывается о том, как клетки были откры-ты, как они работают, как от этого зависит здоровье и за-болевания, и что сулят нам будущие успехи в их изучении.

ClasswireTM

Система для создания курсов Classwire (www.class-wire.com/garlandscience) позволяет преподавателям с легкостью создавать веб-сайты для своих курсов. Она также служит онлайн-архивом для учебных ресурсов. После регистрации на Classwire вы сможете загружать все рисунки из книги и все видеофрагменты с DVD. На Classwire доступны также ресурсы для преподавания по другим учебникам, изданным Garland Science. Свя-житесь с [email protected], чтобы получить информа-цию о доступе к Classwire (ClasswireTM — торговая марка Chalkfree, Inc.).

Page 14: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Общее представлениео клетках

ЕДИНСТВО И МНОГООБРАЗИЕ КЛЕТОК

КЛЕТКИ ПОД МИКРОСКОПОМ

ПРОКАРИОТИЧЕСКАЯ КЛЕТКА

ЭУКАРИОТИЧЕСКАЯ КЛЕТКА

МОДЕЛЬНЫЕ ОРГАНИЗМЫ

Что означает быть живым? Люди, петунии, тина из пру-да — все они живые; камни, песок и летний ветерок — не-живые. Но каковы же фундаментальные свойства, харак-теризующие живые объекты и составляющие их отличия от неживой материи?

Ответ базируется на том основном факте, который в наши дни кажется биологам очевидным, но представлял собой революцию в научном мышлении 170 лет тому на-зад, когда он был установлен. Все живые организмы со-стоят из клеток (cells) — мелких, окруженных мембраной единиц, заполненных концентрированным водным рас-твором различных веществ и наделенных удивительной способностью создавать собственные копии путем роста и деления надвое. Простейшие формы жизни — это оди-ночные клетки. Высшие организмы, включая нас с вами, — сообщества клеток, возникающие путем роста и деления единственной исходной клетки. Каждое животное, расте-ние или гриб — совокупность большого числа отдельных клеток, выполняющих специализированные функции и координируемых сложной системой взаимодействий.

Таким образом, клетки — фундаментальные едини-цы живого, и поэтому именно клеточная биология (cell biology) должна дать ответ на вопрос о том, что такое жизнь и как функционируют живые системы. Достигнув более глубокого понимания строения, работы, поведения и эволюции клеток, мы сможем более энергично взяться

за решение огромной исторической проблемы существо-вания жизни на Земле: ее загадочного происхождения, причины ошеломляющего разнообразия и освоения ею всех подходящих местообитаний. В то же время клеточная биология может дать нам ответы на вопросы, касающиеся нас самих: как появился наш вид? Как мы развиваемся из единственной оплодотворенной яйцеклетки? Чем каждый из нас отличается от любого другого человека на Земле? Почему мы болеем, стареем и умираем?

Эту главу мы начнем с рассмотрения огромного раз-нообразия форм, свойственного клеткам, а затем оки-нем взглядом химические механизмы функционирова-ния, общие для всех клеток. Затем мы разберемся, как клетки изучают с помощью микроскопа и что мы можем увидеть, когда заглядываем внутрь клетки. Наконец, мы узнаем, как можно устанавливать сходство между живыми созданиями, проводя сравнительное изучение всех форм жизни на Земле, — от самой крошечной бак-терии до могучего дуба.

ЕДИНСТВО И МНОГООБРАЗИЕ КЛЕТОК

Клеточные биологи часто говорят «клетка» без указания на какой-то конкретный вид. Но не все клетки одинаковы: на самом деле они могут очень сильно различаться. Установ-лено, что на Земле существует не менее 10 млн — возможно, 100 млн — видов живых существ.

Перед более глубоким погружением в биологию клет-ки нам нужно оценить, в чем сходство клеток бактерии и бабочки, розы и дельфина и чем они различаются?

Клетки очень разнообразны по форме и функциям

Начнем с размеров. Бактериальная клетка, например, клет-ка Lactobacillus в ломтике сыра, имеет длину в несколько

Общее представлениео клетках 1

Page 15: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

14 ГЛАВА 1. Общее представление о клетках

микрометров, или мкм (micrometers, μm). [1мкм (микро-метр, или микрон) = 1/1000 мм (см. рис. 1-6, с. 21. — Прим. перев.] Это примерно в 25 раз меньше, чем толщина челове-ческого волоса. Икринка лягушки — а это тоже одна клет-ка — имеет диаметр около 1 мм. Если клетку Lactobacillus увеличить до размеров человека, увеличенная во столько же раз яйцеклетка лягушки достигнет высоты в километр!

Столь же сильно клетки различаются по форме и функциям. Рассмотрим галерею клеток, изображенных на РИС. 1-1.

Типичная нервная клетка в вашем мозге очень развет-вленная; она посылает электрические сигналы по длин-ному тонкому отростку, длина которого может в 10 000 раз превышать толщину. От других клеток она получает сигналы через многочисленные более короткие отростки, отходящие от ее тела, как ветви дерева. Paramecium — од-ноклеточная инфузория из капли прудовой воды — напо-минает по форме подводную лодку и покрыта тысячами волосовидных выростов — ресничек (cilia). Их волноо-бразные биения продвигают клетку вперед, при этом она вращается вокруг длинной оси. Клетки покровов расте-ния — плоские, неподвижные призмы, окружающие себя прочным ящиком из целлюлозы с наружной поверхно-стью, покрытой водонепроницаемым слоем воска. Бак-терия Bdellovibrio — сосисковидная торпеда, движимая прикрепленным к ее заднему концу вращающимся, похо-жим на штопор и действующим как пропеллер жгутиком (flagellum). Нейтрофилы или макрофаги в теле животного пробираются сквозь ткани, постоянно меняя форму и по-глощая мертвые и умирающие клетки, чужеродные ми-кроорганизмы и другие частицы.

Одни клетки окружены только тонкой, непрочной мем-браной; другие усиливают эту нежную оболочку, заключая себя в наружный слой слизи, строя прочную клеточную стенку (cell wall) или окружая себя жестким, минерализо-ванным материалом, как, например, в костной ткани.

Клетки также необычайно разнообразны по своим по-требностям в химических веществах и по типам активно-сти. Некоторым для жизни требуется кислород, для дру-гих он смертельно ядовит. Некоторым нужны всего лишь воздух и вода в качестве исходных материалов для роста да солнечный свет; для других необходима сложная смесь молекул, производимых другими клетками. Одни клетки кажутся специализированными фабриками по производ-ству определенных веществ — гормонов, крахмала, жира, латекса или пигментов. Другие клетки, например мышеч-ные, — это двигатели, сжигающие горючее для выполне-ния механической работы. Есть клетки — электрические генераторы, например видоизмененные мышечные клетки электрического угря.

Некоторые специализированные клетки так сильно видоизменяются, что утрачивают способность оставлять потомство. Такая специализация была бы бессмысленной для клеток, ведущих одиночный образ жизни. Однако в многоклеточном организме между клетками существует разделение труда. Поэтому отдельные клетки могут ста-новиться узкоспециализированными и выполнять только строго определенные задачи, что делает их во многих от-

РИС. 1-1. Клетки имеют разнообразные размеры и форму.(А) Нервная клетка из мозжечка (часть мозга, контролирующая дви-жение). Эта клетка образует огромное ветвящееся дерево отростков, через которые она получает сигналы примерно от 100 000 других нерв-ных клеток. (Б) Инфузория-туфелька, Paramecium. Этот протист — единственная гигантская клетка, плавает с помощью биения ресничек, покрывающих его поверхность. (В) Срез молодого стебля растения, на котором целлюлоза окрашена в красный цвет, а другой компонент клеточной стенки, пектин, — в оранжевый. Внешний слой клеток на-ходится у верхнего края фото. (Г) Мелкая бактерия, Bdellovibrio bac-teriovorus, использующая для движения единственный терминальный жгутик. Она атакует, убивает и поедает других, более крупных бакте-рий. (Д) Белая клетка крови человека (нейтрофил), заглатывающая красную кровяную клетку. (А — с разрешения Constantino Sotello; Б — с разрешения Anne Fleury, Michel Laurent и Andre Aboutte; Г — с разре-шения Murry Stein; Д — с разрешения Stephen E. Malawista и Anne de Boisfleury Chevance.)

Page 16: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Единство и многообразие клеток 15

ношениях зависимыми от окружающих клеток. Даже наи-более фундаментальная задача из всех — передача генети-ческих инструкций следующему поколению — у многих многоклеточных возлагается на специалистов: яйцеклет-ки и сперматозоиды.

Все клетки схожи по химическому составу

Несмотря на необычайное разнообразие растений и жи-вотных, люди еще в незапамятные времена поняли, что у всех этих организмов есть нечто общее, что позволяет объединить их под названием живых существ. С началом использования микроскопа стало ясно, что животные и растения состоят из клеток, что существуют также одно-клеточные организмы. Выяснилось также, что отдельные клетки являются живыми, поскольку могут расти, размно-жаться, превращать энергию из одних форм в другие, кон-тролировать свое внутреннее состояние, отвечать на изме-нения среды и так далее, т. е. обладают всеми основными свойствами живого. И хотя опознать живой организм ка-жется достаточно легкой задачей, оказалось чрезвычайно трудно определить, в каких аспектах все живые организ-мы схожи. В учебниках определения жизни ограничива-ются абстрактными общими терминами, касающимися в основном роста и размножения.

Открытия, сделанные в биохимии и молекулярной биологии, ликвидировали эту проблему весьма эффект-ным образом. Хотя все живые организмы удивительно раз-нообразны по внешнему облику, все они столь же сходны по внутреннему содержимому. Сейчас мы знаем, что все клетки поразительно похожи друг на друга по своему хи-мическому составу. Они обладают одинаковыми химиче-скими механизмами для выполнения всех основных функ-ций. Все клетки состоят из одних и тех же видов молекул, которые участвуют в одних и тех же типах химических

реакций (см. гл. 2). У всех живых организмов носители генетических инструкций — гены (genes) — представлены молекулами ДНК и информация в них записана с помо-щью универсального химического кода. Этот код состоит из последовательности химических блоков, одинаковых у всех организмов, «читается» практически идентичными химическими устройствами и удваивается одинаковым способом, что позволяет живым организмам размножать-ся. В любой клетке длинные полимерные цепочки ДНК (DNA) состоят из одного и того же набора четырех моно-меров — нуклеотидов (nucleotides), соединенных в разной последовательности. Они играют роль букв алфавита, из которых создаются слова, несущие разную информацию. В любой клетке инструкции, содержащиеся в ДНК, пере-носятся, или транскрибируются (transcribed), на множе-ство сходных с ДНК полимерных молекул РНК (RNA) (РИС. 1-2).

Молекулы РНК выполняют различные функции, но главный их тип — это матричные, или информацион-ные РНК (мРНК, или иРНК) (messenger RNA, mRNA). Информация, содержащаяся в этих молекулах, транс-лируется (translated) в еще один тип полимеров — белки (proteins).

Белковые молекулы управляют поведением клеток. Из них состоит большинство внутриклеточных струк-тур, они выполняют функцию катализаторов, молекуляр-ных моторов и др. Белки синтезируются из аминокислот (amino acids), и все живые организмы используют для синтеза белков набор из одних и тех же 20 аминокислот. Но аминокислоты соединяются в разной последователь-ности, что придает каждому типу белковых молекул свою трехмерную форму, или конформацию (conformation) (как из разных сочетаний одних и тех же букв составляются

РИС. 1-2. Во всех клетках информация передается от ДНК к РНК (транскрипция), а от РНК — к белкам (трансляция). Вместе эти про-цессы называют экспрессией генов.

ВОПРОС 1-1

?«Живое» легко распознать, но трудно определить. В словаре дано такое определение: «Состояние или качество, отлича-ющее живые создания (организмы) от мертвых и от неживой

материи, характеризуемое главным образом обменом веществ, ро-стом и способностью размножаться и отвечать на раздражители.» Учебники биологии дают обычно несколько более детальное опре-деление; например, в одном из известных учебников приводится такой текст:Живые организмы1. Имеют более сложную структуру, чем неживые объекты есте-

ственного происхождения.2. Осуществляют гомеостаз, поддерживая относительное постоян-

ство внутренней среды.3. Воспроизводят себе подобных.4. Растут и развиваются, усложняясь в ходе развития.5. Получают из окружающей среды и трансформируют энергию и

вещества.6. Отвечают на раздражители.7. Приспосабливаются к среде обитания.

Какими из этих характеристик обладаете вы сами, пылесос и томат?

Page 17: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

16 ГЛАВА 1. Общее представление о клетках

разные слова). Таким образом, базовые общие биохимиче-ские механизмы служат для создания целой гаммы живых организмов (РИС. 1-3).

Более детальному рассмотрению структуры и функ-ций белков, РНК и ДНК посвящены гл. 4–8.

Если клетка — элементарная единица живого, то ни одна из ее более мелких составных частей не является в полном смысле слова живой. Например, вирусы пред-ставляют собой структуру с компактно упакованной ге-нетической информацией (в виде ДНК или РНК), обыч-но окруженную белковой оболочкой. Но они не способ-ны размножаться самостоятельно. Вирусы паразитируют внутри клеток и используют для своего размножения клеточные механизмы воспроизводства. Таким образом, вирусы — это «химические зомби»: они инертны и не проявляют жизнедеятельности вне клетки-хозяина, хотя осуществляют пагубный контроль над клеткой, когда проникают в нее.

Все клетки современных организмов, видимо, про-изошли от одной предковой клетки

Клетки размножаются с помощью удвоения ДНК и после-дующего деления надвое, передавая копию генетической информации, содержащейся в ДНК, каждой из дочерних клеток. Поэтому дочерние клетки похожи на материн-скую. Однако копирование ДНК не всегда происходит точно, и генетическая информация время от времени ме-

няется из-за мутаций (mutations). Вот почему дочерние клетки не всегда генетически идентичны материнской.

Мутации могут быть вредными (в том смысле, что их носители хуже выживают и размножаются в данных условиях), полезными (их носители лучше выживают и размножаются) и нейтральными (они не влияют на раз-множение и жизнеспособность). В ходе борьбы за суще-ствование носители вредных мутаций исчезают, носители полезных получают преимущество, а носители нейтраль-ных могут выживать. Следующему поколению переда-ются гены выживших особей. Время от времени картина наследования признаков потомством может усложнять-ся из-за полового размножения, при котором две клетки разных особей одного вида сливаются, объединяя свои ДНК. Затем генетические карты тасуются, сдаются заново и распределяются в новых комбинациях между особями следующего поколения, чтобы снова пройти испытание в борьбе за существование.

Эти простые принципы генетических изменений и отбора, действующие на протяжении миллиардов клеточ-ных поколений, лежат в основе эволюции — процесса, в ходе которого виды живых существ постепенно изменяют-ся и приспосабливаются к среде обитания все более изо-щренными способами. Эволюция дает неожиданное, но вполне убедительное объяснение того, почему современ-ные клетки так похожи по своему химическому составу и принципам работы: все они унаследовали свои генети-ческие инструкции от одного общего предка. Установле-но, что эта предковая клетка существовала около 3,5–3,8 млрд лет назад, и предполагается, что в ней уже проходили основные биохимические процессы, которые ныне харак-терны для всего живого на Земле. Благодаря мутациям ее потомки постепенно приобретали различия — дивергиро-вали, освоив все подходящие места обитания и используя универсальные механизмы жизнедеятельности бесконеч-но разнообразными способами.

Гены обеспечивают инструкции, определяющие фор-му, функции и сложное поведение клеток

Геном (genome) клетки — вся совокупность генетической информации, заключенной в ее ДНК, — представляет со-бой генетическую программу, в соответствии с которой клетка функционирует у животных или растений, — про-грамму развития целого организма с сотнями разновид-ностей клеток. У одной особи животного или у растения эти клетки могут быть чрезвычайно вариабельными (см. гл. 20). Клетки жировой ткани, кожи, костной и нервной тканей кажутся такими непохожими, какими только могут

РИС. 1-3. Все живые организмы состоят из клеток. Колония бакте-рий, бабочка, роза и дельфин состоят из клеток, сходных по химическо-му составу и общим принципам работы. (А — с разрешения Tony Brain и Science Photo Library; В — с разрешения John Innes Foundadtion; Г —с разрешения Jonathan Gordon (FAW).)

ВОПРОС 1-2

?Мутации — ошибки в ДНК, изменяющие генетическую про-грамму предшествующих поколений. Представьте себеобувную фабрику. Можно ли ожидать, что из-за ошибок (то

есть непреднамеренных изменений) в производстве определен-ного сорта обуви произойдет ее усовершенствование? Свой от-вет обоснуйте.

Page 18: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Клетки под микроскопом 17

быть клетки. Тем не менее все эти дифференцированные клетки (differentiated cell types) возникают в ходе эмбри-онального развития из одной оплодотворенной яйцеклет-ки и содержат идентичные копии ДНК, характерной для данного вида. Их различия обусловлены тем, как они ис-пользуют генетическую информацию. В различных клет-ках экспрессируются (express) разные гены, — т. е. в них образуются одни белки и не образуются другие в зависи-мости от стимулов, которые они и их материнские клетки получают от своего окружения.

ДНК — это не просто список молекул, которые должна иметь каждая клетка, а клетка — не просто совокупность всех пунктов этого списка. Каждая клетка способна вы-полнять различные биологические задачи в зависимости от среды и истории своего развития, и при этом ее поведе-нием руководит информация, закодированная в ДНК. В следующих главах мы подробно разберем, как ДНК опре-деляет и список компонентов клетки, и правила, опреде-ляющие место и время появления этих компонентов.

КЛЕТКИ ПОД МИКРОСКОПОМ

На сегодняшний день существуют методики, позволяю-щие расшифровывать механизмы, управляющие строе-нием и работой клеток. Но на начальном этапе развития клеточной биологии этих методов еще не было. Тогда клеточные биологи просто смотрели на клетки и ткани, разрушая их или делая срезы и пытаясь разглядеть их внутреннее содержимое. То, что они видели, было крайне загадочным: набор каких-то крошечных, с трудом раз-личимых структур, взаимосвязь которых со свойствами живой материи казалась неразрешимой тайной. Однако этот тип визуальных наблюдений был первым шагом к пониманию строения клетки и остается важной частью ее исследования.

Как правило, клетки очень мелки — настолько мелки, что не видны невооруженным глазом. Никто не наблюдал их до XVII в., когда был изобретен микроскоп. Все, что

стало известно про клетки в течение следующих двух сто-летий, было выяснено с его помощью. Световые микроско-пы (light microscopes), в которых для освещения объектов используется видимый свет, остаются важной частью обо-рудования лабораторий клеточных биологов.

Хотя в настоящее время в световых микроскопах ис-пользуются различные сложные усовершенствования, сами свойства света накладывают ограничения на размер деталей, которые можно различить с их помощью. Элек-тронные микроскопы (electron microscopes), изобретенные в 1930-е годы, позволили преодолеть эти ограничения благодаря применению в качестве источника освещения пучка электронов вместо пучка видимого света. С их по-мощью удается наблюдать гораздо более тонкие детали строения клеток и даже отдельные крупные молекулы. Описание основных типов микроскопов, используемых для изучения клеток, дано на ВКЛАДКЕ 1-1 (с. 18–19).

Изобретение светового микроскопапривело к открытию клеток

Развитие световой микроскопии зависело от успехов в производстве стеклянных линз. К XVII в. линзы были настолько усовершенствованы, что их удалось исполь-зовать для изготовления простых микроскопов. С помо-щью такого микроскопа Роберт Гук исследовал срез куска пробки и сообщил в Трудах Лондонского королевского общества, что пробка состоит из множества мелких ка-мер, которые он назвал ячейками, или «клетками» (cells). Название «клетка» прижилось в науке, хотя описанные Гуком структуры были всего лишь клеточными стенками мертвых клеток, лишенных внутреннего содержимого. Позже Гук и его голландский современник Антони ван Левенгук смогли наблюдать отдельные живые клетки, открыв новый мир, кишащий подвижными одноклеточ-ными организмами.

В течение почти двухсот лет световой микроскоп оставался экзотическим инструментом, доступным лишь немногим состоятельным людям. Только в XIX в. он стал действительно широко использоваться для наблюдения за клетками. Возникновение клеточной биологии как особой науки было постепенным процессом, в который внесли вклад многие ученые; но ее официальное рождение обыч-но связывают с двумя публикациями, одна из которых (1838 г.) принадлежит ботанику Матиасу Шлейдену, а другая (1839 г.) — зоологу и физиологу Теодору Шванну. В своих статьях Шлейден и Шванн опубликовали результа-ты систематических исследований растительных и живот-ных тканей с помощью светового микроскопа, показываю-щие, что клетки — это универсальные строительные блоки всех живых тканей. Их труды и работы других микроско-пистов XIX в. постепенно привели к осознанию учеными того факта, что все живые клетки формируются путем деления предшествующих клеток — одного из главных положений клеточной теории (cell theory) (РИС.1-4). [Ав-торы не приводят других положений клеточной теории:(1) Все клетки сходны по строению (в частности, окруже-ны мембраной и имеют рибосомы) и химическому составу

ВОПРОС 1-3

?Вы принимаете участие в амбициозном научном проекте: создать жизнь в пробирке. Вы кипятите в колбе густой рас-твор дрожжевого экстракта, аминокислот и неорганических

солей, необходимых для работы клеток. Затем затыкаете колбу и даете ей остыть. Через несколько месяцев жидкость все так же про-зрачна, в ней нет никаких признаков жизни. Ваш друг высказывает гипотезу, что дело в нехватке воздуха, так как большинству форм жизни необходим кислород. Вы повторяете эксперимент, но на этот раз оставляете колбу открытой. К вашей радости, через несколь-ко дней раствор мутнеет, и под микроскопом в нем видны краси-вые маленькие клетки, которые явно растут и делятся. Доказывает ли этот опыт, что вам удалось получить из неживой материи новую форму жизни? Как можно видоизменить опыт, чтобы позволить кис-лороду проникать в колбу, но при этом исключить возможность по-падания туда спор бактерий из воздуха? (Готовый ответ содержится в описаниях опытов Луи Пастера по доказательству невозможности самозарождения микроорганизмов.)

Page 19: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

18

ВКЛАДКА 1-1 Микроскопия

СВЕТОВОЙ МИКРОСКОП ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ

МИКРОСКОПИЯ

ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ ЗОНДЫ

Делящиеся ядра эмбриона мухи (изображение

получено с помощью флуоресцентного микро-

скопа после окрашивания специфичным флуо-

ресцентным красителем).

Флуоресцентная краска поглощает свет одной

длины волны и испускает свет другой, боль-

шей длины волны. Некоторые такие красители

специфически связываются с определенными

молекулами в клетках и позволяют выявить их

расположение с использованием флуоресцент-

ного микроскопа. Пример — показанный здесь

краситель для окрашивания ДНК (зеленый).

Другие красители можно присоединять к моле-

кулам антител, которые затем используются как

высокоспецифичные и многоцелевые реагенты.

Они избирательно связываются с определенны-

ми макромолекулами, позволяя нам выявлять их

распределение в клетках. На приведенном фото

белок микротрубочек митотического веретена

(красный) окрашен флуоресцентным антителом.

(С разрешения William Sullivan.)

НАБЛЮДЕНИЕ

ЗА ЖИВЫМИ КЛЕТКАМИ

Изображения одной и той же

культивируемой клетки (фи-

бробласта), полученные с по-

мощью обычной (яркопольной)

оптики (А), фазовоконтрастной

оптики (Б) и интерференцион-

но-констрастной оптики (В). Два

последних метода используют

различия световых волн, прохо-

дящих через участки препарата

с разными показателями пре-

ломления. Все три изображения

можно получить с помощью од-

ного микроскопа, меняя его оп-

тические компоненты.

ФИКСИРОВАННЫЕ ПРЕПАРАТЫ

Ткани большинства организмов недостаточно тонки и прозрачны для непосредственного наблю-дения под микроскопом. Обычно ткани фиксиру-ют, помещая в растворы специальных веществ (фиксаторов), затем изготавливают их тонкие срезы, помещают на специальное предметное стекло и окрашивают, что позволяет лучше раз-личать разные компоненты клеток. На фото пока-зан окрашенный срез кончика корня растения (Г).(С разрешения Catherine Kidner.)

Световой микроскоп может обеспе-

чивать тысячекратное увеличение

(1000х) и позволяет различать де-

тали размером более 0,2 мкм (это

ограничение накладывается не ка-

чеством линз, а волновой природой

света). Для наблюдения за клетками

в световой микроскоп требуются три

условия. Во-первых, это яркий свет,

который необходимо сфокусиро-

вать на препарате с помощью линз

конденсора. Во-вторых, препарат

должен пропускать свет. В-третьих,

нужна определенная комбинация

линз (объектива и окуляра), чтобы

сфокусировать изображение препа-

рата в глазу наблюдателя.

Клетки, окрашенные флуоресцентными красителями, изучают с

помощью флуоресцентного микроскопа. Он похож на обычный

световой микроскоп, только свет от осветителя проходит через

два набора фильтров. Через первый набор ( ) свет проходит до

того, как попадает на препарат; при этом пропускаются только

лучи, возбуждающие молекулы определенного флуоресцентного

красителя. Второй набор фильтров ( ) не пропускает эти лучи, а

пропускает только свет, испускаемый красителем. Окрашенные

объекты выглядят как яркие цветные пятна на темном фоне.

Page 20: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

19

КОНФОКАЛЬНАЯ МИКРОСКОПИЯ

Конфокальный микроскоп — особая разновидность флуоресцентного микроскопа.

В нем изображение строится при сканировании объекта лазерным лучом. Луч фо-

кусируется в точке на определенной глубине образца, а точечная апертура детек-

тора позволяет только флуоресценции, испускаемой той же точкой, попадать на

изображение. Сканирование препарата лучом создает изображение плоскости

фокусировки — оптического среза. На фотоснимках показан интактный зародыш

насекомого, окрашенный флуоресцентным зондом к актину (белок, формирующий

нити). А — обычный флуоресцентный микроскоп дает размытое изображение, так

как выше и ниже глубины резкости присутствует флуоресцентное окрашивание.

Б — конфокальный микроскоп дает оптический срез, на котором четко видны от-

дельные клетки. (С разрешения Richard Warn и Peter Shaw.)

ТРАНСМИССИОННЫЙ

ЭЛЕКТРОННЫЙ

МИКРОСКОП

На электронной микрофото-

графии внизу показан неболь-

шой участок клетки семенника.

Ткань была зафиксирована спе-

циальными реактивами и зали-

та в особую пластмассу; затем

были изготовлены очень тонкие

срезы, окрашенные солями ура-

на и свинца. (Любезно предо-

ставлено Daniel S. Friend.)

В сканирующем электронном микроскопе (СЭМ) образец, по-крытый очень тонким слоем тяжелого металла, сканируется пучком электронов, который фокусируют на его поверхности электромагнитные кольца, действующие в электронном микро-скопе как линзы. Количество электронов, отраженных и рассе-янных каждой точкой образца при бомбардировке его пучком электронов, измеряется детектором и используется для контроля яркости соответствующих точек изображения на видеоэкране. Микроскоп создает удивительные картины трехмерных объектов с большой глубиной фокуса и, в зависимости от модели, позволя-ет выявлять детали размером от 3 нм до 20 нм.

Полученная с помощью СЭМ микро-фотография стереоцилей — выростов волосковых клеток внутреннего уха (слева). Для сравнения показано, как выглядит та же структура в све-товом микроскопе при предельном разрешении (вни-зу). (С разреше-ния Richard Jacobs и James Hudspeth.)

Трансмиссионная электронная микроскопия (ТЭМ) основана на

тех же принципах, что и световая микроскопия, но вместо пучка

света используют пучок электронов, а для его фокусировки —

магнитные кольца вместо стеклянных линз. Образец, который

помещают в вакуум, должен быть очень тонким. Контраст обычно

достигается путем окрашивания образца электронно-плотными

солями тяжелых металлов. Накапливаясь в определенных участ-

ках среза, они поглощают или рассеивают электроны, когда их

пучок проходит через препарат. ТЭМ дает полезное увеличение

до миллиона крат и позволяет различить на биологических пре-

паратах детали размером всего 0,2 нм.

СКАНИРУЮЩАЯ

ЭЛЕКТРОННАЯ

МИКРОСКОПИЯ

Лю

бе

зно

пр

ед

ост

авл

ен

о P

hili

ps

Ele

ctro

n

Op

tics,

с р

азр

еш

ен

ия

FEI

Co

.

Page 21: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

20 ГЛАВА 1. Общее представление о клетках

(содержат ДНК, РНК и белки, состоящие во всех клетках из одного и того же набора мономеров). (2) Эти признаки клеток унаследованы ими от общего предка, т. е. представ-ляют собой гомологии — Прим. ред.]

Предположение о том, что живые организмы не могут спонтанно самозарождаться, а появляются только в ре-зультате размножения уже существующих клеток, остава-лось предметом горячих споров, пока не было окончатель-но подтверждено в 1860 г. экспериментом Луи Пастера.

Положение клеточной теории, согласно которому клетки возникают только из предсуществующих и насле-дуют их признаки, лежит в основе всей биологии и при-дает этой науке важную особенность: в биологии вопро-сы о нынешнем положении вещей неразрывно связаны с вопросами о прошлом. Чтобы понять, почему нынешние клетки и организмы ведут себя так или иначе, нам надо по-нимать их эволюционную историю, весь путь от загадоч-ного происхождения первых клеток на Земле. Теория эво-люции Дарвина, увидевшая свет в 1859 г., дала ключевое объяснение исторического развития живого, показав, как случайная наследственная изменчивость и естественный отбор могут приводить к появлению организмов с новы-

ми признаками, по-новому приспособленных к условиям среды. Теория эволюции объясняет, как появились разно-образные организмы, имеющие общих предков. В комби-нации с клеточной теорией она позволяет взглянуть на все живое, от появления жизни и до настоящего времени, как на одно огромное родословное древо отдельных клеток. Хотя эта книга в основном посвящена тому, как работают нынешние клетки, мы будем вновь и вновь сталкиваться с темой эволюции.

Под микроскопом можно увидеть клетки,органеллы и даже отдельные молекулы

Если сделать очень тонкий срез какой-либо раститель-ной или животной ткани и поместить его под световой микроскоп, мы увидим, что ткань состоит из тысяч мел-ких клеток.

Они могут быть тесно сближены или разделены меж-клеточным веществом, или внеклеточным матриксом (extracellular matrix) — плотным материалом, часто состо-ящим из белковых волокон, заключенных в полисахарид-ный гель (РИС. 1-5).

РИС. 1-4. Новые клетки образуются путем деления предшествующих клеток. (А) В 1889 г. Эду-ард Страсбургер изобразил живую растительную клетку (клетку волоска покровной ткани цветка тра-десканции, Tradescantia), которую он наблюдал в ходе ее деления в течение 2,5 ч. (Б) Похожая клетка, фотографии которой в ходе деления получены с помощью современного светового микроскопа. (Б — с разрешения Peter Hepler.)

Page 22: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Клетки под микроскопом 21

Каждая клетка обычно имеет диаметр порядка 5–20 мкм (РИС. 1-6).

Если держать образец ткани в надлежащих условиях, можно увидеть, что клетки в нем живые: в них движутся какие-то частицы; а если наблюдать терпеливо, можно увидеть, как клетки медленно меняют форму и делятся надвое (см. рис. 1-4 и ускоренное видео деления клетки за-родыша лягушки, ВИДЕО 1.1).

Рассмотреть внутреннее строение клетки сложно не только потому, что она мала, но и потому, что ее части прозрачны и почти бесцветны. Один из способов обойти эту сложность — использование дифференциальных кра-сителей, по-разному окрашивающих части клетки (см. рис. 1-5).

Кроме того, можно учесть тот факт, что разные кле-точные структуры имеют различающиеся коэффициен-ты преломления света (так же, как различаются показа-тели преломления, например, воды и стекла, из-за чего световые лучи преломляются, переходя из одной среды в другую). Небольшие различия коэффициентов прелом-ления можно выявить с помощью специальных оптиче-ских методов, а получаемые изображения можно улуч-шить при специальной компьютерной обработке (см. вкладку 1-1, с. 18–19).

У клеток, наблюдаемых с помощью таких методов, выявляются характерные черты строения (РИС. 1-7). Они имеют резко очерченные границы, что говорит о нали-чии ограничивающей их наружной мембраны. В середине клетки находится крупное, округлое тело — ядро (nucleus).

Вокруг ядра, заполняя внутреннее пространство клетки, лежит цитоплазма (cytoplasm) — прозрачная субстанция, набитая, как кажется, кашей из разнообразных объектов. С помощью хорошего светового микроскопа мы начнем различать и классифицировать отдельные компоненты цитоплазмы (см. рис. 1-7, Б). Однако структуры мельче 0,2 мкм — около половины длины волны видимого света — нельзя разглядеть с помощью обычного светового микро-скопа (более близкие точки неразличимы и выглядят как одно пятно).

За последние несколько лет появились новые типы флуоресцентных микроскопов, которые с использованием сложных методов освещения и анализа изображений по-могают различить в несколько раз меньшие детали. Од-нако для еще большего увеличения и более высокого раз-решения используют электронные микроскопы. Они по-зволяют видеть детали размером в несколько нанометров (нм) (nanometers, nm) (см. рис. 1-6). Для изучения клеток с помощью электронного микроскопа требуется трудо-емкая подготовка препаратов. Даже для световой микро-скопии ткани обычно нужно фиксировать (т. е. помещать

РИС. 1-5. Клетки животных и растений образуют ткани. (А) Клет-ки кончика корня папоротника. Ядра окрашены красным, каждая клетка окружена тонкой клеточной стенкой (голубая). (Б) Клетки со-бирательных трубочек почки. Каждая трубочка выглядит на этом сре-зе как кольцо тесно сближенных клеток с окрашенными в красный цвет ядрами. Трубочки окружены внеклеточным матриксом (пурпур-ный). (А — с разрешения James Mauseth; Б — с разрешения изд-ва Elsevier из P.R. Weater et al., Functional Histology, 2nd ed. Edinburgh: Churchill Livingstone, 1987.)

РИС. 1-6. Что мы можем увидеть? На схеме приведены размеры кле-ток и их составных частей, а также меры длины, используемые для их измерения.

Page 23: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

22 ГЛАВА 1. Общее представление о клетках

в раствор определенных химических реактивов), затем осуществлять заливку в воск, парафин или специальную смолу, а потом готовить срезы и окрашивать. Для элек-тронной микроскопии требуются те же этапы, но срезы должны быть гораздо тоньше. В электронный микроскоп невозможно наблюдать живые клетки. После того как уль-тратонкие срезы окрашены и помещены под электронный микроскоп, в цитоплазме становятся видны отдельные органеллы (organelles) — четко различимые, узнаваемые структурные компоненты клетки, которые лишь смутно различимы под световым микроскопом. В электронный микроскоп видна тонкая, толщиной около 5 нм, наружная мембрана, или плазмалемма (plasma membrane), окружаю-щая клетку. Похожие мембраны окружают и многие орга-неллы внутри нее (РИС. 1-8, А, Б).

Наружную мембрану называют плазматической мем-браной (плазмалеммой), а мембраны, окружающие орга-неллы, — внутренними мембранами (internal membranes). С помощью электронного микроскопа внутри клеток можно увидеть даже некоторые крупные молекулы (рис. 1-8, В).

Электронный микроскоп, предназначенный для изу-чения ультратонких срезов объектов, называют трансмис-сионным электронным микроскопом (transmission electron microscope). В принципе он похож на световой микроскоп,

только вместо видимого света через препарат в нем прохо-дит пучок электронов. В другой разновидности электрон-ного микроскопа — сканирующем электронном микроскопе (scanning electron microscope) — электроны рассеиваются на поверхности образца, и его используют для изучения деталей строения поверхности клеток и других объектов (см. вкладку 1-1, с. 18–19). Электронный микроскоп по-зволяет биологам изучать детали строения биологических мембран, имеющих толщину всего в две молекулы (см. гл. 11). Однако с помощью даже самых мощных электрон-ных микроскопов не удается увидеть отдельные атомы, из которых состоят молекулы (РИС. 1-9).

РИС. 1-7. Внутреннюю структуру живой клетки можно наблюдать с помощью светового микро-скопа. (А) Клетка кожи человека, выращенная в культуре и сфотографированная с помощью интер-ференционно-контрастной оптики светового микроскопа (см. вкладку 1-1, с. 18–19). Хорошо заметно ядро. (Б) Пигментная клетка лягушки, окрашенная флуоресцентными красителями и сфотографиро-ванная с помощью конфокального микроскопа (см. вкладку 1-1). Ядро окрашено голубым, пигментные гранулы — красным, а микротрубочки — разновидность нитей, построенных из белковых молекул ци-топлазмы, — зеленым. (А — с разрешения Casey Cunningham; Б — с разрешения Steve Rogers и Imaging Technology Group.)

РИС. 1-8. Тонкое строение клетки можно увидеть в трансмиссион-ный электронный микроскоп. (А) Ультратонкий срез клетки печени, на котором видно множество деталей строения. Некоторые компоненты, упоминаемые в данной главе, подписаны; их можно узнать по форме и размерам. (Б) Небольшой участок цитоплазмы при большем увеличе-нии. Самые мелкие из ясно различимых структур — рибосомы, каждая из них состоит примерно из 80–90 крупных молекул. (В) Участок длин-ной, нитевидной молекулы ДНК, выделенной из клетки, под электрон-ным микроскопом. (А и Б — с разрешения Daniel S. Friend; В — с раз-решения Mei Lie Wong.)

Page 24: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Клетки под микроскопом 23

Page 25: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

24 ГЛАВА 1. Общее представление о клетках

Микроскоп — неединственный инструмент современ-ных клеточных биологов, позволяющий изучать тонкие детали строения клеток. Например, для изучения про-странственной структуры белков используют рентгено-структурный анализ (см. гл. 4). По ходу изложения ма-териала мы опишем и другие методы, используемые для изучения клеток.

ПРОКАРИОТИЧЕСКАЯ КЛЕТКА

Из всех типов клеток, открытых с помощью микроскопа, бактерии — самые простые по строению; они демонстриру-ют нам жизнь, упрощенную до предела. Действительно, в клетке бактерии почти отсутствуют органеллы — нет даже ядра, где содержалась бы ДНК. Эта особенность — нали-

РИС. 1-9. Какого размера клетка и ее части? Этот рисунок передает соотношение между клетками и атомами. На каждом следующем рисунке показана часть предыдущего, увеличенная в 10 раз и по-казывающая переход от пальца к участку кожи, его клеткам, митохондрии, рибосоме и, наконец, группе атомов одной из многих молекул белка, составляющих наше тело. Детали молекулярной структуры, по-казанные на двух последних рисунках, находятся за пределами разрешающей способности электрон-ного микроскопа.

Page 26: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Прокариотическая клетка 25

чие или отсутствие отделенного мембраной от цитоплаз-мы ядра — служит основой для простого, но важного деле-ния всех организмов на две группы. Организмы с ядром — это эукариоты (eukaryotes) (от греч. eu — хороший или настоящий, и karyon — ядро). Организмы, в чьих клетках нет оформленного ядра — прокариоты (prokaryotes) (от pro — раньше; прокариоты — «доядерные»). Часто слова «бактерии» и «прокариоты» используют как синонимы, хотя мы увидим, что к прокариотам относится и другая группа организмов — археи (ед. число — архея) (archaea, singular archaeon), которые лишь отдаленно родственны бактериям.

Как правило, клетки бактерий имеют сферическую, палочковидную или закрученную в виде штопора форму и мелкие размеры — всего несколько микрометров в длину (РИС. 1-10), хотя среди них встречаются и гиганты, длина которых в сотни раз больше.

У бактерий часто имеется плотная защитная обо-лочка — клеточная стенка, окружающая плазмалемму, и один внутренний компартмент, включающий цитоплаз-му и нуклеоид (nucleoid) (область клетки, где содержит-ся ДНК). Под электронным микроскопом содержимое клетки обычно выглядит как матрикс различной плот-ности, без каких-либо ясно различимых внутренних структур (РИС. 1-11).

Клетки быстро размножаются делением надвое. При оптимальных условиях, когда достаточно пищи, клетки прокариот могут делиться каждые 20 мин. При этих усло-виях за 11 ч одна клетка может дать более 8 000 000 000 потомков (больше, чем людей на Земле). Из-за своей вы-сокой численности, быстрого размножения и способности обмениваться генетической информацией в ходе процес-сов, напоминающих половой процесс эукариот, популя-ции прокариот могут быстро эволюционировать, приобре-тая способность использовать новую пищу или вырабаты-вая устойчивость к новому антибиотику.

Прокариотические клеткинаиболее разнообразныпо биохимическим свойствам

Большинство прокариот — одноклеточные организмы, хотя некоторые могут объединяться в цепочки, гроздья или другие структуры, состоящие из множества кле-ток. По форме и строению клеток прокариоты кажутся простыми и однообразными, но по своим биохимиче-ским процессам это самые изобретательные и наибо-лее разнообразные организмы. Они освоили огромное количество местообитаний — от ила горячих вулка-нических источников до цитоплазмы других живых клеток. По численности они во много раз превосходят все остальные организмы. Некоторые из них — аэро-бы, они используют кислород для окисления молекул пищи; другие — строгие анаэробы, для них смертельна даже очень низкая концентрация кислорода. Как бу-дет показано ниже в этой главе, митохондрии эукариот (органеллы, вырабатывающие энергию) — это потомки аэробных бактерий, поселившихся внутри анаэробных предков современных эукариот. Так что наш собствен-ный аэробный обмен — результат активности бактери-альных клеток.

Бактерии могут использовать в пищу практически любые органические вещества, от древесины до нефти. Более того — некоторые прокариоты могут обходиться вообще без органических веществ; они способны полу-чать углерод из CO2, азот — из N2 атмосферы, а кислород, водород, серу и фосфор — из воздуха, воды и минераль-ных солей.

Некоторые прокариоты, как и растения, способны к фотосинтезу — они получают энергию в виде солнечного света (РИС. 1-12), другие могут добывать ее в ходе окисле-ния неорганических веществ (РИС. 1-13).

РИС. 1-10. Бактерии имеют разные размеры и форму клеток.В одном масштабе нарисованы сферические, палочковидные и спира-левидные клетки некоторых бактерий. Клетки спиральной формы при-надлежат возбудителю сифилиса.

РИС. 1-11. Бактерия Esherichia coli (E. coli) изучена детальнее, чем любой другой живой организм. На рисунке показана электрон-ная микрофотография продольного среза ее клетки; ДНК сосредото-чена в светлоокрашенной части клетки. (С разрешения E. Kellenberger.)

ВОПРОС 1-4

?Бактерия весит около 10–12 г и может делиться каждые 20 ми-нут. За какое время при сохранении этого темпа деления по-томство одной бактерии достигнет массы Земли (6 × 1024 кг)?

На самом же деле бактерии появились 3,5 млрд лет назад и делятся с тех самых пор. Объясните этот парадокс (число клеток N в культуре в данный момент времени t можно определить по формуле N=N0 x 2t/G, где N0 — число клеток в начальный момент времени, а G — время, за которое удваивается численность популяции).

Page 27: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

26 ГЛАВА 1. Общее представление о клетках

Обе эти группы автотрофных бактерий играют важ-ную роль в круговороте веществ: многие другие организ-мы потребляют органические вещества, созданные авто-трофами из неорганики.

Растения тоже способны улавливать энергию солнеч-ного света и фиксировать атмосферный углекислый газ. Но без помощи прокариот растения не способны к азот-фиксации, и в каком-то смысле даже нуждаются в помощи бактерий, чтобы осуществлять фотосинтез. Органеллы, отвечающие за фотосинтез в растительных клетках, — хло-ропласты — произошли от фотосинтезирующих бактерий, поселившихся в цитоплазме клеток у предков современ-ных растений.

Мир прокариот включает два царства:бактерии и археи

Традиционно всех прокариот считали одной большой группой — царством, или доминионом, — живых орга-низмов. Но молекулярные исследования показали, что на самом деле среди прокариот есть две четко очерченные группы (доминиона) — бактерии (bacteria), иногда их на-зывают эубактерии (eubacteria) и археи (archaea) (или архебактерии). На молекулярном уровне бактерии и ар-хеи отличаются друг от друга столь же сильно, как обе эти группы от эукариот. Большинство прокариот, с которыми мы сталкиваемся в повседневной жизни, обитающие в почве или вызывающие болезни, относятся к бактериям. Археи встречаются как в обычных местообитаниях, так и в гораздо менее приспособленных для жизни местах, где обычно не выживают другие клетки. Среди архей есть виды, живущие в концентрированном растворе соли, в го-рячих кислотных вулканических источниках, в лишенных кислорода глубоких слоях донных морских отложений, в иле отстойников сточных вод, в водоемах Антарктиды, постоянно покрытых льдом, и в кислой бескислородной среде коровьего желудка, где они расщепляют целлюлозу и образуют метан. Суровые условия подобных мест обита-ния похожи на те, что должны были существовать на Зем-ле в начальный период эволюции до того, как атмосфера стала насыщаться кислородом.

ЭУКАРИОТИЧЕСКАЯ КЛЕТКА

Эукариотические клетки обычно крупнее и более сложно устроены, чем клетки бактерий и архей. Некоторые из них живут поодиночке, например такие одноклеточные орга-низмы, как амебы или дрожжи (РИС. 1-14). Другие живут в составе многоклеточных организмов. Из эукариотических клеток состоят все достаточно сложные многоклеточные организмы — растения, животные и грибы.

По определению, клетки всех эукариот имеют ядро. Но они отличаются от прокариотических клеток наличием и многих других органелл — субклеточных структур, выпол-няющих определенные функции. Многие из них, как ядро, свойственны всем эукариотическим организмам. Сей-час мы бегло рассмотрим основные органеллы эукарио-тической клетки и выполняемые ими функции.

РИС. 1-12. Некоторые бактерии способны к фотосинтезу. (А) Ana-baena cylindrica представляет собой длинные, многоклеточные нити. На этой полученной с помощью светового микроскопа фотографии видны специализированные клетки, фиксирующие азот (т. е. погло-щающие атмосферный N2 и включающие его в состав органических веществ, помечены буквой H), фиксирующие CO2 в ходе фотосинте-за (V) или превращающиеся в покоящиеся споры (S). (Б) Электронная микрофотография родственного вида, Phormidium laminosum; видны внутренние мембраны, на которых происходит фотосинтез. Эти при-меры показывают, что даже некоторые прокариоты представляют со-бой простые многоклеточные организмы. (А — с разрешения David Adams; Б — с разрешения D.P. Hill и C.J. Howe.)

РИС. 1-13. Серная бактерия, получающая энергию за счет окис-ления H2S. Beggiatoa — бактерия, живущая в богатых сероводородом местах обитания. Она получает энергию, окисляя H2S до серы, и спо-собна фиксировать углерод даже в темноте. На этой световой микро-фотографии видны отложения серы в виде желтых гранул внутри клеток.(С разрешения Ralph W. Wolfe.)

Page 28: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Эукариотическая клетка 27

Клеточное ядро — хранилищегенетической информации

Ядро — обычно наиболее заметная органелла клетки эука-риот (РИС. 1-15).

Ядро заключено в две концентрически расположен-ные мембраны, формирующие ядерную оболочку (nuclear envelope), и содержит молекулы ДНК. В этих чрезвычай-но длинных полимерных молекулах закодирована наслед-ственная информация организма. В световой микроскоп гигантские молекулы ДНК видны как отдельные хромо-сомы (chromosomes), когда они становятся более компакт-ными при подготовке клетки к делению (РИС. 1-16).

РИС. 1-14. Дрожжи — простые одноклеточные эукариоты. Показанная на этой электронной ми-крофотографии клетка принадлежит Saccharomyces cerevisiae, тому самому виду дрожжей, которые заставляют тесто подниматься, а пивное сусло — превращаться в пиво. При бесполом размножении они почкуются — делятся асимметрично на более крупную и более мелкую дочерние клетки. Обе эти клетки имеют единственное ядро (на фото окрашено темным), но в данном случае срез так прошел через ядро неправильной формы у дочерней клетки, что на фото оно выглядит как два отдельных ядра. (С разрешения Soren Mogelsvang и Natalia Gomez-Ostina.)

РИС. 1-15. Ядро содержит бóльшую часть ДНК эукариотической клетки. (А) На этой схеме ти-пичной животной клетки с многочисленными мембранными органеллами ядро окрашено в коричневый цвет, ядерная оболочка — в зеленый, а цитоплазма (внутреннее содержимое клетки, окружающее ядро) и ее органеллы — белые. (Б) Электронная микрофотография ядра клетки млекопитающего. Отдельные хромосомы не видны, так как ДНК на этой стадии клеточного цикла распределена по всему объему ядра в виде тонких нитей. (Б — с разрешения Daniel S. Friend.)

Page 29: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

28 ГЛАВА 1. Общее представление о клетках

Генетическая информация записана на ДНК и в про-кариотических клетках, только у них нет ядерной оболоч-ки, отграничивающей хранилище ДНК от цитоплазмы, сама ДНК имеется всегда.

Митохондрии извлекают из пищиэнергию для жизненных нужд клетки

Митохондрии (mitochondria) есть почти во всех эукариоти-ческих клетках; это одни из самых заметных органелл цито-плазмы (РИС. 1-17). Под электронным микроскопом видно их очень характерное строение. Каждая митохондрия обыч-но имеет сосискообразную или вытянутую червеобразную форму; длина митохондрии — от 1 до нескольких мкм. Она

окружена двумя разными мембранами. Внутренняя мем-брана образует направленные внутрь митохондрии склад-ки (РИС. 1-18). Митохондрии содержат собственную ДНК и размножаются делением надвое. Поскольку митохондрии во многом напоминают бактерий, считается, что они про-изошли от бактерий, которые были поглощены какими-то предками современных эукариот (РИС. 1-19). Между клет-кой-хозяином и этими бактериями возник симбиоз — они помогали друг другу выживать и размножаться.

Наблюдения под микроскопом сами по себе мало что позволяют понять в работе митохондрий. Их функции РИС. 1-16. Хромосомы хорошо видны, когда клетка готовится к

делению. По мере подготовки эукариотической клетки к делению ее ДНК становится компактнее, или конденсируется, образуя палочковид-ные хромосомы, различимые под световым микроскопом. На фотогра-фии показаны три последовательные стадии этого процесса в культиви-руемой клетке из легких тритона. (С разрешения Conly L. Reader.)

РИС. 1-17. Митохондрии могут иметь разную форму. На этой свето-вой микрофотографии клетки млекопитающего митохондрии окрашены в зеленый цвет флуоресцентным красителем. Видно, что они имеют червеобразную форму. Ядро окрашено в синий. Митохондрии — «элек-тростанции» клетки. Они окисляют молекулы пищи, производя полез-ную химическую энергию почти у всех эукариотических клеток. (С раз-решения Lan Bo Chen.)

РИС. 1-18. Митохондрии имеют характерное строение. (А) Элек-тронная микрофотография поперечного среза митохондрии. Видны хо-рошо развитые впячивания внутренней мембраны. (Б) Трехмерная схе-ма строения митохондрии. Показано взаимное расположение мембран. Наружная мембрана гладкая, внутренняя образует плоские складки. На внутренней мембране расположено большинство белков, отвечающих за клеточное дыхание; складки обеспечивают увеличение площади по-верхности, на которой происходит этот процесс. (В) На схеме строения клетки внутреннее пространство митохондрии окрашено. (А — с разре-шения Daniel S. Friend.)

Page 30: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

[ . . . ]

Page 31: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Содержание

Предисловие редакторов перевода 5

Предисловие авторов 6

Благодарности 8

Ресурсы для студентов и преподавателей 9

Краткое оглавление и особые разделы 11

Глава 1. Общее представление о клетках 13

ЕДИНСТВО И МНОГООБРАЗИЕ КЛЕТОК 13

Клетки очень разнообразны по форме и функциям 13

Все клетки схожи по химическому составу 15

Все клетки современных организмов, видимо,

произошли от одной предковой клетки 16

Гены обеспечивают инструкции, определяющие

форму, функции и сложное поведение клеток 16

КЛЕТКИ ПОД МИКРОСКОПОМ 17

Изобретение светового микроскопа

привело к открытию клеток 17

Под микроскопом можно увидеть клетки,

органеллы и даже отдельные молекулы 20

ПРОКАРИОТИЧЕСКАЯ КЛЕТКА 24

Прокариотические клетки наиболее разнообразны

по биохимическим свойствам 25

Мир прокариот включает два царства:

бактерии и археи 26

ЭУКАРИОТИЧЕСКАЯ КЛЕТКА 26

Клеточное ядро — хранилище

генетической информации 27

Митохондрии извлекают из пищи

энергию для жизненных нужд клетки 28

Хлоропласты используют энергию солнечного света 29

Внутренние мембраны создают внутриклеточные

компартменты с разными функциями 30

Цитозоль — концентрированный водный гель

из крупных и мелких молекул 32

Цитоскелет отвечает за клеточную подвижность 32

Цитоплазма находится в постоянном движении 33

Эукариотические клетки, вероятно, приобрели свои

признаки из-за перехода к хищничеству 34

МОДЕЛЬНЫЕ ОРГАНИЗМЫ 37

Молекулярные биологи сосредоточились

на изучении Esherichia coli 37Пекарские дрожжи — простая модельная

эукариотическая клетка 37

Arabidopsis thaliana был избран модельным объектом

среди 300 000 видов цветковых растений 38

Главные модельные объекты среди животных —

муха, круглый червь, мышь, рыба и человек 39

Делись или умри 39

Ближайший родственник 40

Чтение генов 41

Сравнение нуклеотидных последовательностей

геномов выявило сходство всех живых организмов 43

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 45

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 45

Глава 2. Химический состав клеток 47

ХИМИЧЕСКИЕ СВЯЗИ 47

В клетках можно встретить только некоторые

разновидности атомов 47

Электроны внешнего уровня определяют

химические взаимодействия атомов 49

Ионные связи образуются путем обретения

и потери электронов 51

Ковалентные связи формируются

при обобществлении электронов 52

Ковалентные связи различаются по силе 53

Существуют разные типы ковалентных связей 53

Электростатическое притяжение помогает

сближению молекул в клетках 54

Молекулы воды образуют друг с другом

водородные связи 55

Page 32: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

758 Основы молекулярной биологии клетки

Некоторые полярные молекулы проявляют в водных

растворах кислотные и основные свойства 55

МОЛЕКУЛЫ В КЛЕТКАХ 57

Клетки состоят из соединений углерода 57

Клетки содержат четыре основных класса малых

органических молекул 57

Сахара служат источниками энергии для клеток

и мономерами полисахаридов 58

Жирные кислоты служат компонентами

клеточных мембран 59

Аминокислоты — мономеры белков 61

Нуклеотиды — мономеры ДНК и РНК 62

МАКРОМОЛЕКУЛЫ В КЛЕТКАХ 63

Для макромолекул характерна определенная

последовательность мономеров 64

Нековалентные связи определяют точную форму

макромолекул 67

Нековалентные связи позволяют макромолекуле

избирательно связывать другие молекулы 67

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 69

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 69

Глава 3. Энергия, катализ и биосинтез 85

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ЭНЕРГИИ КЛЕТКАМИ 86

Упорядоченность биосистем возможна благодаря

высвобождению клетками тепловой энергии 87

Фотосинтезирующие организмы используют

энергию света для синтеза органических молекул 88

Клетки получают энергию за счет окисления

органических молекул 90

Окисление и восстановление — результат переноса

электронов 91

СВОБОДНАЯ ЭНЕРГИЯ И КАТАЛИЗ 92

Ферменты снижают энергию активации, что позволяет

химическим реакциям протекать в клетках 92

Осуществимость химической реакции зависит от того,

как меняется в ходе нее свободная энергия 94

Концентрации реагентов и конечных продуктов

влияют на изменение свободной энергии

и направление реакции 95

Изменение стандартной свободной энергии

позволяет сравнивать энергетику различных

химических реакций 95

Клетки существуют в химически неравновесном

состоянии 95

Константа равновесия прямо пропорциональна G° 98

В сложных реакциях константа равновесия

зависит от концентраций всех исходных веществ и

продуктов 99

Константа равновесия характеризует силу

межмолекулярных взаимодействий 99

Для последовательных реакций изменения свободной

энергии суммируются 100

Быстрая диффузия позволяет ферментам

взаимодействовать с субстратами 100

Vmax

и KM

служат мерой быстродействия ферментов 102

Скорость 103

Контроль 104

Дизайн 105

АКТИВИРОВАННЫЕ МОЛЕКУЛЫ-ПЕРЕНОСЧИКИ

И БИОСИНТЕЗ 106

Образование активированных переносчиков

сопряжено с энергетически выгодными

реакциями 106

АТФ — самая распространенная активированная

молекула-переносчик 107

Энергия, запасенная в АТФ, может расходоваться

на соединение молекул между собой 108

НАД·Н и НАДФ·Н — важные переносчики

электронов 108

Клетки используют множество других

активированных молекул-переносчиков 110

Синтез биополимеров требует затрат энергии 112

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 114

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 114

Глава 4. Структура и функции белков 117

ФОРМА И СТРОЕНИЕ БЕЛКОВЫХ МОЛЕКУЛ 117

Форма белка задается его аминокислотной

последовательностью 119

Реализуемая укладка белка соответствует

состоянию с наименьшей энергией 122

Геометрия белковых молекул очень сложна

и разнообразна 123

Типовые паттерны укладки белков —

-спираль и -слой 126

В биологических структурах часто

встречаются спирали 126

-Слои формируют жесткую основу многих белковых

молекул 130

Белки имеют несколько уровней укладки 130

Лишь некоторые из множества возможных

белковых цепей имеют полезные свойства 131

Белки группируются в семейства 132

Крупные белковые молекулы часто содержат

несколько полипептидных цепей 132

Белковые молекулы могут формировать нити,

листы и сферы путем самосборки 134

Page 33: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Содержание 759

Молекулы некоторых белков имеют вытянутую

нитевидную форму 135

Внеклеточные белки часто стабилизированы

межмолекулярными ковалентными связями 136

КАК РАБОТАЮТ БЕЛКИ 136

Все белки участвуют в межмолекулярных

взаимодействиях 137

Сайты связывания особенно разнообразны

у антител 138

Ферменты — это мощные специфичные

катализаторы 139

Описание механизма работы фермента

на примере лизоцима 142

Большинство лекарств — ингибиторы ферментов 145

Прочно связанные с белками малые молекулы

придают им дополнительные функции 145

КАК РЕГУЛИРУЕТСЯ РАБОТА БЕЛКОВ 146

Каталитическую активность ферментов

часто регулируют другие молекулы 146

У аллостерических ферментов есть

взаимозависимые сайты связывания 147

Фосфорилирование может регулировать активность

белка, меняя его конформацию 148

ГТФ-связывающие белки тоже регулируются

путем циклического присоединения

и отделения фосфата 149

Гидролиз нуклеотидов позволяет моторным белкам

обеспечивать клеточную подвижность 150

Крупные комплексы из большого числа белков

функционируют в качестве белковых машин 151

Ковалентные модификации белков контролируют

местонахождение белковых молекул и сборку

белковых комплексов 152

КАК ИЗУЧАЮТ БЕЛКИ 152

«Отпечатки пальцев» 153

Рентгеноструктурный анализ 154

Ядерный магнитный резонанс 156

Клетки можно выращивать в культуре 157

Современные методы очистки позволяют получать

высококачественные препараты белков

из клеточных гомогенатов 158

Почти любой белок можно получить

в больших количествах благодаря возможностям

генной инженерии 159

Автоматизация исследований структуры и функции

белков ускоряет научный прогресс 164

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 164

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 165

Глава 5. ДНК и хромосомы 167

СТРОЕНИЕ И ФУНКЦИИ ДНК 168

Молекула ДНК состоит из двух

комплементарных цепей нуклеотидов 168

Послания от мертвых 169

Надувая мыльные пузыри 170

Коктейль из вирусов 171

Строение ДНК обеспечивает механизм

наследственности 174

СТРУКТУРА ЭУКАРИОТИЧЕСКИХ ХРОМОСОМ 174

ДНК эукариот упакована в несколько хромосом 175

Хромосома содержит множество линейно

расположенных генов 176

Состояние хромосом изменяется в течение

жизни клетки 177

Интерфазные хромосомы занимают

определенные области внутри ядра 179

ДНК в хромосомах высококонденсирована 180

Нуклеосомы — основные единицы укладки ДНК

в хромосомах эукариот 180

Существуют разные уровни укладки ДНК

в хромосомах 182

РЕГУЛЯЦИЯ СТРУКТУРЫ ХРОМОСОМ 183

Изменение структуры нуклеосом обеспечивает

доступ ферментов к ДНК 183

Интерфазные хромосомы содержат

конденсированные и более рыхлые участки

хроматина 185

Изменение структуры хроматина может

наследоваться 186

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 187

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 188

Глава 6. ДНК: репликация,репарация и рекомбинация 191

РЕПЛИКАЦИЯ ДНК 192

Спаривание оснований позволяет ДНК

реплицироваться 192

Синтез ДНК начинается в ориджинах репликации 193

Синтез новой ДНК происходит

в репликативных вилках 196

Репликативная вилка асимметрична 197

ДНК-полимеразы могут исправлять

за собой ошибки 198

Небольшие фрагменты РНК играют роль затравок

при синтезе ДНК 199

Белки репликативной вилки кооперируются,

формируя единый репликативный аппарат 201

Page 34: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

760 Основы молекулярной биологии клетки

Теломераза реплицирует концы эукариотических

хромосом 203

РЕПАРАЦИЯ ДНК 203

Мутации могут иметь серьезные последствия

для организма 204

Система репарации неспаренных нуклеотидов

удаляет ошибки, допущенные репликативным

аппаратом 205

ДНК в клетках постоянно испытывает

повреждающие воздействия 206

Репарация ДНК поддерживает стабильность генов 208

Двухцепочечные разрывы могут быть

репарированы быстро, но неточно 209

Сведения о точности репликации и репарации ДНК

сохранились в последовательностях геномов 210

ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ 210

Для гомологичной рекомбинации

необходимы протяженные участки

со схожими последовательностями 211

Двухцепочечные разрывы могут быть

безошибочно репарированы при помощи

гомологичной рекомбинации 211

Гомологичная рекомбинация обеспечивает обмен

генетической информацией во время мейоза 212

МОБИЛЬНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ

И ВИРУСЫ 213

В мобильных генетических элементах закодированы

компоненты, необходимые для их передвижения 213

Геном человека содержит два больших семейства

мобильных элементов 214

Вирусы — полностью мобильные генетические

элементы, способные перемещаться

из клетки в клетку 215

Ретровирусы обращают нормальное направление

передачи генетической информации вспять 216

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 218

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 218

Глава 7. От ДНК к белку: как клетки реализуют генетическую информацию 221

ОТ ДНК К РНК 222

Участки последовательностей ДНК

транскрибируются в РНК 222

При транскрипции образуются молекулы РНК,

комплементарные одной из цепей ДНК 222

В клетках образуются разные типы молекул РНК 225

РНК-полимераза опознает сигнальные

участки ДНК, обозначающие начало

и конец транскрипции 226

Инициация транскрипции эукариотических генов —

сложный процесс 228

Для работы эукариотической РНК-полимеразы

требуются универсальные факторы

транскрипции 228

У эукариот в ядре одновременно происходит

синтез и процессинг РНК 230

Эукариотические гены прерываются

некодирующими последовательностями 230

Интроны удаляются при сплайсинге РНК 232

Зрелые РНК эукариот избирательно

экспортируются из ядра 233

Молекулы мРНК в клетке рано или поздно

расщепляются 234

Вероятно, в генах общих предков современных

организмов содержались интроны 234

ОТ РНК К БЕЛКУ 235

Каждая аминокислота в белке кодируется

тремя последовательно расположенными

нуклеотидами мРНК 235

Молекулы тРНК обеспечивают соответствие

аминокислот кодонам мРНК 236

Обойтись без клеток 237

Поддельные послания (РНК) 237

Ловля триплетов 239

Специфичные ферменты связывают тРНК

с нужной аминокислотой 240

Расшифровка генетической информации

происходит в рибосомах 241

Рибосомы — это рибозимы 243

В мРНК есть кодоны, служащие сигналами

начала и окончания синтеза белка 244

Белки синтезируются на полирибосомах 246

Ингибиторы синтеза белка в прокариотических

клетках используются в качестве антибиотиков 247

Строго регулируемая деградация белков

обеспечивает поддержание необходимого

их количества в клетке 247

Существует несколько этапов реализации

генетической информации на пути

от ДНК к белку 248

РНК И ПРОИСХОЖДЕНИЕ ЖИЗНИ 249

Для существования жизни необходим автокатализ 249

РНК могут и хранить генетическую информацию,

и катализировать химические реакции 250

Вероятно, РНК появилась до ДНК в ходе эволюции 251

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 252

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 253

Page 35: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Содержание 761

Глава 8. Регуляция генной экспрессии 255ОБЗОР ГЕННОЙ ЭКСПРЕССИИ 256

Различные типы клеток многоклеточного организма

содержат одинаковую ДНК 256

Различные типы клеток синтезируют

разные наборы белков 256

Клетка может изменять экспрессию своих генов

в ответ на внешние сигналы 258

Экспрессия генов может регулироваться на разных

этапах пути от ДНК через РНК к белку 258

КАК РАБОТАЮТ ПЕРЕКЛЮЧАТЕЛИ

ТРАНСКРИПЦИИ 259

Транскрипцию контролируют белки,

связывающиеся с регуляторными

последовательностями ДНК 259

Переключатели транскрипции позволяют клеткам

отвечать на изменения в окружающей среде 260

Репрессоры выключают гены, а активаторы включают 261

Активатор и репрессор контролируют Lac-оперон 262

У эукариот участки, необходимые для регуляции

транскрипции определенных генов, могут

находиться на большом расстоянии от этих генов 263

Упаковка ДНК в нуклеосомы влияет на инициацию

транскрипции 263

МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ, НЕОБХОДИМЫЕ

ДЛЯ СОЗДАНИЯ РАЗНЫХ ТИПОВ

СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫХ КЛЕТОК 264

Эукариотические гены регулируются

комбинациями белков 265

Экспрессия нескольких генов может

координироваться одним белком 265

В большом яйце 266

Поиск белков 266

Исследуя ДНК 267

С помощью комбинаторного контроля

могут создаваться различные типы клеток 269

Стабильные паттерны генной экспрессии

могут передаваться дочерним клеткам 270

Формирование целого органа может запускаться

одним регулятором транскрипции 271

ПОСТТРАНСКРИПЦИОННЫЙ КОНТРОЛЬ 272

Рибопереключатели — экономичное решение

для регуляции генов 272

Нетранслируемые участки мРНК могут управлять

их трансляцией 273

Малые регуляторные РНК контролируют

экспрессию тысяч генов растений и животных 273

РНК-интерференция позволяет уничтожить

чужеродные двухцепочечные РНК 274

Ученые могут использовать РНК-интерференцию

для выключения генов 275

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 276

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 276

Глава 9. Как эволюционируютгены и геномы 279ВОЗНИКНОВЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ

ИЗМЕНЧИВОСТИ 279

В организмах, размножающихся половым путем,

потомству передаются только изменения, происходящие в зародышевой линии 280

Точечные мутации вызываются сбоями нормальных механизмов копирования и поддержания ДНК 281

Точечные мутации могут изменять регуляцию гена 282

Дупликации участков ДНК приводят

к возникновению семейств родственных генов 284

Эволюция семейства генов глобинов показывает,

как дупликация и последующая дивергенция генов

могут создавать белки, приспособленные

к особенностям организма и его развития 284

Эволюционная история многих видов

включала полногеномные дупликации 286

Новые гены могут возникать в результате

удвоения экзона 286

Новые гены могут также возникать в результате

перемешивания экзонов 287

Перемещения мобильных генетических элементов

ускоряли эволюцию генома 287

Гены могут перемещаться между организмами

в результате горизонтального переноса 288

ВОССТАНОВЛЕНИЕ СЕМЕЙНОГО ДРЕВА

ВСЕХ ЖИВЫХ СУЩЕСТВ 289

Генетические изменения, дающие селективное

преимущество, сохраняются 289

Геномы человека и шимпанзе имеют

сходную структуру и последовательность 290

Функционально важные участки проявляются

как островки с консервативной

последовательностью ДНК 291

Сравнение геномов показывает, что геномы

позвоночных быстро приобретают и теряют ДНК 292

Консервативность последовательности позволяет

прослеживать даже самое далекое

эволюционное родство 293

ИЗУЧЕНИЕ ГЕНОМА ЧЕЛОВЕКА 295

Нуклеотидная последовательность генома человека

показывает расположение наших генов 295

Сигналы и осколки 297

Сопоставление меток 298

Число генов человека: обратный отсчет 298

Page 36: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

762 Основы молекулярной биологии клетки

Ускоренные изменения консервативных

последовательностей в геномах помогают

узнать, что делает человека человеком 299

Изменчивость генома человека — одна из причин

индивидуальности 299

Геном человека содержит обилие информации,

которую еще только предстоит расшифровать 300

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 301

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 302

Глава 10. Анализ генов и геномов 305

МАНИПУЛЯЦИИ С МОЛЕКУЛАМИ ДНК

И ИХ ИЗУЧЕНИЕ 306

Рестрикционные нуклеазы разрезают

молекулы ДНК в специфичных сайтах 307

Гель-электрофорез позволяет разделять

молекулы ДНК разной длины 307

Гибридизация — чувствительный метод

определения специфических нуклеотидных

последовательностей 308

Гибридизацию проводят с помощью ДНК-зондов,

предназначенных для обнаружения данной

нуклеотидной последовательности 308

КЛОНИРОВАНИЕ ДНК 310

С помощью ДНК-лигаз соединяют фрагменты ДНК,

получая рекомбинантные молекулы ДНК 310

Рекомбинантные молекулы ДНК могут копироваться

в бактериальных клетках 310

Для клонирования ДНК используют специальные

плазмидные векторы 311

Гены можно выделить из библиотек ДНК 312

Библиотеки кДНК отражают состав мРНК

определенных тканей 314

С помощью полимеразной цепной реакции можно

амплифицировать определенный фрагмент ДНК 316

РАСШИФРОВКА И ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИНФОРМАЦИИ 319

ДНК можно быстро секвенировать 319

Можно создавать совершенно новые молекулы ДНК 321

С помощью клонирования ДНК можно получать

большие количества редких белков 321

Метод дробовика 322

Репортерные гены и гибридизация in situпозволяют определить, когда и где

экспрессируется данный ген 324

Клон за клоном 325

А теперь все вместе 325

Гибридизация на ДНК-микрочипах позволяет следить

за экспрессией тысяч генов одновременно 327

С помощью генетических методов можно выявить

функцию гена 328

Животных можно генетически модифицировать 329

РНК-интерференция — простой способ

изучения функции гена 331

Трансгенные растения важны для клеточной

биологии и сельского хозяйства 331

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 332

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 333

Глава 11. Строение мембраны 337

ЛИПИДНЫЙ БИСЛОЙ 339

Мембранные липиды формируют в воде бислои 339

Липидный бислой — двумерная жидкость 342

Текучесть липидного бислоя зависит от его состава 343

Липидный бислой асимметричен 344

Асимметрия липидного бислоя сохраняется при

транспорте мембран 345

МЕМБРАННЫЕ БЕЛКИ 345

Мембранные белки связываются с липидным

бислоем разными способами 346

Полипептидные цепочки обычно пересекают

бислой в виде -спиралей 347

Мембранные белки можно выделить с помощью

детергентов и очистить 348

Детальная структура известна для немногих

мембранных белков 349

Плазматическая мембрана укреплена

клеточным кортексом 351

Клетки могут ограничивать подвижность

мембранных белков 352

Поверхность клеток покрыта углеводами 353

Атака FRAP 354

Поодиночке 354

Освобожденные из клеток 355

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 356

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 357

Глава 12. Мембранный транспорт 359

ОСНОВНЫЕ МЕХАНИЗМЫ МЕМБРАННОГО

ТРАНСПОРТА 360

Концентрации ионов внутри и снаружи клетки

резко различаются 360

Липидный бислой непроницаем для многих

растворенных веществ и ионов 360

Существует две группы мембранных транспортных

белков — каналы и переносчики 361

Растворенные вещества перемещаются

через мембраны путем пассивного

или активного транспорта 362

Page 37: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Содержание 763

БЕЛКИ-ПЕРЕНОСЧИКИ И ИХ ФУНКЦИИ 362

Концентрационные градиенты и электрические силы

обеспечивают пассивный транспорт 363

При активном транспорте растворенные вещества

перемещаются против электрохимических

градиентов 364

Клетки животных используют энергию

гидролиза АТФ для выкачивания ионов натрия 365

Работа Na+-K+-насоса зависит от временного

присоединения фосфатной группы 366

Na+-K+-насос помогает поддерживать

осмотический баланс животных клеток 367

Внутриклеточная концентрация ионов Ca2+

поддерживается на низком уровне

за счет работы Ca2+-насосов 368

При сопряженном транспорте белки-переносчики

используют электрохимические градиенты

для активного поглощения питательных веществ 368

Грибы, растения и бактерии используют

для мембранного транспорта градиенты Н+ 370

ИОННЫЕ КАНАЛЫ И МЕМБРАННЫЙ

ПОТЕНЦИАЛ 372

Ионные каналы обладают избирательностью

и воротным механизмом 372

Ионные каналы осуществляют случайные переходы

из открытого состояния в закрытое и обратно 373

Различные стимулы вызывают открывание

и закрывание ионных каналов 375

Потенциал-зависимые ионные каналы реагируют

на мембранный потенциал 375

Мембранный потенциал зависит от проницаемости

мембраны для определенных ионов 376

ИОННЫЕ КАНАЛЫ И ПЕРЕДАЧА СИГНАЛОВ

НЕРВНЫМИ КЛЕТКАМИ 378

Потенциалы действия используются для быстрой

передачи сигнала на большие расстояния 379

Потенциалы действия обычно возникают

при открывании потенциал-зависимых

натриевых каналов 380

Установка в действии 381

В нервных окончаниях благодаря открыванию

потенциал-зависимых кальциевых каналов

электрический сигнал превращается

в химический 382

Медиатор-зависимые каналы на клетках-мишенях

превращают химические сигналы

обратно в электрические 383

Пропускная способность канала связи 383

Нейроны получают возбуждающие

и тормозные сигналы 385

Медиатор-зависимые ионные каналы —

главные мишени психотропных веществ 387

Синапсы позволяют человеку думать, действовать

и запоминать 387

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 388

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 389

Глава 13. Как клетки получают энергиюиз пищи 391

РАСЩЕПЛЕНИЕ И ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

САХАРОВ И ЖИРОВ 391

Молекулы пищи расщепляются в три стадии 392

Гликолиз — центральный путь синтеза АТФ 394

Брожение обеспечивает синтез АТФ

в отсутствие кислорода 395

Пример гликолиза показывает, как ферменты

сопрягают окисление и запасание энергии 395

Сахара и жиры расщепляются в митохондриях

до ацетилкофермента А 400

В цикле лимонной кислоты за счет окисления

ацетильных групп до CO2 образуется НАД·H 402

Измельченные ткани, странный катализ 403

Яд указывает на цикл 404

Многие пути биосинтеза начинаются с гликолиза

или цикла лимонной кислоты 405

Объяснение загадочных усиливающих эффектов 405

Перенос электронов движет синтезом

основной части АТФ в большинстве клеток 408

РЕГУЛЯЦИЯ МЕТАБОЛИЗМА 409

Реакции катаболизма и анаболизма

взаимосвязаны и регулируемы 409

Регуляция по принципу отрицательной обратной

связи позволяет клеткам переключаться

с расщепления глюкозы на ее биосинтез 410

Клетки запасают молекулы пищи в специальных

хранилищах для будущего использования 411

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 413

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 413

Глава 14. Производство энергиив митохондриях и хлоропластах 415Клетки получают бóльшую часть энергии

за счет механизма, связанного с мембраной 415

МИТОХОНДРИИ И ОКИСЛИТЕЛЬНОЕ

ФОСФОРИЛИРОВАНИЕ 417

Митохондрии имеют внешнюю мембрану,

внутреннюю мембрану и два внутренних

компартмента 418

Page 38: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

764 Основы молекулярной биологии клетки

В ходе цикла Кребса образуются

высокоэнергетические электроны 419

В хемиосмотическом процессе энергия передается

от активированных молекул-переносчиков к АТФ 420

Электрон-транспортная цепь перекачивает протоны

через внутреннюю мембрану митохондрии 420

Перекачка протонов создает сильный

электрохимический протонный градиент

на внутренней мембране митохондрии 421

Электрохимический протонный градиент

используется для синтеза АТФ 422

Сопряженный транспорт через внутреннюю

мембрану митохондрии также происходит

за счет электрохимического протонного

градиента 423

С помощью окислительного фосфорилирования

образуется почти вся клеточная АТФ 424

Быстрое превращение АДФ в АТФ в митохондриях

поддерживает высокое соотношение

АТФ/АДФ в клетках 425

МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ТРАНСПОРТА

ЭЛЕКТРОНОВ И ПЕРЕНОСА ПРОТОНОВ 425

Протоны легко перемещаются за счет транспорта

электронов 425

Редокс-потенциал — мера сродства к электрону 426

Предполагаемые интермедиаты 427

Использование силы 427

Искусственное производство АТФ 428

Переносы электронов высвобождают большие

количества энергии 429

Металлы, связанные с белками, формируют

универсальные переносчики электронов 429

Цитохромоксидаза катализирует восстановление

молекулярного кислорода 432

Механизм перекачки протонов можно изучать

на атомарном уровне 433

Дыхание потрясающе эффективно 433

ХЛОРОПЛАСТЫ И ФОТОСИНТЕЗ 434

Хлоропласты напоминают митохондрии,

но обладают дополнительным компартментом 434

Хлоропласты улавливают энергию солнечного света

и используют ее для фиксации углерода 436

Солнечный свет поглощают молекулы хлорофилла 437

Возбужденные молекулы хлорофилла направляют

энергию в реакционный центр 437

Энергия света нужна для синтеза как АТФ,

так и НАДФ·H 439

Хлоропласты могут регулировать свою

продукцию АТФ 441

При фиксации углерода используются АТФ

и НАДФ·H для превращения CO2 в сахара 441

Сахара, образовавшиеся в цикле фиксации

углерода, могут запасаться в виде крахмала

или потребляться для производства АТФ 442

ПРОИСХОЖДЕНИЕ ХЛОРОПЛАСТОВ

И МИТОХОНДРИЙ 443

Окислительное фосфорилирование могло

давать древним бактериям эволюционные

преимущества 444

Фотосинтетические бактерии еще более

нетребовательны к среде 445

Образ жизни бактерии Methanococcusсвидетельствует о древности происхождения

процесса хемиосмотического сопряжения 446

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 447

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 448

Глава 15. Внутриклеточные компартментыи внутриклеточный транспорт 451

МЕМБРАННЫЕ ОРГАНЕЛЛЫ 451

Эукариотические клетки содержат одинаковый

набор мембранных органелл 452

Мембранные органеллы возникли в ходе

эволюции разными путями 453

СОРТИРОВКА БЕЛКОВ 455

Белки импортируются в органеллы тремя способами 455

Сигнальные последовательности направляют

белки в нужный компартмент 456

Белки попадают в ядро через ядерные поры 456

Белки развертываются для попадания

в митохондрии и хлоропласты 458

Белки попадают в эндоплазматическую сеть

в процессе синтеза 459

Растворимые белки попадают в полость ЭПС 460

Старт- и стоп-сигналы определяют расположение

трансмембранных белков в липидном бислое 461

ВЕЗИКУЛЯРНЫЙ ТРАНСПОРТ 462

Транспортные везикулы переносят растворимые

белки и мембраны между компартментами 462

Отпочковывание везикул вызывается образованием

белковой оболочки 463

Слияние пузырьков зависит от связывающих белков

и SNARЕ 465

СЕКРЕТОРНЫЙ ПУТЬ 466

Большинство белков ковалентно

модифицируются в ЭПC 466

При транспорте из ЭПС контролируется

качество белков 467

Размеры ЭПС контролируются количеством

Page 39: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Содержание 765

проходящих через нее белков 468

В аппарате Гольджи происходит дальнейшая

модификация и сортировка белков 468

Секреторные белки высвобождаются из клетки

путем экзоцитоза 469

ЭНДОЦИТОЗНЫЙ ПУТЬ 470

Специализированные клетки-фагоциты

поглощают крупные частицы 471

В пробирке 471

Спросите у дрожжей 471

В кино 472

Жидкости и растворенные в них макромолекулы

поглощаются путем пиноцитоза 473

Рецептор-опосредованный эндоцитоз —

особый способ поглощения веществ

животными клетками 473

Поглощенные при эндоцитозе макромолекулы

сортируются в эндосомах 474

Лизосомы — основные органеллы, осуществляющие

внутриклеточное пищеварение 475

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 476

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 477

Глава 16. Межклеточныевзаимодействия 479

ОБЩИЕ ПРИНЦИПЫ МЕЖКЛЕТОЧНОЙ

СИГНАЛИЗАЦИИ 480

Сигналы могут действовать на малом

или большом расстоянии 480

Каждая клетка отвечает на определенный набор

сигналов в зависимости от своего состояния

и предыстории 481

Клеточный ответ на сигнал может быть быстрым

или медленным 484

Некоторые гормоны проходят сквозь наружную

мембрану и связываются с внутриклеточными

рецепторами 484

Некоторые растворенные газы проникают в клетку

через наружную мембрану и напрямую

активируют внутриклеточные ферменты 486

Рецепторы клеточной поверхности передают

внеклеточные сигналы через внутриклеточные

сигнальные пути 487

Некоторые внутриклеточные сигнальные белки

действуют как внутриклеточные переключатели 488

Рецепторы клеточной поверхности представлены

тремя главными классами 489

Рецепторы, сопряженные с ионными каналами,

превращают химические сигналы

в электрические 490

РЕЦЕПТОРЫ, СОПРЯЖЕННЫЕ С G-БЕЛКАМИ 491

При стимуляции GPCR активируют субъединицы

G-белков 491

Некоторые G-белки напрямую регулируют

ионные каналы 493

Некоторые G-белки активируют связанные

с мембраной ферменты 493

Сигнальный путь, запускаемый цАМФ,

может приводить к активации ферментов

и включению генов 494

Сигнальный путь с участием инозитольных

фосфолипидов приводит к повышению

внутриклеточной концентрации ионов кальция 496

Ионы кальция активируют многие биологические

процессы 497

Внутриклеточные сигнальные каскады могут достигать

удивительной скорости, чувствительности

и приспособляемости 498

РЕЦЕПТОРЫ С ФЕРМЕНТАТИВНОЙ

АКТИВНОСТЬЮ 500

Активированные рецепторные тирозинкиназы

мобилизуют комплекс внутриклеточных

сигнальных белков 500

Большинство рецепторных тирозинкиназ

активируют мономерную ГТФазу Ras 501

Рецепторные тирозинкиназы активируют РI-3-киназу,

образуя на плазматической мембране

липидные стыковочные сайты для белков 503

Выявление фосфорилирования 504

Тесные взаимодействия 504

Затор на сигнальном пути 505

Кто за кем идет в пути 505

Некоторые рецепторы запускают быстрый переход

белков в ядро 507

Многоклеточность и межклеточные взаимодействия

независимо возникли в ходе эволюции

у животных и растений 508

Сети взаимодействующих протеинкиназ

обобщают информацию при регуляции

сложного поведения клеток 508

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 510

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 511

Глава 17. Цитоскелет 513

ПРОМЕЖУТОЧНЫЕ ФИЛАМЕНТЫ 515

Промежуточные филаменты похожи

на прочные канаты 516

Промежуточные филаменты защищают клетки

от механических повреждений 517

Page 40: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

766 Основы молекулярной биологии клетки

Ядерная оболочка подостлана сетью

из промежуточных филаментов 518

МИКРОТРУБОЧКИ 519

Микротрубочки — полые трубки со структурно

различающимися концами 520

Центросома — главный центр организации

микротрубочек в клетках животных 520

Растущим микротрубочкам свойственна

динамическая нестабильность 521

Микротрубочки существуют благодаря балансу

между сборкой и разборкой 522

Микротрубочки структурируют внутреннее

содержимое клетки 523

Моторные белки осуществляют внутриклеточный

транспорт 525

Органеллы двигаются вдоль микротрубочек 525

Реснички и жгутики содержат стабильные

микротрубочки, приводимые в движение

динеином 526

Кишащая цитоплазма 527

Ползающие трубочки 528

Свет! Камера! Мотор! 528

АКТИНОВЫЕ ФИЛАМЕНТЫ 532

Актиновые филаменты тонкие и гибкие 532

Актин и тубулин полимеризуются с помощью

сходных механизмов 533

Многие белки связывают актин и модифицируют

его свойства 533

В большинстве эукариотических клеток

под плазматической мембраной

находится богатый актином кортекс 534

Амебоидное движение клеток зависит от актина 534

Актин связывается с миозином, формируя

сократимые структуры 537

Внешние сигналы контролируют сборку

актиновых филаментов 537

МЫШЕЧНОЕ СОКРАЩЕНИЕ 538

Мышечное сокращение обеспечивают пучки

актина и миозина 538

При мышечном сокращении пучки актина

и миозина скользят друг по другу 539

Мышечное сокращение запускается быстрым

повышением концентрации ионов кальция

в цитоплазме 542

Мышечные клетки разных органов выполняют

особые функции 543

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 544

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 545

Глава 18. Клеточный цикл 547

ОБЗОР СОБЫТИЙ КЛЕТОЧНОГО ЦИКЛА 548

Клеточный цикл эукариотической клетки

подразделяется на четыре фазы 548

Система контроля клеточного цикла инициирует

его основные события 549

Механизмы контроля клеточного цикла

сходны у всех эукариот 550

СИСТЕМА КОНТРОЛЯ КЛЕТОЧНОГО ЦИКЛА 550

Система контроля клеточного цикла включает

Cdk — циклически активируемые

протеинкиназы 550

Активность Cdk регулируется фосфорилированием

и дефосфорилированием 552

Назад к яйцу 552

Выдайте нам М 552

Выуживание из ракушек 553

В кругу семьи 553

Различные комплексы циклин–Cdk запускают

разные этапы клеточного цикла 554

Система контроля клеточного цикла зависит

от циклического протеолиза 554

Белки, ингибирующие Cdk, могут останавливать

клеточный цикл на особых «контрольно-

пропускных пунктах» (чекпойнтах) 554

S-ПЕРИОД 556

S–Cdk запускает удвоение ДНК и помогает

блокировать сверхрепликацию 556

Когезины удерживают вместе хроматиды

каждой удвоенной хромосомы 556

Один из «проверочных пунктов» предотвращает

репликацию поврежденной ДНК 556

М-ФАЗА 558

M–Cdk вызывает вхождение в М-фазу и митоз 558

Конденсины помогают удвоенным хромосомам

приобрести форму, удобную для деления 559

Цитоскелет обеспечивает митоз и цитокинез 559

М-фаза условно делится на шесть стадий 560

МИТОЗ 560

Центросомы удваиваются, помогая сформировать

два полюса митотического веретена 560

Сборка митотического веретена начинается

в профазе 561

Хромосомы прикрепляются к митотическому

веретену в прометафазе 561

Хромосомы участвуют в сборке митотического

веретена 565

В метафазе хромосомы выстраиваются

на экваторе клетки 566

Page 41: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Содержание 767

Протеолиз запускает разделение сестринских

хроматид и завершение митоза 566

Хромосомы расходятся к полюсам в анафазе 567

Неприкрепленные к веретену хромосомы

блокируют разделение сестринских хроматид 568

Ядерная оболочка формируется заново

в телофазе 568

ЦИТОКИНЕЗ 569

Митотическое веретено определяет плоскость

деления клетки 569

Контрактильное кольцо животных клеток состоит

из актина и миозина 570

Цитокинез растительных клеток включает

формирование новой клеточной стенки 571

Мембранные органеллы распределяются

при делении между дочерними клетками 572

КОНТРОЛЬ ЧИСЛА И РАЗМЕРОВ КЛЕТОК 572

Апоптоз помогает регулировать число клеток

у животных 572

Апоптоз опосредуется внутриклеточным

протеолитическим каскадом 573

Программа клеточной гибели регулируется

внутриклеточными белками семейства Bcl2 575

Животным клеткам для выживания, роста

и деления нужны внеклеточные сигналы 576

Животным клеткам нужны факторы выживания,

чтобы избежать апоптоза 576

Митогены стимулируют деление клеток 577

Факторы роста стимулируют рост клеток 579

Некоторые внеклеточные сигнальные белки

подавляют выживание, деление или рост клеток 579

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 580

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 581

Глава 19. Генетика и пол 583

ПРЕИМУЩЕСТВА ПОЛОВОГО РАЗМНОЖЕНИЯ 583

При половом размножении чередуются

диплоидные и гаплоидные клетки 584

Половое размножение дает организмам

эволюционное преимущество 586

МЕЙОЗ И ОПЛОДОТВОРЕНИЕ 586

Гаплоидные клетки зародышевого пути образуются

из диплоидных клеток путем мейоза 586

При мейозе происходит спаривание гомологичных

хромосом 587

Между отцовской и материнской гомологичными

хромосомами может происходить кроссинговер 588

Спаривание хромосом и рекомбинация

обеспечивают правильную сегрегацию

гомологов 589

В результате второго деления мейоза образуются

гаплоидные дочерние клетки 589

Клетки, образующиеся в результате мейоза,

содержат перетасованную генетическую

информацию 590

При мейозе нередко происходят ошибки 592

При оплодотворении восстанавливается полный

диплоидный геном 593

МЕНДЕЛЕВСКИЕ ЗАКОНЫ НАСЛЕДОВАНИЯ 593

Мендель изучал дискретные наследственные

признаки 594

Мендель смог опровергнуть альтернативные

теории наследственности 595

Опыты Менделя впервые выявили дискретный

характер наследственности 596

Каждая гамета содержит один аллель

данного гена 597

Менделевские законы сегрегации аллелей

приложимы ко всем организмам,

размножающимся половым путем 598

Аллели генов, отвечающих за разные признаки,

наследуются независимо 599

Законы Менделя объясняются поведением

хромосом при мейозе 600

Кроссинговер можно использовать

для определения порядка расположения генов

в хромосомах 601

Мутации в генах могут вызывать потерю функции

или ее избыток 601

Каждый из нас — носитель множества

потенциально вредных рецессивных

мутантных аллелей 602

ГЕНЕТИКА КАК НАУЧНЫЙ ИНСТРУМЕНТ 602

При классическом подходе работу начинают

со случайного индуцированного мутагенеза 604

Генетический скрининг позволяет выявить мутации,

вызывающие нарушение определенного

процесса в клетке 604

Комплементационный тест позволяет установить,

произошли ли две мутации в одном

и том же гене 605

Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) служат

маркерами при генетическом картировании 606

Создание карты 607

Сцепленные группы SNP позволяют выявить

гаплотипы 608

Page 42: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

768 Основы молекулярной биологии клетки

Установление взаимосвязей 609

Гаплотипы дают ключ к нашей эволюционной

истории 610

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 611

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 612

Глава 20. Многоклеточные сообщества: ткани, стволовые клетки и рак 615

ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ МАТРИКС

И СОЕДИНИТЕЛЬНЫЕ ТКАНИ 616

Растительные клетки имеют жесткие клеточные

стенки 617

Целлюлозные микрофибриллы придают

растительной клеточной стенке прочность

на разрыв 617

Соединительные ткани животных состоят

в основном из внеклеточного матрикса 619

Соединительным тканям животных прочность

на разрыв придает коллаген 619

Клетки структурируют коллаген, который

они секретируют 621

Интегрины связывают внеклеточный матрикс

с цитоскелетом клеток 621

Гели из полисахаридов и белков заполняют объем

и противостоят сжатию 623

ЭПИТЕЛИАЛЬНЫЕ ПЛАСТЫ

И МЕЖКЛЕТОЧНЫЕ КОНТАКТЫ 624

Эпителиальные клетки поляризованы и лежат

на базальной пластинке 625

Плотные контакты препятствуют прохождению

веществ между клетками эпителия и разделяют

их на апикальную и базальную поверхности 626

Контакты, связанные с цитоскелетом, прочно

соединяют эпителиальные клетки друг с другом

и с базальной мембраной 626

Щелевые контакты позволяют клеткам

обмениваться ионами и малыми молекулами 629

ПОДДЕРЖАНИЕ ЦЕЛОСТНОСТИ ТКАНЕЙ

И ИХ САМООБНОВЛЕНИЕ 632

Ткани состоят из смеси многих типов клеток 632

Различные ткани обновляются с разной скоростью 634

Стволовые клетки — постоянный источник

терминально дифференцированных клеток 634

Для поддержания популяций стволовых клеток

служат специальные сигналы 636

Стволовые клетки можно использовать

для восстановления поврежденных тканей 637

С помощью терапевтического клонирования

можно получать персонализированные

эмбриональные стволовые клетки 638

РАК 640

Раковые клетки размножаются, проникают

сквозь ткани и образуют метастазы 640

Эпидемиология выявляет причины онкологических

заболеваний, в некоторых случаях позволяя

их предотвратить 641

Онкологические заболевания возникают

из-за накопления мутаций 642

Трансформированные клетки приобретают

свойства, которые дают им конкурентное

преимущество 643

В развитии злокачественных опухолей принимают

участие многие группы генов 644

Виновны в соучастии 646

Бескрылые мухи 646

Рак кишечника — иллюстрация того, как утрата

функции гена может приводить к развитию

злокачественной опухоли 646

Байки из склепа 648

Изучение клеточной биологии трансформированных

клеток позволяет разработать новые способы

лечения 648

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ 650

ВОПРОСЫ В КОНЦЕ ГЛАВЫ 651

Ответы 653

Словарь 719

Указатель терминов 751

Page 43: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Аминокислоты и их символы Кодоны

ДЛИНА1 км (километр) = 103 м1 м (метр) 1 см (сантиметр) = 10–2 м1 мм (миллиметр) = 10–3 м1 мкм (микрометр) = 10–6 м1 нм (нанометр) = 10–9 м1 А (Ангстрем) = 10–10 м

МАССА1 кг (килограм) = 103 г1 г (грам)1 мг (миллиграм) = 10–3 г1 мкг (микрограм) = 10–6 г1 нг (нанограм) = 10–9 г

ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ КОНСТАНТЫ, ПРЕОБРАЗОВАНИЯ И ОПРЕДЕЛЕНИЯ1 моль = 6,02 х 1023 молекулы1 кал (калория) = количество теплоты, необходимое для нагревания 1 г воды на 1 °С1 Дж (джоуль) = 0,239 кал1 ккал (килокалория) = 103 кал = 4,18 кДж (килоджоулей)1 л воды = 1 кг (при 4 °С)1 Да (дальтон) = приблизительно равен массе одного атома водорода (1,7 х 10–24 г) 1 кДа (килодальтон) = 103 Дамасса Земли = 1024 кггеном бактерии = 0,5 – 5 х 106 пар нуклеотидов, в зависимости от организмагеном человека = 3 х 109 пар нуклеотидов (гаплоиды)

аспартат Asp D GAC GAU

глутамат Glu E GAA GAG

аргинин Arg R AGA AGG CGA CGC CGG CGU

лизин Lys K AAA AAG

гистидин His H CAC CAU

аспарагин Asn N AAC AAU

глутамин Gln Q CAA CAG

серин Ser S AGC AGU UCA UCC UCG UCU

треонин Thr T ACA ACC ACG ACU

тирозин Tyr Y UAC UAU

аланин Ala A GCA GCC GCG GCU

глицин Gly G GGA GGC GGG GGU

валин Val V GUA GUC GUG GUU

лейцин Leu L UUA UUG CUA CUC CUG CUU

изолейцин Ile I AUA AUC AUU

пролин Pro P CCA CCC CCG CCU

фенилаланин Phe F UUC UUU

метионин Met M AUG

триптофан Trp W UGG

цистеин Cys C UGC UGU

СТОП%кодоны UAA UAG UGAПолярные отрицательно заряженные аминокислоты показаны зеленым.Полярные положительно заряженные аминокислоты показаны серым.Полярные незаряженные аминокислоты показаны оранжевым.Неполярные – голубым.

ОБЪЕМ1 л (литр) = = (10–1 м)3

1 мл (миллилитр) = 10–3 л = (10–2 м)3 = 1 см3

1 мкл (микролитр) = 10–6 л = (10–3 м)3 = 1 мм3 1 нл (нанолитр) = 10–9 л = (10–4 м)3

КОНЦЕНТРАЦИЯ1 М (моль) = 1 моль/л = 6,02 х 1023 молекул/л1 мМ (миллимоль) = 10–3 М1 мкМ (микромоль) = 10–6 М1 нМ (наномоль) = 10–9 М

Page 44: ОСНОВЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ КЛЕТКИbinom-press.ru/books_1/biology/osnovy_mol_biologii... · 2016-07-29 · Вкладка 4-6 Разделение

Авторы широко известной книги «Молекулярная биология клетки», впервые вышедшей в русском переводе в 1986 –1987 гг. и выдержавшей несколько из-даний, предлагают читателям краткое изложение основ молекулярной кле-точной биологии. Трудно переоценить значение этих популярных книг, взрас-тивших не одно поколение ученых как в нашей стране, так и за рубежом и содержащих наряду с основами молекулярной биологии сведения о новей-ших достижениях этой науки. По традиции вся информация представлена ло-гично и увлекательно, использованы красочные иллюстрации и схемы. Книга написана простым и доступным языком. Она станет незаменимым помощни-ком и живым собеседником для каждого студента, изучающего данный курс. Вопросы к основному тексту обязательно заставят задуматься, вернуться и перечитать материал.

«Основы молекулярной биологии клетки» можно рекомендовать в качестве учебника для студентов и аспирантов молекулярно-биологического профи-ля, а также для слушателей курсов по таким специальностям, как клеточная биология, генетика, гистология, эмбриология, общая физиология и др. Книга будет полезна школьным учителям и преподавателям вузов при подготовке к занятиям, а также старшеклассникам, интересующимся предметом.

К книге прилагается компакт�диск,содержащий материалы печатного издания


Recommended