Dr. M. Qaiser FatmiMolecular Modeling/Computational Chemistry/Structural Bioinformatics/Organic ChemistryAssistant Professor Department of Biosciences, CIIT, Park Road, Chak Shahzad, Islamabad, Pakistan +92­334­304­3093 qaiser.fatmi@c   omsats.edu.pk   

JOB EXPERIENCES

Highlights:• Over 7.5 years of Post PhD Job experiences in United States and Pakistan.• The case for Associate Professorship is under progress.

Job Details:

January 2013 – September 2013 In­Charge Department of Biosciences, COMSATS Institute of Information Technology, Islamabad, Pakistan

July 2011 – Present Assistant Professor, COMSATS Institute of Information Technology, Islamabad, Pakistan

February 2011 – July 2011 Short­term Visiting Foreign Faculty, Quaid­i­Azam University, Islamabad, Pakistan 

June 2008 – October 2010 Post­doc Research Employee, University of California, Riverside, USA

March 2007 – May 2008 Research Officer, University of Karachi, Pakistan 

QUALIFICATION

Ph.D. (March 2007)Computational Chemistry/Molecular ModelingInstitute for General, Inorganic and Theoretical Chemistry,University of Innsbruck, Austria.

M.Phil. course 2002  First DivisionAdvance Organic Chemistry,H.E.J. Research Institute of Chemistry,International Centre for Chemical & Biological Sciences,University of Karachi, Pakistan.

M.Sc. 2001  First DivisionOrganic ChemistryUniversity of Karachi, Pakistan.

B.Sc. 1998  First DivisionChemistry, Microbiology, BiochemistryUniversity of Karachi, Pakistan.

ADMINISTRATIVE EXPERIENCES

Highlights:

• Over 7 years of university/departmental/group administration experiences.• Awarded honorarium for the excellent performance in 2013 by the university.• Awarded appreciation letter for actively organizing Vice Chancellor meeting during 2012.

Job Details:

# Title for Administrative Posts Period Main Job Description

01 Member Departmental Academic Regulatory Committee (DARC), CIIT

FA13 ­ Present • Overview course distribution to Faculty• Monitor the quality of teaching and lab.• Evaluate exam paper and marks distribution• Monitor students attendance• Monitor online portal• Address any teaching problem reported by 

students• Report to Convener

02 In­charge Admission Campaign Biosciences Department, CIIT

FA13 ­ Present • Run admission campaign• Meet students in colleges and schools• Invite students for demonstration• Report to HoD

03 Member Examination Panel Undergraduate/Graduate Bioinformatics, CIIT

FA13 ­ Present • Assess the quality of research and presentation of BS/MS thesis

• Grading• Report to Convener

04 Convener Interview Panel for MS Bioinformatics Admission, CIIT

FA13 ­ Present • Evaluate the eligibility and ability of students

• Based on merit, recommend student for admission

• Report to HoD

05 Team Leader Bioinformatics Division, CIIT

SP13 ­ Present • Review and improve curricula• Introduce new courses and degree programs• Meeting bioinformatics faculty members 

periodically• Resolve students' issues related to research, 

career etc

06 In­charge (Head) Department of Biosciences, CIIT

Jan 2013 ­ Sep 2013

• Run Biosciences Department• Report to Director

07 Member Review Committee for Exam disputed paper other than cheating, CIIT

SP13 ­ FA13 • Resolve the issue related to disputed exam papers

• Report to the Convener

08 In­charge Undergraduate Program of Biosciences, CIIT

FA11 ­ FA12 • Course distribution to faculty• Prepare semester schedule and time table• Prepare examination date sheet• Resolve all students' issues related to 

academia, teaching and research• Report to HoD

09 Student Counsellor, CIIT  FA11 ­ Present • Meet students periodically• Resolve students' issues• Motivate students for academia, sports, 

career etc• Report to HoD

10 In­charge Departmental Transport Committee, CIIT

FA11 ­ FA11 • Arrange transport for students and faculty for official purpose

• Arrange transport for study tour and fun trips

11 Any other Duty Assigned by the HoD, CIIT

FA11 ­ Present • Any short­term job

12 Lab Administration, UCR, USA Jun 2008 – October 2010

• Linux machine administration• Software installation and networking• Facilitate other lab researcher• Report to Advisor (PI)

TEACHING EXPERIENCES

Highlights:

• Over 3.5 years of teaching experiences in Chemistry, Bioinformatics and Computational Chemistry at university level students.

• Mode of teaching is English.• Student teaching evaluation is ''Excellent''.• Designed ''Biomolecular Modeling'' course for MS/PhD students during 2012.• Designed ''Computational Neuroscience'' course for PhD students during 2014.• Designed ''Mathematical and Computational Modeling in Cell Biology'' course for PhD 

students during 2014.• Designed and developed scheme of studies for new PhD Bioinformatics Program.

Course Details:

Semester Level Course title Credit hours

FA13MS/PhD  • Special Topics in Bioinformatics 3(3,0)

BS • General Chemistry with lab 4(3,1)

SP13 MS/PhD  • Biomolecular Modeling with lab 3(2,1)

FA12 MS/PhD • Protein Chemistry 4(4,0)

SP12 BS BS

• General Chemistry with lab• Bioinformatics Colloquium 

4(3,1)1(1,0)

FA11

BS MS/PhDMSMS/PhD

• Bioinformatics Colloquium• Special Topics in Bioinformatics• Bioinformatics• Protein Chemistry

1(1,0)2(2,0)4(4,0)4(4,0)

SP11MPhil/PhD • Computational Chemistry 3(3,0)MSc • Retro­synthesis 3(3,0)

RESEARCH EXPERIENCES

Highlights:

• Over   14   years   of   research   experiences   in   Organic   Chemistry,   Bioinformatics   and Computational Chemistry.

• Over   7.5   years   of   post   PhD   research   experiences   in   Bioinformatics   and   Computational Chemistry.

• Research Team Leader for Computational Biology and Bioinformatics Group (CBBG).

• Research Productivity Award 2013 by COMSATS Institute of Information Technology.• Published 21 papers in ISI­indexed impact factor journals.

Dissertation Titles:

• Ph.D. Molecular Dynamics Simulations of Industrially and Biologically Relevant Ions.• M.Sc. Microbial Transformation of Steroids and Antibiotic.

Team Leader ''Computational Biology and Bioinformatics Group (CBBG)'':

• Establishing Research labs.• Introducing PhD Bioinformatics Programs• Bioinformatics Accreditation from National Computing Education Accreditation Council 

(NCEAC), Higher Education Commission (HEC) Pakistan 

Research Interest:

• Protein structure dynamics and function• Structure and Ligand based drug/inhibitor discovery• Biomolecular modeling and simulations• Chemoinformatics and Structural bioinformatics• Quantum mechanics and semi­empirical calculations• Database and tools development • Organic chemistry and computational organic chemistry

Research Collaborations:

• National:◦ HEJ Research Institute of Chemistry, International Centre for Chemical and 

Biological Sciences (ICCBS), University of Karachi, Karachi◦ Centre of Excellence for Molecular Biology (CEMB), The University of Punjab, 

Lahore◦ Department of Chemistry, GC University, Lahore◦ Department of Chemistry, Quaid­e­Azam University, Islamabad◦ Department of Plant Breeding & Genetics ­ PMAS­Arid Agriculture University, 

Rawalpindi◦ Department of Chemistry, University of Faisalabad, Faisalabad◦ COMSATS Institute of Information Technology, Abbottabad Campus

• International:◦ Faculty of Pharmacy, Universiti Teknologi MARA (UiTM), Malaysia. ◦ Atta­ur­Rahman Institute for Natural Products Discovery (AuRIns), Universiti 

Teknologi MARA (UiTM), Malaysia.◦ Department of Biophysics, School of Medicine, Bahcesehir University, 

Istanbul, Turkey◦ Department of Chemical and Biological Engineering, Koc University, Istanbul 

Turkey

Research Funding:

# Title of the Project Investigator Funding Agency

Amount in Million PKR

Status

01 Thermostability and Thermoactivity of Tryptophan Synthase: An In Silico Study

PI PSF 2 Approved in July 2014

02 Battle Against Cancer: In Silico Discovery of Potential Tyrosine Kinase Inhibitors 

PI HEC 5.84 Under Review

03 Identification of microRNAs as a diagnostic method in chronic kidney disease patients and in silico discovery of their potential regulators

Co­PI HEC 2.59 Under Review

04 Structural Studies of Nitric Oxide Signaling: A Computational Approach for Discovering Cure of Cardiovascular Disorders

Co­PI HEC 2.57 Under Review

05 Strengthening Biotechnology Industry in the Country: Developing an educational tool kit for training undergraduate students as well as for research purposes: Lab to Commercialization

Co­PI HEC 8.53 Under Review

Supervision of Research Students:

# Student's Name Dissertation Title Status

PhD Student01 Shahr Bano Mirza

(SP13­PBS­002)Identification   and   Development   of   Antiviral   Agents   Against Dengue   Virus   using   Designed   Automated   Workstation   and Bioassay­Guided Studies.

Under Progress

02 Andleeb Zahra(FA13­PBS­006)

Detection   of   Oral   Cancers   at   Early   Stages   using   miRNA Profiling.

Under Progress

MS Students

03 M. Taimoor Khan(SP14­RBI­007)

Synopsis under preparation (Development of drug candidates for Asthma)

Under Progress

04 Ayesha Kanwal Synopsis   under   preparation   (Development   of   HCV   protein inhibitor – structure­based)

Under Progress

05 Tamseela Synopsis   under   preparation   (Development   of   HCV   protein inhibitor – ligand­based)

Under Progress

06 Sadaf Shaheen(FA13­RBI­003)

Synopsis under preparation (Agrochemicals for Tomato yellow leaf curl virus disease – structure­based techniques)

Under Progress

07 Aasia Saleem Khan(FA13­RBI­001)

Synopsis under preparation (Agrochemicals for Tomato yellow leaf curl virus disease – ligand­based techniques)

Under Progress

08 Ammarah Anwar(FA13­RBI­004)

Synopsis under preparation (Protein binding pocket comparison) Under Progress

09 Amina Khan(FA13­RBI­005)

Synopsis under preparation (Obesity related renal diseases) Under Progress

10 Maryam Latif(FA11­RBI­001)

Probing   Ligand   Interactions   with   different   –Glucosidaseα  Orthologs

SP13 (Completed)

11 Rashid Hussain(FA11­RBI­002)

Rationalizing   Ligand­Protein   Interactions   for   Cholinesterase Inhibitors Using Computational Methods

SP13 (Completed)

12 Ayesha Babar(FA11­RBI­003)

In Silico Identification of Src Tyrosine Kinase Inhibitors SP13 (Completed)

BS Students

13 Khushboo Akhlaq Flexible Docking for p­glycoprotein Under Progress

14 Sumaira Malik miRNA­protein complex (peptide designing) Under Progress

15 Itrat Rubab miRNA­protein complex (virtual screening) Under Progress

16 Mahrukh Imtiaz Virtual screening for Dengue viral E protein. Under Progress

17 Kamilia Tasleem Virtual screening for Dengue viral NS protein. Under Progress

18 Hira Batool  GraphMD: A python Based Interface for the Graphical Analysis of Molecular Dynamics Simulations' Results of Proteins and their Complexes

FA13 (Completed)

19 Abeerah Nawaz (SP08­BSB­002 )

The Effect  of  Different  DNA Gyrase Conformations  on Ligand Binding 

FA12 (Completed)

20 Adil Bhatti(FA08­BSB­004)

Identification   of   Spleen   Tyrosine   Kinase   Inhibitors   using Structure­Based   Drug   Design   Approaches   and   Preliminary Studies of Mutational Dynamics

SP12 (Completed)

21 Ammarah Anwar (FA08­BSB­046 )Sana Vaqar (FA08­BSB­030 )

Structural and Dynamical Comparison of Hyperthermophilic and Mesophilic   Tryptophan   Synthase:   Probing   through   Molecular Dynamics Simulations and Molecular Docking Studies

SP12 (Completed)

Co­Supervision of Research Students:

# Student's Name Dissertation Title Status

PhD Students

01 Sara KhanCIIT Abbottabad

Exploring   the   driving   forces   responsible   for   the   stability   of hyperthermophilic tryptophan synthase.

Under Progress

02 Sadia NazCIIT Abbottabad

Identification of prospective inhibitors for tryptophan synthase to combat tuberculosis.

Under Progress

MS Students

03 Shahr Bano Mirza(FA11­RBI­004)

3D Structure Optimization and Database Development for Pakistani Relevant Natural Products and their Derivatives

SP13 (Completed)

BS Students

Over 17 students have been co­supervised

Research Publications:

# Articles/Letters/Communications Journal Territory

ImpactFactor

21 Synthesis of Novel Inhibitors of  α­Glucosidase Based on Benzothiazole Skeleton Containing Benzoydrazide Moiety and their Molecular Docking Studies.Muhammad Taha, Nor Hadiani Ismail,  Salima Lalani,  M. Qaiser Fatmi,  Khalid Mohammed Khan, Salman Siddiqui, Momin Khan, Muhammad Iqbal ChoudharyEur. J. Med. Chem. (2014) Minor Revision Submitted

FRANCE 3.346

20 Theoretical   Calculations   on   Hydroxybutyl   4­aroyloxybenzoates:   Synthesis   and Mesomorphic Properties of their H­bonded Complexes with poly(4­vinylpyridine).Khushi Muhammad, M. Qaiser Fatmi, Shahid HameedMol. Cryst. Liq. Cryst., 593, 93–103, (2014). 

ENGLAND 0.496

19 Synthesis,   Molecular   docking   studies,   and  in   vitro  screening   of   barbiturates/ thiobarbiturates as antibacterial and cholinesterase inhibitors.Saira   Mumtaz,   Rashad   Hussain,   Abdul   Rauf,   H.   Bokhari,  M.   Qaiser   Fatmi, Michael Oelgemöller, A. M. QureshiMed. Chem. Res., 23, 2715­2726, (2014). 

UNITED STATES

1.612

18 Synthesis, biological evaluation and molecular docking of N'­(1­(phenylsulfonyl) piperidine­4­carbonyl)sulfonohydrazide derivatives.Hira   Khalid,   Aziz­ur­Rehman,   Muhammad   Athar   Abbasi,   Rashad   Hussain, Mohammad Khalid Khan, Muhammad Ashraf, Syeda Abida Ejaz, M. Qaiser FatmiTurk. J. Chem., 38, 189­201 , (2014).

TURKEY 0.888

17 In   silico  prediction   of   regulatory   elements   and   corresponding   protein­DNA interaction in plant promoters.Madiha Tanveer, Hina­ur­Razaq Qureshi, M. Qaiser Fatmi, Tayyaba YasminPak. J. Bot., 45, 309­319 (2013)

PAKISTAN 0.907

16 Fungal   Transformation   of   Cedryl   Acetate   and   ­Glucosidase   Inhibition   Assay,α  Quantum   Mechanical   Calculations   and   Molecular   Docking   Studies   of   its Metabolites.Sadia   Sultan,  M.   Iqbal   Choudhary,   Shamsun   Nahar   Khan,  Urooj   Fatima, 

FRANCE 3.346

Muhammad Atif, Rahat Azhar Ali, Atta­ur­Rahman, M. Qaiser FatmiEur. J. Med. Chem. 62, 764­770 (2013)

15 X­Ray and NMR crystallography in an enzyme active site: the indoline quinonoid intermediate in tryptophan synthase.Jinfeng Lai, Dimitri Niks, Yachong Wang, Tatiana Domratcheva, Thomas Barends, Ryan Olsen, Douglas Elliot, M. Qaiser Fatmi, Chia­en A. Chang, Ilme Schlichting, Michael F. Dunn and Leonard J. Mueller.J. Am. Chem. Soc., 133, 4­7 (2011)

UNITED STATES

9.907

14 Kinetics of reduction of thionine with ribose and structural properties of dye at different pH using DFT methods.Khalid Ahmed, Rafia Azmat, Fahim Uddin, M. Qaiser Fatmi.Chin. J. Chem., 29, 643­649 (2011)

CHINA 0.755

13 The role of oligomerization and cooperative regulation in protein function: The case of tryptophan synthase.M. Qaiser Fatmi, Chia­en A. Chang.PLoS Comput. Biol., 6, (2010),  DOI: 10.1371/journal.pcbi.1000994

UNITED STATES

5.215

12 T­Analyst: A program for efficient analysis of protein conformational changes.Rizi Ai, M. Qaiser Fatmi, Chia­en A. Chang.J. Comput­Aided Mol. Des., 24, 819­827 (2010)

NETHER­LANDS

3.386

11 The   Stability   of   [Zn(NH3)4]2+  in   Water:   A   Quantum   Mechanical/Molecular Mechanical Molecular Dynamics Study.M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernd M. Rode.Phys. Chem. Chem. Phys., 12, 9713­9718, (2010)

ENGLAND 3.573

10 Classical  and QM/MM MD Simulations of  Sodium(I)  and Potassium(I)   ions  in aqueous solution.S. Sikander Azam, Zaheer­ul­Haq, M. Qaiser Fatmi.J. Mol. Liq., 153, 95­100 (2010)

NETHER­LANDS

1.580

09 Synergistic Regulation and ligand­induced conformational changes of tryptophan synthase.M. Qaiser Fatmi, Rizi Ai, Chia­en A. Chang.Biochemistry, 48, 9921­9931 (2009)

UNITED STATES

3.422

08 Exploring   structure   and   dynamics   of   the   diaquotriamminezinc(II)   complex   by QM/MM MD simulation.M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.J. Phys. Chem. B, 112, 5788­5794 (2008). 

UNITED STATES

3.696

07 Stability of different zinc(II)­diamine complexes in aqueous solution with respect to structure and dynamics: A QM/MM MD study.M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.J. Phys. Chem. B, 111, 151­158 (2007).

UNITED STATES

3.696

06 Quantum mechanical charge field (QMCF) molecular dynamics simulation of the TiO2+ ion in aqueous solution.M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.J. Comput. Chem., 28, 1704­1710 (2007).

UNITED STATES

4.583

05 Temperature   effects  on   the   structural   and  dynamical  properties  of   the  Zn(II)­water complex in aqueous solution: A QM/MM molecular dynamics study.M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.J. Phys. Chem. B, 110, 616­621 (2006).

UNITED STATES

3.696

04 Structure and dynamics of the [Zn(NH3)(H2O)5]2+  complex in aqueous solution obtained by an ab initio QM/MM molecular dynamics study.M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.Phys. Chem. Chem. Phys., 8, 1675­1681 (2006).

ENGLAND 3.573

03 A QM/MM MD simulation study of hydrated Pd2+.S.  Adnan Ali  Shah,  Thomas S.  Hofer,  M.  Qaiser Fatmi,  Bernhard R.  Randolf, Bernd M. Rode.

NETHER­LANDS

2.337

Chem. Phys. Lett., 426, 301­305 (2006)

02 The microbiological hydroxylation of levonorgestrel.Muhammad Iqbal  Choudhary,  Muhammad Atif,  Sarfaraz A.  Nawaz,  M.  Qaiser Fatmi, Atta­ur­Rahman.Nat. Prod. Res., 20, 1074­1081 (2006).

ENGLAND 1.009

01 An Extended ab initio QM/MM MD approach to structure and dynamics of Zn(II)  in aqueous solution.M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.J. Chem. Phys., 123, 54514­54521 (2005).

UNITED STATES

3.333

Research Posters:

• "The role of oligomerization and synergistic regulations in tryptophan synthase's function."M. Qaiser Fatmi and Chia­en A. Chang.São Paulo School of Advanced Science (ESPCA), Campinas, São Paulo, Brazil(April 1­6, 2012).

• "Discovering Drug Candidates for the alpha­subunit of Tryptophan Synthase: From Docking, Molecular Dynamics Simulations, to Experiments."M. Qaiser Fatmi,  Wai M. Thant,  Sunny Lee,  Demetri  Niks,  Michael F.  Dunn,  Chia­en A. Chang.239th ACS National Meeting & Exposition, San Francisco, California, USA(March 21­25, 2010).

• "Application  of   the  new  quantum mechanical   charge   field   (QMCF)  molecular  dynamics formalism to structure and dynamics of TiO2+ complex."M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.42nd Symposium on Theoretical Chemistry, Humboldt University, Erkner, Germany(Sep. 3­6, 2006).

• "QM/MM   MD   Simulation   Study   of   the   Pentaquozinc(II)­amine   Complex   in   Aqueous Solution"M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.10th International Symposium on Natural Product Chemistry (ISNPC­10), Karachi, Pakistan(Jan. 6­9, 2006).

• "An   extended   ab   initio   QM/MM   MD   simulation   of   Zn(II)   in   aqueous   solution   and temperature effects on the structure and dynamics of [Zn(H2O)6]2+ complex."M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.2nd Annual CMBI Meeting (Center for Molecular Biosciences Innsbruck), Vill, Austria (Sep. 30­ Oct. 7, 2005).

• "An   extended   ab   initio   QM/MM   MD   simulation   of   Zn(II)   in   aqueous   solution   and temperature effects on the structure and dynamics of [Zn(H2O)6]2+ complex."M. Qaiser Fatmi, Thomas S. Hofer, Bernhard R. Randolf, Bernd M. Rode.41st Symposium on Theoretical Chemistry, University of Innsbruck, Innsbruck, Austria (Sep. 5­7, 2005).

• "Microbial Transformation of Deoxycholic Acid."M. Qaiser Fatmi, M. Iqbal Choudhary, Farzana Shaheen, Atta­ur­Rahman.H.E.J.­COMSTECH (CPC)­TWAS International Workshop on the development of medicines from plants, University of Karachi, Karachi, Pakistan(Sep. 8­13, 2003).

• "Stereo­ and Regio­selective Microbial Transformation of Norgestrel."M. Qaiser Fatmi, M. Iqbal Choudhary, Atta­ur­Rahman, Farzana Shaheen.3rd  International and 13th  National Chemistry Conference,  University of Karachi,  Pakistan (Dec. 28­31, 2002).

• "Fungal Transformation of 4­Androstene­3,17­dione."M.  Qaiser  Fatmi,  M.   Iqbal  Choudhary,  Sadia  Sultan,  Rahat  Azhar  Ali,  Atta­ur­Rahman, Farzana Shaheen.7th Eurasia Conference on Chemical Sciences, Karachi, Pakistan(March 9­12, 2002).

• "Microbial Oxidation of 4­Androstene­3,17­dione."M.  Qaiser  Fatmi,  M.   Iqbal  Choudhary,  Sadia  Sultan,  Rahat  Azhar  Ali,  Atta­ur­Rahman, Farzana Shaheen.2nd  International and 12th  National Chemistry Conference, University of Sindh, Jamshoro, Pakistan(Feb. 4­6, 2002).

• "Glycolysis and TCA Cycle."M. Qaiser Fatmi.Science Exhibition of Federal Government Urdu Science College, Karachi, Pakistan (1998). 

COMMUNITY SERVICES

Journal Reviewer:

• Pakistan Journal of Chemistry• PLoS One• Bioinformatics• European Journal of Medicinal Chemistry

Member:

• Jury Member for National Awards of Young Scientists (NAYS) since 2011• Member National Testing Services (NTS) for Bioinformatics since 2013• Nominated Member for National Curriculum Revision Committee (NCRC) of Higher 

Education Commission Pakistan in 2014.

Workshop Organization:

• "Workshop on Molecular Modeling in Chemistry and Beyond"Department of Chemistry, Quaid­i­AzamUniversity, Islamabad, Pakistan,(May 27­29, 2011).

• "Workshop on In Silico Tools in Medicinal Chemistry"Department of Chemistry, Quaid­i­AzamUniversity, Islamabad, Pakistan,(Dec. 22­25, 2011).

ACHIEVEMENTS

• Honorarium for the good academic and administrative performance during year 2013 by COMSATS Institute of Information Technology.

• Research Productivity Award 2013 by COMSATS Institute of Information Technology.

• Letter  of  Appreciation  for   the  valuable  contribution  in   the Organization of   “2  Day Vice Chancellors'   forum   on   Higher   Education   in   the   Islamic   World:   Challenges   and Opportunities”   jointly   organized   by   ISESCO,   MoST   HEC,   FUIW   and   CIIT,   Islamabad, Pakistan (11th to 12th June 2012).

• Awarded   Fund   to   Attend   a   Course   on   “Advanced   Topics   in   Computational   Biology– Agrochemicals and Drug Design”, Conducted by Prof. Dr. Goran Neshich at Embrapa, São Paulo School of Advanced Science (ESPCA), Campinas, São Paulo, Brazil (1st  to 6th  April 2012). 

• HEJ start up grant (2007­2008)

• Science and Technology Grant South East Asia (Doctoral Programme, 2004­2007),Scholarships of the Austrian Federal Ministry for Education, Science and Culture, through the Austrian Council for Science and Technology Development

• HEJ Fellowship (2001­2003)

• First   Prize:  Poster   presentation   entitled  “Fungal   Transformation   of   4­Androstene­3,17­dione”,M. Qaiser Fatmi et al.2nd International and 12th National Chemistry Conference, University of Sindh,Jamshoro, Pakistan (4th to 6th February 2002).

• Third Prize: Model presentation “Microwave oven”,M. Qaiser Fatmi.Science Exhibition of Federal Government Urdu Science College (1998).

COMPUTER/SOFTWARE SKILLS

Operating Systems: Linux and Windows (installation and administration)Language Skills:  Perl (beginner), shellSoftware: Discovery Studio, MOE, Gaussian, Turbomol, NAMD, Amber, 

Hyperchem,  AutoDock,  Gold,  Vdock,  Catalyst,  LigandScout,  VMD, MOLVISION, Pymol, Chimera and other computational tools.

CERTIFICATE COURSES ATTENDED

• “Advanced Topics in Computational Biology – Agrochemicals and Drug Design”,Conducted by Prof. Dr. Goran Neshich at Embrapa, São Paulo School of Advanced Science (ESPCA), Campinas, São Paulo, Brazil(1st to 6th April 2012). 

• “Students'   Counseling   for   Teachers”   conducted  by   Faculty   Development   Academy,  CIIT Islamabad.

(8th to 12th August 2011). 

• “An Introduction to Bioinorganic and Medicinal Chemistry of Metals”,Conducted by Dr. M. Maroof Tahir (USA) at the HEJ Research Institute of Chemistry (17th to 31st May 2003).

• “Biochemical Basis of Diabetes and Ageing”, Conducted by Dr. Nessar Ahmed (UK) at the HEJ Research Institute of Chemistry (15th to 24th April 2003).

• “Animal Cell Culture”, Conducted by Dr. Rafat Ali Siddiqui (USA) at the HEJ Research Institute of Chemistry(23rd December 2002 to 3rd January 2003).

• “Lecture Series on Scientific Integrity”, Conducted by Dr. Mohsin Raza (Pak.) at the HEJ Research Institute of Chemistry (2nd to 16th September 2002).

• “Bangladesh­Pakistan Binational Seminar on Natural Product Chemistry”,Organized by HEJ Research Institute of Chemistry (24th to 26th September 2002).

ORAL TALKS

• "Protein 3D structure prediction"M. Qaiser FatmiDepartment of Chemistry, Quaid­i­Azam, University, Islamabad, Pakistan(Dec. 22­25, 2011).

• "Introduction to molecular mechanics and its applications"M. Qaiser FatmiDepartment of Chemistry, Quaid­i­Azam, University, Islamabad, Pakistan(May 27­29, 2011).

• "Homology modeling of alpha­glucosidase"M. Qaiser FatmiDepartment of Chemistry, Quaid­i­Azam University, Islamabad, Pakistan(May 27­29, 2011).

• "Driving forces behind allosteric and synergistic regulations in tryptophan synthase"M. Qaiser Fatmi, Rizi Ai, Chia­en A. Chang.239th ACS National Meeting & Exposition, San Francisco, California, USA (March 21­25,2010).

• "Synergistic regulation and ligand­induced conformational changes of tryptophan synthase."M. Qaiser Fatmi, Chia­en A. Chang.237th ACS National Meeting & Exposition, Salt Lake City, Utah, USA (March 22­26, 2009).

SCIENTIFIC MEMBERSHIP

• American Chemical Society (Active member 2008 ­ 2011)