Date post: | 18-Jul-2015 |
Category: |
Health & Medicine |
Upload: | veab |
View: | 685 times |
Download: | 0 times |
EPIGENETIKAI ÉS GENETIKAI VIZSGÁLATOK FOLLICULÁRIS LYMPHOMÁBAN:
EZH2 mutációk, Hiszton és DNS metiláció
Bödör Csaba
[email protected]ém, 2010. november 18.
1, Institute of Cancer, Barts and The London School of Medicine and Dentistry,
2, Semmelweis Egyetem, 1. Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet
Bevezetés – Epigenetika
Bevezetés – Epigenetika
Az Epigenetikai Kód
DNS metiláció
Hiszton modifikáció (metiláció, acetyláció, foszforiláció)
DNS metiláció
Hiszton metiláció
DNMT
PRC2
Hiszton metiláció: PRC2 komplex Polycomb Repressive Complex 2 (EZH2, EED, SUZ12)
EZH2: HMTáz aktivitás
Transzkripció repressziója embrionális őssejtekben
Reaktiváció a differenciáció során
SUZ12
EZH2
EED
H3K27me3 transzkripciós represszor
UTX
H3K27
DNMT
DNS metilációval való kapcsolat
EZH2
EZH2 fiziológiás és patológiás szerepe
Fiziológiás
Daganatokban
• Fokozott expresszió (mRNS és/vagy fehérje) és kedvezőtlen prognosztikus szerep prosztata-, emlő-, tüdődaganatokban
Lehetséges onkogén szerep
• Hiszton és DNS metiláció
• Fokozott expresszió a centrum germinativumban
• Korai B-sejt fejlődés, Immunglobulin génátrendeződés
DNMTEZH2
EZH2 Y641 mutációk GC lymphomákban
EZH2 Y641 kodon mutációi FL 8%-ában (Nature Genetics, 2010)
Mutáció a kulcsfontosságú SET katalikus doménben
GC specifikus !
● Tirozin szubsztitúció (Y641N, Y641F, Y641H, Y641S)
Morin és mtsai, Nat Gen, 2010
Metiltranszferáz aktivitás csökkenés Funkcióvesztés (in vitro!)
EZH2
H3K27me3 transzkripciós represszor
X X
Tumor szupresszor szerep FL-ben ??
de …. !
G A A T A/T C T G T
Y641F
G A A T/A A C T G T
G A A T/C A C T G T
Y641N
Y641H
G A A T A/C C T G T
Y641S
D1 D2 CXC SET
Y641N (8), Y641F (14), Y641H (3),Y641S (1)
EZH2 Y641 mutációk: Saját eredmények
26 mutáció 221 vizsgált beteg esetében (12%)
31 FL és tFL mintapár analízise: 9 mutáció (29%)
0 10 20 30 400
20
40
60
80
100EZH2 mutated (n=26)
EZH2 w ild-type (n=195)
P = .18
Overall survival (years)
Pro
po
rtio
n a
live
EZH2 Y641 mutációk: Mechanizmus?
Megváltozik-e a gén expressziója (EZH2) a mutációk hatására ?
Változik-e a globális DNS metilációs profil a mutációk hatására ?
Milyen hatással vannak a mutációk a H3K27 trimetilációra ? Valóban funkcióvesztés?
Mutáns és vad típusú GC B-sejtvonalak
FL szövetminták
EZH2 Y641 mutációk: Mechanizmus?
Megváltozik-e a gén expressziója (EZH2) a mutációk hatására ?
EZH2 mRNA expression levels
0
1
2
3
4
FL, m
utated
(
n=6)
FL, w
ild-ty
pe
(n
=10)
Tonsils
(n=
4)
Rela
tive e
xpre
ssio
n (
EZ
H2 / 1
8S
rR
NA
)
SU-D
HL-
4
SU-D
HL-
6
Karpa
s-42
2
SC-1
DOHH-2
HRC57
Nc-
Nc
0
2
4
6
8 EZH2 mRNA expression levels
EZH2 mutated EZH2 wild type
Rela
tive e
xpre
ssio
n (E
ZH
2 / 1
8S
rR
NA
)
EZH2 mutáns
EZH2 vad típus
SU-DHL-4
SU-DHL-6
Karpas 422
SC-1DOHH-2
HRC57Nc-Nc
EZH2
GAPDH
FL-1FL-2 FL-3
FL-4FL-5 FL-6
Tonsil-1
Tonsil-2
Tonsil-3
Q-PCR
WB
EZH2 EZH2IHC
EZH2 Y641 mutációk: Mechanizmus?
Megváltozik-e a gén expressziója (EZH2) a mutációk hatására ?
Mi állhat a heterogén EZH2
expresszió hátterében??
MikroRNS általi szabályozás: miR-101, miR-26a
AKT kináz általi szabályozás
Ciklin dependens kinázok általi szabályozás
EZH2AKT
CDK
miR-101
miR-26a
EZH2 Y641 mutációk: Mechanizmus?
Változik-e a globális DNS metilációs profil a mutációk hatására ?
DNMTEZH2
Array (chip) alapú metilációs analízis
Mindössze 2% különbség az EZH2 mutáns és vad típusú esetek között.
EZH2 Y641 mutációk: Mechanizmus?
Milyen hatással vannak a mutációk a H3K27 trimetilációra ? Valóban funkcióvesztés?
EZH2
H3K27me3 transzkripciós represszor
XX
Kitekintés: EZH2 mutációk myeloid kórképekben
Inactivating mutations of the histone methyltransferase gene EZH2 in myeloid disorders. Ernst et al, Nature Genetics,. 2010, July 4
Somatic mutations of the histone methyltransferase gene EZH2 in myelodysplastic syndromes. Nikoloski et al, Nature Genetics,. 2010, July 4
D1 D2 CXC SET
Különböző típusú mutációk a génben, de az Y641 kodon érintetlen!!
Gyakran homozigóta mutációk >>> egyértelmű funkcióvesztés
EZH2
H3K27me3 transzkripciós represszor
XX
Makishima és mtsai, Leukemia, 2010
EZH2 Y641 mutációk: Mechanizmus?
Milyen hatással vannak a mutációk a H3K27 trimetilációra ? Valóban funkcióvesztés?
EZH2
XX ?
SU-DHL-4
SU-DHL-6
Karpas 422
SC-1DOHH-2
HRC57Nc-N
c
EZH2
H3K27me3
GAPDH
FL-1FL-2 FL-3
FL-4FL-5 FL-6
Tonsil-1
Tonsil-2
Tonsil-3WB
IHCH3K27me3
LOW HIGH
H3K27me3
Nem valószínű a funkcióvesztés, sőt… !
EZH2 Y641 mutációk: Hogyan tovább?
Valószínű a funkciószerzés, tehát az EZH2 onkogén szerepe FL-ben
o Mutáns konstrukciók szerkesztése és expressziója:
●változik-e az inaktivált gének „névsora”?
● hozzájárul-e a mutáció az FL sejtek kemorezisztenciájához?
● HMTáz és DNS metiláció gátlókkal való kezelés
● specifikus EZH2 SET domén inhibítorok
● demetilázok vizsgálata
o Az EZH2-H3K27me3 tengely egyéb szabályozói
Hamarosan: … újabb hiszton metiltranszferáz (MLL2) mutációi FL-ben!Mendez-Lago et al , ASH 2010.
Az Epigenetikai kód, Epigenetikai terápia
DNMT
HDAC
DNS metiláció
Hiszton modifikáció (metiláció, acetyláció, foszforiláció)
HMT
5-aza-2'-deoxycytidine …
Panobinostat
DZNep
(3-deazaneplanocin)
Epigenom projekt …
Köszönöm a figyelmet !