Date post: | 18-Feb-2017 |
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IMPLEMENTACIÓN DE LA BASE DE DATOS DEL BANCO NACIONAL DE GERMOPLASMA DE BOLIVIA EN
SISTEMA GRIN-GLOBAL
Dirección Nacional de InvestigaciónPrograma Nacional Recursos Genéticos
Edwin Edgar Iquize [email protected]
Abril 11 del 2016
INTRODUCCIÓN. Estado Plurinacional de Bolivia
Pando
Beni
Santa Cruz
La Paz
Cochabamba
Oruro
Potosí
Tarija
Chuquisaca
Riberalta
ChacoGran Chaco
Montero
Superficie: 1’098,581 km²
Región andina: 300.604 km² 28%
Región Valles: 142.815 km² 13%Región Llanos y Tropicales: 648,163 km² 59%
Superficie cultivada: 3’515,020 ha
Población: 10’389,913 habitantes
Oficinas de INIAF
INTRODUCCIÓN. El INIAFESTRUCTURA ORGANIZACIONAL
INTRODUCCIÓN. El INIAF
1. Trigo2. Maíz3. Hortalizas4. Quinua5. Papa6. Arroz7. Bosques8. Ganadería9. Caña de azúcar10.RRGG
INTRODUCCIÓN
La documentación de los recursos fitogenéticos a nivel mundial viene desarrollándose esfuerzos por Instituciones como
FAO, Bioversity International, Global Crop Diversity Trust, ARS-USDA, etc., yPaíses
con el fin conservar y utilizar para la alimentación y agricultura.
INTRODUCCIÓN
Bolivia también desarrollo acciones (Cárdenas, 1963) y la documentación paso por varias etapas desde registros en físico y uso de sistemas informáticos (PROCITROPICOS/IICA, 2010).
INTRODUCCIÓN
El Instituto Nacional de Innovación Agropecuaria y Forestal INIAF a partir de Julio del 2010 recibió los Recursos Genéticos de:
– Tubérculos y Raíces Andinas (Fundación PROINPA), – Granos Altoandinos (Fundación PROINPA), – Cereales, Leguminosas y Hortalizas (CIFP)– Forestales (BASFOR-UMSS) y – Camélidos (UTO) fue posterior
y con ello una base de datos en Microsoft Excel y Access (solo de Tubérculos y Raíces Andinas)
INTRODUCCIÓN
El INIAF
Fortaleció la conservación de los Recursos Genéticos con el
Proyecto de Innovación de Servicio Agrícolas PISA
con financiamiento del Banco Mundial (INIAF, 2012).
INTRODUCCIÓNPrograma Nacional de Recursos Genéticos - INIAF
SubproyectoFortalecer los procesos de conservación Ex Situ de recursos genéticos de la agrobiodiversidad, forestales, acuícolas y microorganismos relacionados con los ciclos de vida del suelo - planta.
Objetivo GeneralFortalecer los procesos de conservación ex situ de Recursos Genéticos de la Agrobiodiversidad.
Objetivo Específico……..Implementar un sistema nacional especializado de documentación y registro de datos de origen (datos de pasaporte), colecta, caracterización y evaluación de colecciones.………
Bases de datos en Microsoft Excel y Access
En base al Plan implementación del sistema de manejo de información de los recursos genéticos administrados por el INIAF-Bolivia (Iquize, 2013) se generó Base de datos en formato Microsoft Excel.
La Base de datos presenta : Tapa o inicio; Índices, Datos, Tablas y figuras con estadística descriptiva; todas ellas ligadas y cuando se incluya nuevas Accesiones en la tabla de datos las consultas podrán ser actualizadas fácilmente (Iquize, 2013; Ruiz, 2009).
RESULTADOS. Primera fase
Promoción del uso
Conservación
Documentación
Investigación o validaciones
Políticas
Pasaporte
Definición del estado de las
accesiones
Caracterización y regeneración de materiales
Inclusión en el banco de
germoplasma
Manejo de las semillas
Inventario
Col. Base Col.
Activa
Col. Trabajo
Col. In vitro
CaracterizaciónDescriptores estándares
Otras variables de interés
Regeneración
Col. en campo
Sanidad
Viabilidad
Variables importantes
Col. otro banco
Limpieza
Prot
ocol
os
Contenido humedad
Almacenamiento de datos
Mantenimiento de datos
Procesamiento y análisis de datos
Intercambio de datos
Sobre y para actividades de conservación
Otros Mejoramiento genético
Publicaciones
Identificación de moléculas
Base
s de
dato
s con
pro
toco
los
Col. Invernadero
Empaque y almacenamiento
Distribución
Monitoreo de las semillas
Distribución
Colaboración con usuarios
Conservación, otros
Proc
esam
ient
o de
info
rmac
ión
Plan implementación del sistema de manejo de información de los recursos genéticos administrados por el INIAF-Bolivia (Iquize, 2013)
Cuarentena
RESULTADOS. Primera fase
Base de datos en Microsoft Excel
RESULTADOS. Primera fase
RESULTADOS. ….. Programa Nacional de Recursos Genéticos
SubproyectoFortalecer los procesos de conservación Ex Situ de recursos genéticos de la agrobiodiversidad, forestales, acuícolas, y microorganismos relacionados con los ciclos de vida del suelo - planta.
Objetivo GeneralFortalecer los procesos de conservación ex situ de Recursos Genéticos de la Agrobiodiversidad.
Objetivo EspecíficoImplementar un sistema nacional especializado de documentación y registro de datos de origen (datos de pasaporte), colecta, caracterización y evaluación de colecciones.………
Sistema DBGermo
El INIAF había decido trabajar con el Sistema DBGermo (Versión Abril 2006 de Julio Telleria)
y la información fue vaciada parcialmente de los Bancos de Germoplasma de Papa, Oca, Papalisa, Maní, Maíz, Frijol, Tarwi, Quinua, Amaranto, Cañahua, Forestales y Camélidos (SOFAG e INIAF. 2010)
El uso del DBGermo fue ratificado en el Término de Referencia No 83 PISA-INIAF. Profesional en sistematización y manejo base de datos de los recursos genéticos (2012).
RESULTADOS. Segunda fase
Pero el Sistema DBGermo no fue utilizado, en ningún momento (2010 al 2013).
Se registro dificultades de manejo del Sistema DBGermo y requiere un sistema operativo igual o inferior a Windows XP (Iquize, 2013)
RESULTADOS. Segunda fase
Búsqueda de Sistemas para Recursos Genéticos
No se encontró información precisa de sistemas y mucho menos sobre su disponibilidad.
A través de una comunicación personal del Dr Felix Marza Programa Nacional Trigo-INIAF (2013) se indago en el portal de Bioversity International, sobre el GRIN-Global
Conociendo al Ing Alfonso Blanco por su experiencia en informática, redes, manejo base de datos y PCGrin, se le pidió su apoyo.
RESULTADOS. Segunda fase
Concurso del Ing Alfonso BlancoDe julio a diciembre 2013, inicialmente se estudió el GRIN-Global en domicilio (Cochabamba-Bolivia), en su instalación y manejo (un día por fin de semana en lo posible).
Ante las dudas, se consulto al Dr Tito Franco, vía Ing Alfonso Blanco. Pasado un tiempo el Dr facilito una guía traducida en español.
De mayo a agosto del 2014, a medio tiempo ymayo a septiembre del 2015 a tiempo completo se tuvo el concurso del Ing. bajo la figura de Prestación de servicios dentro el INIAF.
RESULTADOS. Segunda fase
Concurso del Lic Daniel ChalcoEs responsable de Sistemas del INIAF, aporto en la publicación de la Base de datos en GRIN-Global en Servidor de La Paz-Bolivia en www.iniaf.gob.bo
RESULTADOS. Segunda fase
RESULTADOS. Segunda fase
Mayo a agosto del 2014, se procedió con:
• El estudio de los manuales y manejo del GRIN-Global (ingles).
• También se consulto al Sr. Marty Reisinger miembro del comité técnico del Proyecto GRIN-Global (aproximadamente en 10 oportunidades vía email)
• Instalación del GRIN-Global, en un Servidor y un computador del INIAF-Cochabamba.
Nota: La Estación Experimental Toralapa es una sede del Programa Nacional Recursos Genéticos. Y no poseía acceso a la Web (ubicada en el área rural a 74 km carretera antigua Cochabamba a Santa Cruz).
RESULTADOS. Segunda fase
• Transferencia de datos a GRIN-Global versión 1.8.33.0 y publicada en www.iniaf.gob.bo (Blanco e Iquize, 2014)Tubérculos y Raíces– Pasaporte – Caracterización – Inventario accesiones papa (Campo, Invernadero e In vitro)– Fotos (590 de papas, oca, papalisa e isaño)
Granos Altoandinos – Pasaporte de quinua (3178 accesiones).– Caracterización 120000 datos– Fotos 274 de grano de quinua
RESULTADOS. Segunda fase
• Evaluación del Banco Mundial (junio 2014)
El Programa Nacional de Recursos Genéticos-INIAF en la Estación Experimental Toralapa, recibio la misión de evaluación del Banco Mundial, a cargo del Dr David Williams (IICA-Costa Rica).
Referente a la Base de datos concluyo que fue una medida acertada y pidió continuar.
Y se la maneja con el rótulo de Base de datos Banco Nacional de Germoplasma de Bolivia en GRIN-Global,
RESULTADOS. Segunda fase
• En septiembre del 2014, se confirmo el uso del
Sistema de documentación GRIN-Global a ARS-USDA uno de los patrocinadores del GRIN-Global (Mercado, 2014),
(cite: MDRyT/INIAF/ DGE/362-2014, La Paz 09-09-2014, dirigida al Sr. Peter Bretting. Crop Production and Protection General Biological Science Plant Germoplasm & Genomes ARS-USDA)
RESULTADOS. Segunda fase
Mayo a septiembre del 2015 • Transferencia de datos a GRIN-Global (versión 1.9.6.41) y
publicada en www.iniaf.gob.bo a junio 2015 – Granos Altoandinos
• Chenopodium quinua [quinua], • Ch. pallidicaule [cañahua], • Amaranthus caudatus [amaranto] y • Dysphania ambrosiodes [paico]
– Tubérculos y Raíces Andinas • Solanum spp. [papas], • Oxalis tuberosa [oca], • Tropaeolum tuberosum [isaño], • Ullucus tuberosus [papalisa] y • Raíces andinas),
RESULTADOS. Segunda fase
– Hortalizas • Capsicum, • Cucurbitas, • Solanum spp [tomate] y • Berenjena
– Cereales (Zea mays [maíz] y Triticum spp [trigo])– Leguminosas (Arachis hypogaea [maní], Phaseolus vulgaris
[frijol], Vicia faba [haba], Pisum sativum [arveja] y Lupinus mutabilis [tarwi])
A mayo 2016, se pretende incluir – Forestales– Pastos – Frutales
RESULTADOS. Segunda fase
• A partir de mayo del 2015, se tiene contacto y apoyo del MC Juan Carlos Alarcón Maldonado GRIN-Global, vía email y Skype, referido a:- La base de datos en GRIN-Global- En la organización y facilitación del Curso – Taller en
Cochabamba
RESULTADOS. Tercera fase
• Curso - Taller Manejo del Módulo Curador y Sitio Web del GRIN-Global y la Base de Datos del Banco Nacional de Germoplasma de BoliviaRealizada en septiembre 15 al 18 del 2015, totalizando 36 horas, en la Regional INIAF – Cochabamba Bolivia.
Participaron 22 profesionales: Curadores de Granos Altoandinos, Tubérculos y Raíces Andinas, In vitro, Cereales, Leguminosas, Hortalizas, Forestales, Pastos, Camélidos, además de profesionales del Programa Nacional de Caña, Quinua, Trigo y del Centro de Producción de Semillas de Hortalizas
La facilitación estuvo a cargo de los Ing Alfonso Blanco, Edwin Iquize y liderizado por el MC Juan Carlos Alarcón Maldonado.
Se facilitó, seis guías traducidas, presentaciones con los pasos-ejercicios y fue dinámica. Los resultados de los ejemplos y ejercicios de los participantes se visualizaban en la pantalla.
RESULTADOS. Tercera fase
RESULTADOS. Tercera fase
Participantes del Curso Taller Manejo del Módulo Curador y Sitio Web del GRIN-Global y la Base de Datos del Banco Nacional de Germoplasma de Bolivia
RESULTADOS. Tercera faseSe tiene previsto continuar las capacitaciones al interior de INIAF y dentro el Sistema Nacional de Recursos Genéticos de Bolivia.
RESULTADOS. Tercera fase
Difundir la Base de datos del Banco Nacional de Germoplasma de Bolivia al interior de Bolivia.• Congresos• Seminarios• Conferencias• Curso taller • Otros
Seguimiento del acceso a la Base de datos y realizar acciones
RESULTADOS. Algunos detalles en la implementación
• Instalación en sistemas operativos (Windows 7 …..)• Omisión de la base de datos de taxón (M Reisinger)• Caracteres de texto español en la introducción de datos en forma
masiva (sin acento, sin ñ tanto minúsculas y mayúsculas)• Taxón de algunas especies no están en la base de datos de GRIN-
Global y otras se cambian por sinónimos• Se observó ventajas y desventajas en la introducción de datos en
forma masiva y copia-pegado• GRIN-Global tiene estructura para la introducción de datos
(pasaporte, inventario, caracterización) si no se la sigue meticulosamente suele dar error
• Respecto a inventario, visualizamos interrogantes con accesiones regenerados de semillas, tubérculos e in vitro.
RESULTADOS. Algunos detalles en la implementación
• La implementación se realizó bajo la metodología prueba-éxito-fracaso
• La exportación de datos del Sitio web de GG a Excel tiene dificultad, en CPU configuradas con idioma español. Se debe cambiar la configuración de número con punto los decimales.
• El acceso del servidor posee 6 M de banda y es compartida la base de datos. Y se dificulta la accesibilidad del GRIN-Global, en Sitio web y Tools Curator, por la banda ancha.
RESULTADOS. Algunos detalles en la implementación
Servidor de prueba y CPU en INIAF-Cochabamba
BIBLIOGRAFÍA• Alarcón J (2016) Contador de visitas de Google Analytics como insertar ID para la Base
de datos del Banco Nacional de Germoplasma de Bolivia en el Sistema GRIN-Global en sitio web. Comunicación verbal (03-03-2016) y email (15-03-2016)
• Blanco A, Iquize E (2014) Avances en la implementación del sistema de documentación Grin-Global en el Banco Nacional de Recursos Genéticos de Bolivia. In: I Congreso Nacional de Recursos Genéticos de Bolivia
• Cárdenas M (1963) Germoplasma de papas cultivadas acumulado en Bolivia durante los últimos seis años. Folia Universitaria (Cochabamba) 9:58-87.
• FAO (2014) Normas para bancos de germoplasma de recursos fitogenéticos para la alimentación y la agricultura. Edición revisada. Roma. p 167.
• ICRISAT (2016) Banco de Germoplasma de ICRISAT. http://germplasm.icrisat.org • Iquize E (2013) Plan implementación del sistema de manejo de información de los
recursos genéticos administrados por el INIAF-Bolivia. Revista Científica de Investigación InfoINIAF. MDRyT. La Paz, Bolivia. 2, 1: 37-48.
• Mercado H (2014) Documentation System Using GRIN-Global Bolivian collections of genetic resources managed by INIAF. Leter for Mr Peter Bretting (MDRyT/INIAF/ DGE/362-2014 La Paz 09-09-2014)
BIBLIOGRAFÍA• PROCITROPICOS/IICA (2010) Recursos Fitogenéticos en los Trópicos Suramericanos.
Programa Cooperación de Investigación, Desarrollo e Innovación agrícola para los Trópicos Suramericanos - IICA. Brasilia D. F.
• SOFAG e INIAF. 2010. Sistema de Información Nacional de los Recursos Genéticos para la Agricultura y a la Alimentación, Parientes Silvestres. Informe Final v.2. Consultora SOFAG. INIAF. La Paz – Bolivia.