INTRODUCCIÓN A PUBMED

EDGAR SILVA RODRIGUEZV SEMESTRE / ODONTOLOGÍA

UNIVERSIDAD EL BOSQUE

¿Qué es PubMed? ◦ El sistema de búsqueda PubMed ha sido desarrollado por la National Center for

Biotechnology Information (NCBI) en la National Library of Medicine (NLM) de Estados Unidos. PubMed permite el acceso a las bases de datos compiladas por la NLM, como son MEDLINE, PreMEDLINE (compuesta por citas enviadas por los

editores), Genbak y Complete Genoma.

Dirección electrónicahttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

Lo primero que

observas…

Ahora vamos paso por paso…

¿Qué puedo encontrar en MEDLINE?

◦ En MEDLINE puedes encontrar varias bases de datos como lo son: AIDS, Bioéticas, Cancer, Core Clinical Journal, Dental Journals, Nurses Journals, PubMed

Central, entre otras. Se puede considerar a Medline como la base de datos más importante de la NLM, que abarca los campos de la medicina, enfermería,

odontología, veterinaria, salud pública y ciencia preclínicas. Sus contenidos van desde mediados de los 60’ hasta hoy. Para esto tienes que tener estrategias de

búsqueda de información.

¿Qué quieres buscar? ◦ Si es una búsqueda simple y no especifica, con esto me refiero sin usar ningún

tipo de terminología MeSH, puedes colocar el término en la barra de búsqueda. Este término debe estar en inglés para una búsqueda más precisa ya que la base

de datos PubMed se encuentra en su mayoría en este idioma.

◦ Por ejemplo: Pediatric Dentistry.

Si deseas hacer una búsqueda específica y clara, teniendo en cuenta algún rango de edad, año de estudio, tipo de estudio etc. Tienes que utilizar estrategias de búsqueda de información

Estrategias de búsqueda de información◦ La estructura de una estrategia de búsqueda se basa en los principales conceptos

o variables identificadas en la pregunta que guía su revisión .

1. FORMULE LA PREGUNTA DE SU REVISIÓN Recuerde que la pregunta de la revisión debe especificar los tipos de población (los participantes), los tipos de intervenciones (y comparaciones), y los tipos de desenlaces que son de interés. La sigla PICO (iniciales en inglés) ayuda a recordar estos conceptos. Estos componentes de la pregunta, con la especificación adicional del tipo de diseño de estudio que será incluido, forman la base de los criterios de elegibilidad preestablecidos para la revisión. (Manual Cochrane 5.1.0)

Ejemplo: Existe asociación entre la periodontitis y el bajo peso al nacer y el parto pre-termino?

2. LISTE LAS VARIABLES QUE ESTAN INMERSAS EN LA PREGUNTA

Bajo peso al nacerParto pre-termino

Periodontitis

a. Selección de Palabras clave:

A partir de cada variable se establecen las posibles palabras claves o descriptores con los que puede buscar sus en las diferentes bases de datos, estos pueden ser pueden ser:

Palabras o términos comunes: son los términos frecuentes que se usan para denominar una variable EJ: Para neoplasia- que es el término científico se usa coloquialmente la palabra cáncer.

Vocabulario controlado: En el área biomédica son los que se conocen como términos [MeSH]* en inglés - los cuales que pueden revisar y verificar en http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/ , y en español y portugués los términos [DeSC]** que se encuentran en http://decs.bvs.br/E/homepagee.htm . Para proyectos en áreas diferentes al área biomédica, puede consultar los descriptores en inglés y en español en http://decs.bvs.br/E/homepagee.htm. Ej. Siguiendo con el ejemplo anterior el termino MeSH para cáncer es Neoplasms y el termino DeSC es Neoplasia

Para tener en cuenta…

Para tener en cuenta…◦ Sinónimos, términos relacionados, variaciones ortográficas, abreviaturas y comodines: Cuando se diseña

una estrategia de búsqueda, con el fin de que sea tan extensa como se pueda, es necesario incluir una gran cantidad de términos de texto libre para cada uno de los conceptos seleccionados. Por ejemplo:

◦ sinónimos: ‘llaga de presión’ OR ‘úlcera de decúbito’, etc;

◦ términos relacionados: ‘cerebro’ OR ‘cabeza’, etc; y

◦ variaciones ortográficas: ‘tumour’ OR ‘tumor’.

◦ Los proveedores de servicio ofrecen facilidades para capturar estas variaciones a través de abreviaturas y comodines:

◦ abreviatura: azar* (por azar o al azar, o aleatorio o aleatoriamente, etc); y

◦ comodín: mujer (es) (por mujer o mujeres).

◦ Ej. Palabras o términos sinónimos para cáncer son: tumor, carcinoma, granuloma, epitelioma, sarcoma, neoplasia, cefaloma

◦ Otras palabras claves o descriptores pueden estar relacionadas con el TIPO DE ESTUDIO que se va a realizar Cross secctional, randomized clinical trial, etc.

Guía para búsqueda de términos MeSH http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/

Abra el Link y en la casilla superior Introduzca el termino común en inglés

Seleccione el o los termino(s) MeSH teniendo en cuenta la definición que mas esté acorde con el tema que usted este buscando.

Guía para búsqueda de términos MeSH

Guía para búsqueda de términos MeSH

CONSTRUCCIÓN DE ESTRATEGIAS DE BÚSQUEDA

Uso de operadores Booleanos (AND, OR y NOT) y Operadores cercanos (NEXT y ADJ):Con base en las palabras anteriores se pueden construir estrategias utilizando los operadores Booleanos y los cercanos; cuando unimos las palabras claves con:

OR: significa que los artículos serán recuperados con al menos uno de estos términos de búsqueda y es el operador booleano más recomendado.

AND: significa que los artículos serán recuperados cuando tenga todos los términos de búsqueda, pero se debe tener en cuenta que excluye artículos que no tengan los términos buscados al tiempo.

NOT: Es un operador exclusivo cuyo uso inadecuado puede llevar a pérdida de información relevante por lo que debe evitarse: Por ejemplo, cuando se buscan registros indexados como femenino, el ‘masculino NOT’ eliminaría cualquier registro que fuera sobre masculinos y femeninos.

NEXT’ o ‘ADJ: son operadores que optimizan los problemas generados por el operador AND, porque incluye todas las terminaciones variables de las palabras buscadas como singulares y plurales, y diferentes conjugaciones en caso de verbos.

CONSTRUCCIÓN DE ESTRATEGIAS DE BÚSQUEDA◦ Otros límites para búsquedas avanzadas: de acuerdo al tipo de estudio se pueden afinar las búsquedas

con limites avanzados como por ejemplo definir el tipo de población o tipo de muestra (humanos/animales/ in Vitro, hombre/mujer, adultos/adolecentes/niños, etc). Los límites de lenguaje, fecha y restricciones del formato del documento son límites que solo deben usarse si se tiene la seguridad que en un rango de tiempo determinado no hay investigaciones relevantes para el tema o si no hay publicaciones relevantes en un idioma en particular por lo que se sugiere no limitar el idioma o el tiempo.

USO de signos truncadores y agrupadores:o Comillas “” : permite encontrar una frase completao Paréntesis (…) : permite unir varias búsquedas en unao ¿, en la mitad de una palabra y * al final de la palabra:

permite encontrara la familia de la palabra en una sola búsqueda.

CONSTRUCCIÓN DE ESTRATEGIAS DE BÚSQUEDA

Ejemplo de estrategias de búsquedas

Recuadro: Ejemplo de estrategias de búsquedas

#1: (Periodontitis) OR (periodontal disease) OR (Chronic Periodontitis) OR Periodontitis, Chronic) OR (Adult Periodontitis)

#2: (preterm labor) OR (Low Birth Weight) OR (pregnancy outcomes) OR (pregnancy outcomes*)

#3: (Risk factors) OR (case-control studies) OR (cohort studies) OR (cross sectional study)

Con esto lograras tener una búsqueda específica, de algún artículo que desees.

Para Finalizar…◦ Otras opciones disponibles en PubMed son las siguientes: Nucleotide (Secuencias

de ADN); Protein (secuencias de aminoácido); Genome (citas y graficos del genoma); Structure (estructuras moleculares en tres dimenciones); PM o PubMed Central (archivos digitales a texto completo gratuitos); Taxonomy (base de datos con los nombres de todos los organismos representados en las bases de datos genéticas) OMIN (base de datos de genes humanos); Books (colección de libros a texto completo).

◦ Sus programas abarcan desde la salud de los consumidores de información, la literatura médica, datos genéticos -en apoyo al Proyecto del Genoma Humano-. Y sus colecciones son las más grandes del mundo, desde manuscritos del siglo XI, hasta las revistas electrónicas de nuestros días.

Bibliografía

◦ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

◦ Lafaurie, Gloria. Unidad de Investigación, Universidad El Bosque, Bogotá, Colombia. GUÍA DE REVISIONES SISTEMÁTICAS – ESTRATEGIAS DE

BÚSQUEDA DE INFORMACIÓN, 2015.

◦ Luna, Daniel. Búsqueda de información en PubMed, INTRAMED, 2015.