Page 1
Biological Journal of Microorganism, 6th Year, No. 22, Summer 2017 9
Isolation and identification of sulfur oxidizing bacteria in agricultural soil
and evaluating sulfur oxidation yield
Mahdi Sadeghi Pour Marvi
PhD student of Soil Biology and Biotechnology, Department of Soil Sciences, College of Agriculture and Natural Resources,
University of Tehran. Karaj, Iran, [email protected]
Ahmad Ali Pourbabaee *
Associate Professor of Microbiology, Department of Soil Sciences, College of Agriculture and Natural Resources, University of
Tehran, Karaj, Iran, [email protected]
Hosein Ali Alikhani
Professor of Soil Biology and Biotechnology, Department of Soil Sciences, College of Agriculture and Natural Resources,
University of Tehran. Karaj, Iran, [email protected]
Ahmad Haidari
Professor of Mineralogy, Department of Soil Sciences, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran. Karaj,
Iran, [email protected]
Zahra Manafi
Research and development office, Sarcheshmeh Copper Complex, Kerman, Iran, [email protected]
Abstract
Introduction: Sulfur oxidizing bacteria are important in agriculture. The aim of this study was
to identify the sulfur oxidizing bacteria in Sarcheshmeh (Kerman, Iran) agricultural soil.
Materials and methods: Sampling was conducted from agricultural soil in Kerman province,
Iran. After enrichment, samples were purified in the basic mineral culture containing sulfur as
the only source of energy. Sulfur oxidation capability was evaluated based on the variation of
pH and sulfate content and then strains of sulfur oxidizing were isolated and identified using
morphological characteristics and phylogenic techniques. The best strains were selected and
were evaluated for variation of pH and sulfate content by isolates in different pH and
temperature.
Results: Six sulfur-oxidizing strains were isolated and identified which had similarity to
Thiobacillus and Starkeya genous. Isolates of 103, 129, 190 and 158 were mesophyll and
neutrophil, but isolates of 192 and 156 were thermophile and alkalophill. Of these isolates,
isolate 103 was 99.86% similar to Starkeya novella, identified as superior isolate, due to the
most sulfur oxidation capability in the synthetic mineral medium containing sulfur.
Discussion and conclusion: Isolate 103 was able to grow in neutral to slightly alkaline
conditions with pH 7.5. Most of the growth of this isolate was at 30 ° C as aerobic. This isolate
was facultative chemolithotroph and the results of this research showed capacity of the isolate
for oxidizing sulfur, so that it could be used as a practical isolate in bio-fertilizers for neutral to
alkaline and saline conditions in agriculture.
Key words: Soil, Sulfur Oxidizing Bacteria, Thiobacillus
* Corresponding author
Received: January 11, 2016/ Accepted: July 3, 2016
Page 2
لهللهلشمهسلل ل رواوگانهسر لل لپژوهشلل لست لل ل-فصللامه علما لل
ل621ل-669صللل علللل،ل6931لتهب للل ه للل،ل22شللل ها لللل،لششللل سللله لل
69/11/6931تللهاتدلپلل:تا للل–ل26/61/6931تللهاتدلیاتهفلل لل
لو ل وهتبهتئ لۀسوت مد *Copyright©2017, University of Isfahan. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/BY-NC-ND/4.0/), which permits others to download this work and share it with others as long as they credit it, but they cannot change it in any way or use it commercially.
یکشاورزگوگرد در خاک ۀدکنندیاکس یها یباکتر ییو شناسا یجداساز
گوگرد شیاکساعملکرد یبررس ول
ل:یمرو پور یصادق یمهد
ل:* ییپوربابددا یعلدد احمددد
ل:یخددددا یعل ینعلیحسدددد
ل:یدریدددددح احمدددددد
لی:مندددددددا زهدددددددرا
ل
[email protected] لتهلاگ ،للیگسشلاه لل، عللرطبل ملهب للولیکشلهواسللستپلایللخله،،للیوتومولوژربلولیولوژربل،ییک الییگسشجو
[email protected] لتهلللللاگ ،لیگسشلللللاه ل، علللللرطبل ملللللهب لولیکشلللللهواسلستپلللللایل،یوللللللوژرواوبر لهاریگسشللللل
ل[email protected] لتهلللاگ ،لیگسشلللاه ل، علللرطبل ملللهب لولیکشلللهواسلستپلللایلخللله،،لیوتوموللللوژربلولیوللللوژربلگسللل هی
[email protected] تهتتتتترا ، انشتتتتت ،یعتتتتتیطب منتتتتت یکشتتتتت سیپتتتتتر ،ینرالتتتتت یم استتتتت
[email protected] را ،یت ا متس یصتن یملت شرکت سرچشمه، مس مج م ،ید م ل یهمر ی پژ هش خش
کیدهچ
لت پللژوه ،لشمهسللهلنتللگلهللد .لیگاسللدلیهیتللسل رللگه ل،یکشللهواسلیانللونایللۀدکممدرگک لللیهلهللیبللهک المقدمدد :
.بویلکا ه سلساچش عللۀ مطقلیکشهواسخه،للطتنونایلیالشاگلۀدکممدرگک لیههلیبهک ا
لیسلهسل غملللگسلبعلدل.لشلدل لسلساچشل علکا له لگسجله للللللۀیال مطقلیگسلخه،لکشهواسلیبایگاس وسعلها: مواد و روش
وللشلدللیسلهسلحهصل،،لخلهل للل واوبر لۀ ج ومل،یتمههل مب لگساژلمموگ نونایلبعلییگاگل عدسلتۀپهلطرههلیال لس وسع
لۀدکممدرگک لللیهلهللعتللسلسسلددگللنافل للقاگال هبتگاسل وایلسول هتلول عتدرگسلاررتغلگسهسنونایلبال تگک هلت توگسه
لهلهللعتللددگلنتشلدسد.لبه لالللت شمهسلهلوللیددگسلهسلل،ت تبلهاسگللیههلکرولتومل شمهسخ تالهترخصوصلگسهسنونایلبا
لللشد.لل خ افلبااسلpHیالیادعلحاگاتلوللههلعتولسول هتلتوسطلددگلpHلاگتررتغگس خهبلشدسدلول
لشلبهه لل گسل هاکلوللاوسروبهسللرتلیهلهللکعلبلهلدلمسلللشدسدلت شمهسهلولیددگسهسنونایللۀدکممدرگک لتۀددگل1: تایج
لول632لتلۀلددگلیولکلعل یاحهللبویسد لیوس خمثلول،ر زوفل،611لول631ل،623ل،619لتۀددگلچهها.لیگیسدلسشه لت تبهاسگ
لتۀسلوللبلعللت تبلهاسگلشلبهه لللیاصلدل11/33بلهللل619لتلۀلددگلهله،للعتددگلنتگله ر لگس.لبویسدلهیوس رقالو رهسعلیوس لل،611
باتلالللتلۀلددگلمملوگ لبلعلل،نلونایللیحلهولل عدسلتۀپهلطر لیانونایلل تگک هلت توگسهلنتش اربلما بعلسووال،ل گس هاک
لشد.لت شمهسه
لنتللاشلدلگللنتشل الر.لببویل1/7لۀ تدرگسلبهلت هرقالهًس ب لتهل خمثلطتقهیالبعلاشدلیالشاگل619لتۀددگلگیری: تیج بحث و
لنتللگلجتس لهللوبلویلللیهارللگخ ل لوتاو لرک وللع،تللددگلنتللگبلوی.لللیهلوگسللصواتبعلولااگیریادعلسهس ل91لییالی هلعتددگ
لیکهابایلیگلعتددگلمموگ بعلتوگسدل لکعلبوینونایلل دکممدنرگک لیباگلعتددگلنتگلیبهالل رظافلۀیهمدسشه پژوه ،ل
ل.شویگس هی للشوالولت هرقالتهل خمثلخه،لطتیالشاگلیکشهواسل تسلییالکویهه
اوسروبهسرتل،نونایلۀدکممدرگک لیبهک الخه،،لهای کلیدی: واژه
Page 3
6931لتهب ه ،ل22 ش ها للل،لشش سه للللهه،للشمهس ل رواوگانهسر لپژوهش لست ل-فصامه علما لل661
.مقدم
گسل لللنرس لللۀپوس لیال ودویلممصالنریه لنونای،
لول،تدارسلول للناو لصواتبعلمع،رآ لدرکعلیالسهخ هالگس
لیالسلول هت،للصلواتلبلعللهلهللهسوسریالگقل،یدرسول ییپ،
لولسلم للیالولنلونایللدرگک لللنلهسللصلواتلبعلنرس لدو
لpH.ل(6)لیگایلودلویللیدرسلول لل کلهسللصلواتلبعلخه،،
لگس لل للکشلوا،لبهملعلملد للللیهلهللخله،للت هرللتهلقال خمث
له رللگسلل هی لنلی ودللویلیالخلله،،لبللاگلت ممهصللالغلل:گ
لۀدکممدرگک لللیهلهللیگس هی لگسلبلهک اللجع،رس ولیالشویل
لض نلت یدرگسلللبلهللنلونای،للبعله رنلت غ:گلنر أنونای،
لولت غل:گللممهصلاللاتسلهلل فاگه ل تگفزگلبعلط،ر لکای
له ،رلل لنتللگلیا(2)لگسجه لدلل للله رللنلاشلدللبهبلویللجعریاس
لیگشلل نلخلله،،لضلل نلل بللو لیهللهلیگسلل هی لگسلبللهک ال
ل للرگقالطتبلهلشلاگلللیگ وله لسلهسنهاللل،بلهالللیاتپل:للاقهب
لنتللگلگسلولیگاسللدل ابللو رغلیهللهلگسلنوسللعلشلل اراگلبلطر لل
لکرم رسللل، طافلللگسل(9ه ل مدل)للتودلعلل وایلش اربلده ،
لشلد لل ودل للسلول هت،للبلعللنونایل،تتبدلوگکم لنترپه
لنونایلۀدکممدرگک لیههلیبهک البعل خهصلتودعلتهلگس
لنللونایلکللویلکللهابایلکللعلیطللوالبللعل یشللول عطللو
لیکشلهواسللیاله رللنلکشل للبالییگال عملارتأثل،ت مههتلبع
لیالنلونایللیکلویللعرتوصل ،رتاتلنتبد(1)لگس لسدگش ع
لیحهولحرتاقلۀت هلکهابایلرعتوصلبهله اگ لتدبهل،یکشهواس
لبلاللآ لارتلأثللتلهللبهشلدللنلونایللۀدکممدرگک لللیههلیبهک ا
لم اوللایل، طافلللگسل (1)لیشللولیگال عمللله رللنلم اوللای
.لگسلل ل للهوتلزرللسلنللونایلۀگک للردکممدلیهللهلیبللهک ا
لت بلهاللل دکممدنرگک لللت توگسلهللوله ل مدللتمداشدل باخ
ل دکممدنرگک لللت توگسلهللوله مدلکمداشدل باخلولیگاسد
ل دکممدنرگک لللت توگسللهل، کالللطللوالبللع.لیگاسللدل مترپلله
لشل الربلدیوسل لرگسلولنا هیوسل للیههلعتددگلیالنونای
لنتللگ(1)لگسل للیوسل لل ع لد للیوس ل خمثلیههلعتددگلگس
لهبلللنللونای،ل دکممدنرگک لللیالآسهللهل للهوتلت توگسلله
لگاتبله للهلهلل ل لرواوگانهسر لنتللگلژسلو للیال ودویلیههلژ
ل دکممدنرگک لللت توگسللهل خ ا لللیهللهلدللمس(.ل7)لیگای
ل،2اوسروبهسللرتل،6 هاکگسل لل ثه لمموگ لبعل یگاسدلاگلنونای
ل.لل(1)1سول ولوبوسلول1هسوستدرگسل،9او رفلیدرگس
لیهللهلعتللددگلم اوللایل بااسلللپللژوه ،لنتللگلهللد
لبلعلل مظلواللنتبلدللکلعللبلویللنلونایللۀدکممدرگک للل خ اف
لنلونایللگک لردکممدۀللیهلهللیبهک الت شمهسهلولیددگسهس
ل.دشلگقدگ لیکشهواسلخه،لگس
ل
للل.ها مواد و روشلل
لیهلللهلیبلللهک الت شمهسلللهلولیددگسلللهسل مظلللوالبلللع
لیکشلهواسللخله،للگسلیبایگالس وسعلنونای،لگک ردکممدۀ
.لدشلللگسجله للکا ه لساچش عل سل عد لگطاگ لۀ دوی
ل م قل،للشلاه لتآس هلبلعلل،تگس الطتشاگلیالخه،لس وسعل61
.لشللدسدلیساهللدگالااگیرسللهس لیادللعل1لیی للهلیالولشللد
لهلهللخله،للیشلواللول عتدرگسلشه ،لت هر رشلیههل تآس ه
ل لد للسمجل وتگلو ا ل تهدگلولسمجل عتدرگسلیس اه لتوسط
لیاولهلهللس وسلعللیسلهسلل غملل.لشلدسدللیارللنلگسدگس ل1و روست
لیگساژل مب لتمههلمموگ لبعلنونایلکعل9kل عدسلتۀپهلطر
ل علدسللۀتللپهلطر لل.ل(3)لدشلگسجه لبوی،لشد لگضهفعلآ لبع
.MgSO4،ل6/1لKClل،1/1لK2HPO4لشله ،ل(ل اریاللنا )
7H2Oل1/1ل ،Ca(NO3)2ل،16/1ل(NH4)2SO4لول9لFeSO4.7H2Oلبلویللنلونایلل اریاللنا ل6له اگ لبعل16/1ل.
لطر لللیی هلول3لتهل9لشه ،لکش لطر لۀ تدرگسلطتشاگ
لیباگلطتشاگلتهلشدلنررتعلااگیرسهس لیادعل11لول21لکش
(ل61)لیوسل لل خمثلللولیوس لدرگسلیههلیبهک الیددگسهس
لبهشلدللهر هل ع د لنا هیوس لولیوس ل ع د لنره چملو
ل.(66)
ل
Page 4
ل661لنونایل تگک هم اوایلل بااسلولیکشهواسنونایلیالخه،للۀدکممدرگک لیههلیبهک الت ولشمهسهلیددگسهس
لگسلنلا للکتللل:یکروبد یم مخلدو کشد یجداساز
ل9kلکشلل لطر لللگسل للارلل اللر ل11لبللهلخلله،لیهللهلس وسللع
لگاللللنلیگخللل،لیال، لللارللیالنلللونایلنلللا ل6لیحلللهو
ل91لیی لهللیاله لعلل2ل دتلبعلولشدلخ عتالی ارلل ار 211
ل621لrpmلیوالبلللهله لللز لیالااگیرسلللهس لیادلللعل11لو
ل211ل قللدگال للدت،لنتللگلگسلبعللد.لشللدسدلینا هنلل:گا
لطر لللبعل،یگله عل2ل9kلکش ل رپلطر لگسل ارواولت ه
لنتللگ.لشدلگسجه لینا هن:گالولدتنایل م ق،لدتددلکش
ل ،تللیاسههلولشللدلتوللاگالبللهال1لس وسللعلهللالیبللاگلم لل،
لاشلدللولحدگکثالهرگحل-و ردگسرگک ل،رپ هس لبهلت ههلطر
لیالسللوالدلل:ب)لکللدواتلزگ رلل لباگسللهسلآ ل واوبللر
ل،(گسللسو اوف و الگسلگسلل هی لبللهلسللهسو ال111ل للو لطللو
لدشلللگس خلهبللهلهللعتللددگلیسلهسللخهل لولیددگسهسلده
ل(.62)
لگسلهلهللعتللددگلیسلهسللخلهل لل مظلواللبلعلل:یسداز خالص
لعرللتهل61-1لتلهلل لوگلللیههلاق ل، واوبر ل خاو لکش
لاو لبلعللولدتللنایل م ق،،ل9kلآنهالکش لطر لبعلولدش
ل رللپالیالشلو،،للUلۀاللر لگسلگس هی لبهلول7 رپالیالخ نتا
لیاله لعلل2ل لدتللبلعللهلهلل رللپا.لدشلللپخل للو ه تلطوالبع
لبعلدللولشدسدلینا ا:گالااگیرسهس لیادعل11لول91لیی ه
لکشلل لطر لللیالاشلدکای ،للیهللهل کامللل لدت،للنتللگلگس
لنتللگلیا.لشلدسدللیگی لکشل لل، خطلللاو لبلعللااتیلدتدد
ل،رقبلگسلههل کامل شمهسلخ تالیههلت هوتلی بمهلبال احاع
لگسجله للههلعتددگلیسهسلخهل ل، کاملۀگسدگسلولشو،لاس ،
ل احالعلل1لهلهللس وسلعللوی بلللخلهل للگسلمه رگط ل مظوالبع.لدش
ل.ل(69)لشدلگسجه لکش لدتتجد
لت توگسللهل هبتللگاسل مظللوالبللعل:برتددر ۀیددجدا ا تخددا
لیهلللهل کامللللهللله،لعتلللددگلتوسلللطلنلللونایل تگک للله
ل ت لهللکشل للطر لللبلعللقب،،لۀ احالیالشد لیسهسلخهل
لول عتدرگسلللاررللتغلی بملهللبلاللولدسدشل م ق،ل،9kل عدسلۀتپه
لنتبه لالل احالع،للنتللگلیا.لشلدسدلل هبتگاسلط،ر لسول هت
لنره چملللولطر لللکلای للیدرگسلللت توگسلهللسظلاللگسلعتددگ
لاو لبلعللسلول هتللسلمج ل.لدشلللگس خلهبلل،سول هتلدرتول
ل.لناف لگسجه ل تبهالدتکاالبهل سمجلکدوات
یهدا ید جدا توسد سولفات و pH راتییتغ یبررس.
لحللاگاتلیادللعلولpHلنرللرتعل مظللوالبللع: شیآزمددا مددورد
ل،91ل،21لت ی هلی هاههرتلنونای،ل تگک هلیباگل مهس
لی هاهلللهرتلنره چمللللولااگیرسلللهس لیادلللعل11لول11ل،91
لبللله(ل61)ل1/3لول1/1،ل1/7ل،1/1ل،1/1ل،1/1ل،1/9لۀ تدرگسللل
لیال9kل علدسللتۀپهلکش لطر لیال621لrpmلوارشلیوا
لگفلزگاللسلا للگسلگسل هی للبلهللجتس لهلل،رت ا.لدشلگم ه لتواگال9
ل.لشدلگسجه لگک ،
: گوگرد ۀدکنندیاکس یها یجدا یمولکول ییشناسا.
لسشلهسااللگسل لوایسظا،للیههلعتددگل ولووللت شمهسهلیباگ
SrRNA61لگسلتلوی لل ل لتسلگب دگل مظوالنتبد.لشدلگس هی ل
لشلاک لل رللکلگسلگسل هی للبلهللسلسسللولدشلللعرللتهلههلعتددگ
لبللعل،ذکاشللد لشللاک لیسلل واگلع ،ل طللهب ل1توپللهاژ
لبللهل،DNAل للرکلسللمج .لدشلللگقللدگ لDNAلگسلل خاگ
ل،DNAل ک لللج مسلولیاصد6لآنهاوسلژ لگلو اوفواس
ل211/211لnmلس لب للۀ هسبلبهلول3سهسویاگپلگسلگس هی لبه
لگسلگسلل هی لبللهل ابوطللعلژ لارللتوثلولPCR.لشللدلگسجلله
-´9′)لf27لی اهلللللللللللللللللللللللللللللللللللللللللللللهتپاگ
AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-1لو(لr6132ل
(′9´-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA-1ل) لگسجلله
لوگکلم ل.لشلدللگسجله للگلو اوفلواسللۀاروسلعبلآ لدترتألولدش
لگسجله لل ارواولت لهلل11لت سهلهللحجل للیال اگسرپالیگلا رسسج
لبلهفالل ارواولت لهلل1ل،X6لPCRلبلهفالل ارواولت لهلل1لکعلدش
MgCl2ل ارواولت للهل1ل للوالا،ل اللر ل2لباگبللالغاظلل لبللهل
dNTPلگسل ارواولت لهلل1/2لواو والا،ت لهلل611لغاظل للبهل
ل6لواو والا،ت لهلل1/1لغاظ لبهلبانش لولاف ل اتپاگلها
Page 5
6931لتهب ه ،ل22 ش ها للل،لشش سه للللهه،للشمهس ل رواوگانهسر لپژوهش لست ل-فصامه علما لل661
ل6ل،12/1لU/µlل للاگسرپالTaq DNAل تآسللزل ارواولت لله
لگسلل هی ل قطللالآبل ارواولت للهل23لولDNAل ارواولت لله
لگسل هی للPCRلیال م لللشلههدللگسل،PCRلدأترللتلیباگ.لشد
لبلول شهبعلطتشاگلیالکعلشد لشد لگضهفعلآبلDNAلیدهع
لشلا للبلعلل لاگسلرپالیگلا رسسجلوگکم .لدتنایلگس هی لبوی،
لیادللعل31لیی للهلیالعرللگوللوگساشلل لشللدلگسجلله لاتللس
لشله ،للتواگاشوسد لۀچاخل91لقع،ریقل1ل دتلعبلااگیرسهس
لع،رللثهسل91ل دتلعبلااگیرسهس لیادعل31لیی هلیالوگساش
لولعرللثهسل11ل لدتللعبلللااگیرسلهس للیادعل13لیی هلیالگتصه
لپلسللولقعریقل2ل دتلعبلااگیرسهس لیادعل72لیی هلیالسم ز
لقلعلریقل61ل دتل،ت سههلسم زلیباگلچاخع،ل91لنتگلگت ه لگس
ل صلو للبعلد،للۀ احالللیا.لااگیرسلهس للیادعل72لیی هلیا
PCRلیسل واگلع ،لل طلهب للول61فا م لهسلل رکلگسلگس هی لبهل
لیسل اه للگسلگسل هی للبلهللولدتنایلکاو ل،شد لن علشاک
ل هبتللل تلوگلل(لکا ل هکاوژ لشاک لتوسط)ل66سووئم ا
لگفلللزگالسلللا لگسلگسللل هی لبلللهل هبتلللل تلللوگللجتس للله.لشلللد
(Technelysium Pty Ltd)ل16/2لChromasل تاگتللول
ل ع بلاللیههل توگللبهلBLASTnلگفزگالسا لگسلگس هی لبهلولشد
لولشلللدل لللعت قهلNCBIل ژسللللاللله تپهلیالشلللد لثبللل
لژ ل تللوگللیال شللهبه لباگسللهسلعتللددگلنتتللالکتللسزی
SrRNA61لبلهللهلهللعتددگلت تبهاسگل،رت ا.لدتنایلت شمهسهل
لۀ احالیا(.ل61)لشدلگسجه لClustalWلگفزگالسا لگسلگس هی
ل تگلاللوالگسلگسلل هی لبللهلت تبللهاسگلیاخلل لاسلل لبعللد،
Neighbour Joiningل(61)لشدلگسجه ل
ل
ل. تایج
لیال، وایبااسلللیهللهلخلله،لت هر رشللل شخصللهت
لهلهللخه،لۀ تدرگسلنرهسار .لگس لشد لیگی لسشه ل6لددو
لبلالل مستسل یسل61/9لههلخه،ل وتگلو ال تهدگلول13/7
لس لب هًللتلهلل خمثلللۀ تدرگسللل ،ت وایآس لهللخله،ل.لبلویلل ا
ل.بویلشوالولیگش لت هرقا
لل وایبااسلیههلخه،لیشوالول عتدرگسل شخصهتل-6لددو
سارنهر ههلس وسع پهاگ ا
S6 S2 S9 S1 S1 S1 S7 S1 S3 S61 S66 S62 S69 S61
pH 13/7ل ل13/7 11/7 11/7 ل13/7 ل11/7 ل13/7 ل13/7 ل13/7 ل37/7 ل33/7 ل32/7 ل17/7 ل13/7 ل13/7
EC(dS/m) 61/9ل 63/9 63/9 26/9 61/9 63/9 63/9 61/9 63/9 61/9 63/9 22/9 61/9 21/9 61/9
لکللعلکشلل لیهللهلطر لللگسل،یسللهسل غملللۀ احالللیا
لکای لجهیتگلکدواتلولبویسدلشد لحرتاقلههلس وسعلۀاروسلعب
لیسلهسللخهل لنونایل تگک هلت توگسهلبهلعتددگل1لبویسد،
ل،7لۀ تدرگسلل)لطر لللو له لتلطتشاگلیالآسههلت توگسهلولشد
لاررللتغلسظللالگسل،(621لrpmلااگی،رسللهس لیادللعل91لیی لله
لنافلل لقللاگال هبتللگاسل للوایلسللول هتلدرللتوللول عتدرگسلل
لت توگسلهللنتشل الربل619لتلۀلددگله ،ر لنتگلگسلکع(ل2لددو )
ل611لول632لیهلهللعتسلوللولیگیلسشله للاگلنلونایلل تگک لهل
لطتشلاگللیالبویسد،لکش لطر لیاولاشدلبعلقهیالناچع
لیادللعل91لحللاگاتلیادللع)ل ودللویلۀ تدرگسلللولت ی لله
لولنللونایل تگک للهلبللعلقللهیا(ل1/7لۀ تدرگسلللولااگیرسللهس
لیالکللعلسبویسللدلکشلل لطر لللسللول هتلول عتدرگسلللاررللتغ
لآسهلهللۀ تدرگسلللولی لهللۀمللربهلطتشاگل ،تآس هلیبعدلۀ احا
ل.لدشلنررتعلنونای،ل تگک هلولاشدلیباگ
لل
Page 6
ل667لنونایل تگک هم اوایلل بااسلولیکشهواسنونایلیالخه،للۀدکممدرگک لیههلیبهک الت ولشمهسهلیددگسهس
لیالسول هتلدرتوللول عتدرگسلاررتغلیباگلههلعتددگلت توگسهل-2لددو
لولااگیرسهس لیادعل91لیی هلول7لۀ تدرگس)لو ه تل طر لطتشاگ
rpmل(621ل
(mg S/L)لسول هتلاگتررتغ pHلاگتررتغلعتسو
ل19ل21/1ل611
ل33ل12/1ل631
ل1ل1ل632
1ل1 611
ل612ل19/1 623
ل911ل11/6 619
لیهللهلعتللددگلیبللاگلسللول هتلولpHلاگتررللتغل بااسلل
لحللاگاتلیادللعلولpHلنرللرتعلهللد لبلله)ل ت وایآس لله
لیبلاگللبعلد،للۀ احالللیا( لنلونایلل تگک لهللیبلاگلل مهس
لهلهللعتللددگلتوسلطللنلونایلل تگک لهللتلوگ للحدگکثالموعتگ
لیهلهللعتللددگلیبلاگللسلول هتللولpHلاگتررللتغلی،شلوللنررتع
لولت ی لهلل خ الفللی هاههرتلگم ه لۀاروسلعبل ت وایآس ه
ل(.6لشو،)لدشلنررتعله عل2ل دتل طل عتدرگس
ل
ل
للااگیرسهس لیادعل21-11لیی هههلیال9kلکش لطر لیال خ افلیههلعتددگلتوسط(ل1/7لpH)لثهب لۀ تدرگسلیالسول هتلولpHلاگتررتغ(لگلف)
Isolate 190
Isolate 103
Isolate 192
Isolate 158
Isolate 156
Isolate 129
0.0
0.4
0.8
1.2
1.6
2.0
25 30 35 40 45
Δp
H
Temprature ⁰c
Isolate 190
Isolate 103
Isolate 192
Isolate 158
Isolate 156
Isolate 129
0
100
200
300
400
25 30 35 40 45
SO
4 -
2(m
g/L
)
Temprature ⁰c
Page 7
6931لتهب ه ،ل22 ش ها للل،لشش سه للللهه،للشمهس ل رواوگانهسر لپژوهش لست ل-فصامه علما لل661
ل
لل1/9-1/3لpHلیال9kلکش لطر لیال خ افلیههلعتددگلتوسط(لااگیرسهس لیادعل91)لثهب لحاگاتلیادعلیالسول هتلولpHلاگتررتغل(ب)
(لنونایل تگک هلیباگل مهس لحاگاتلیادعلولpHلنررتعلیباگ)له عل2لگسلبعدل ت وایآس هلیههلعتددگلیباگلسول هتلولpHلاگتررتغل-6لشو،
لثهب لحاگاتلیادعلولpHلیال9kلکش لطر لیال خ افلیههلعتددگلتوسط
ل
لکللعل طتشللاگلیال،(گلللف)ل6لشللو،لجتس للهلباگسللهس
لگسل وایبااسلللیههلعتددگلبهشد،ل7لکش لطر لۀ تدرگس
لیطلواللبلعلل شلدسدلل رتق لناو لیولبعلاشدلۀمربهلیی هلسظا
ل،رلل زوفلنلاو للیال611لول631ل،623ل،619لیههلعتددگلکع
لنلاو للیال611لول632لیههلعتددگلو(لااگیرسهس لیادعل91)
لیوس لنره چملل.لناف مدلقاگا(لااگیرسهس لیادعل11)ل رهسع
لیهللهلعتللددگلکللعلدتللآل لللبللالنرچملل(لب)ل2لشللو،لگس
ل91لیی للهلیالاشللد،لۀمللربهلۀ تدرگسلللسظللالگسل وایبااسلل
لکلعللگو لناو .لشدسدل رتق لناو لیولبعلااگی،رسهس لیادع
ل،619لیهلهللعتددگلشه ،(ل1/7لۀ تدرگس)لبویسدلیوس ل خمث
لبویسدلهیوس رقالکعلیو لناو لولبویسدل611لول631ل،623
لنتبلدل.لبویسدل611لول632لیههلعتددگلشه ،(ل1/1لۀ تدرگس)
لچههالپژوه ،لنتگلیالآ د لیس لعبلجتس هلباگسهسل رتات
لیوسل لل خمثلللول،رلل زوفل،611لول631ل،623ل،619لتۀددگ
لیوسل لل،611لول632لتۀددگلیولکعل یاحهلل بویسد لول رهسع
ل.لبویسدلهیوس رقا
Isolate 190
Isolate 103
Isolate 192
Isolate 158
Isolate 156
Isolate 129
0.0
0.4
0.8
1.2
1.6
2.0
3.5 4.5 5.5 6.5 7.5 8.5 9.5
Δp
H
pH
Isolate 190
Isolate 103
Isolate 192
Isolate 158
Isolate 156
Isolate 129
0
100
200
300
400
3.5 4.5 5.5 6.5 7.5 8.5 9.5
SO
4 -
2(m
g/L
)
pH
Page 8
ل663لنونایل تگک هم اوایلل بااسلولیکشهواسنونایلیالخه،للۀدکممدرگک لیههلیبهک الت ولشمهسهلیددگسهس
لزگ رلل لباگسللهسلنللونایل تگک للهلت توگسللهل هبتللگاس
لیالسلول هتللدرللتوللولکشل للطر لۀ تدرگسلاررتغلت توگسه
لطتشلاگللیا(لبلولگللفلل،6لشلو،ل)لیگیلسشله للههلعتددگلنتگ
رهسلعلللطتشلاگللیالول619لتلۀلددگل،یوسل لل خمثلللول،ر زوف
لت توگسلللهلنتشللل اربل632لعتلللددگلهیوسللل ،رقالولیوسللل
لیوله رلل لگسلنره چملل.لیگیسللدلسشلله لاگلنللونایل تگک لله
لیبللاگلیشلل اربلت توگسللهل619لتللۀددگل،632لول619لتللۀددگ
لیال عتدرگسلللاگتررللتغلۀیگ ملل.لیگشلل لنللونایل تگک لله
لاتسلهللبلهللجلع،لرس لنتللگلکلعللگسل لل2لحلدویللحهضالپژوه
لل.(67)لیگش ل خوگسله لههلپژوه
لSrRNA61لژ ل تلوگلللنررتعلجتس هل:یمولکول ییشناسا
لیهلهللیگی لبلهللآسهلهللشلبهه للۀ للت قهلول وایسظالیههلعتددگ
لیگی لسشله لل9لددو لیال،NCBIلاه تپهلیالشد لثب ل ع با
ل.للگس لشد
للگس هسدگایلیههلعتبهلسول تآس ه وایلیههلعتددگلSrRNA61شبهه لژ للزگ ر لۀ ت قهل-9لددو
تهک وسو شبهه لزگ ر لنتش اربلبهلگس هسدگایلتۀسولشبهه لیاصدل هبریس لش ها لعتددگلسه
لThiobacillus thiophilus NR 044555لKR020052 3/39ل611Bacteria; Proteobacteria;
Betaproteobacteria; Hydrogenophilales; Hydrogenophilaceae; Thiobacillus
لThiobacillus thioparus NR 117817لKR020051 3/39ل631Bacteria; Proteobacteria;
Betaproteobacteria; Hydrogenophilales; Hydrogenophilaceae; Thiobacillus;
;Bacteria; ProteobacteriaلKR020050 3/33 Thiobacillus aquaesulis NR 117675ل632Betaproteobacteria; Hydrogenophilales;
Hydrogenophilaceae; Thiobacillus 611 KR020049 6/31 Thiobacillus aquaesulis NR 117675ل623 KR020043 9/31 Starkeya novella NR 074219 Bacteria; Proteobacteria;
Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Xanthobacteraceae; Starkeya; Starkeya
novella 619 CP002026 11/33 Starkeya novella NR 074219
ل
لتلۀل،لیولددگ2یالدلدو لللشلد لل شلههد للجتس هلگسهسبا
لتۀسللولبللهلیاصللد9/31لول11/33ل رللتاتلبللعل623ولل619
لیهلهللعتللولددگلیگشل مدللت تبلهاسگللشلبهه للسلوواللل گس هاک
لیهلهللعتسلوللبلهللیاصلدل3/39لول3/39ل رللتاتلبعل611ولل631
ل69اللوسروفرتلاوسروبهسللرتولل62وپللهاوسرتلاوسروبهسللرت
لزرللسل611ولل632لتللۀددگل.لیویگشلل مدلت تبللهاسگلشللبهه
لاوسروبهسللرتلتۀسللولبللهلیاصللد6/31لول3/33ل رللتاتلبللع
یاخل لللن،ره چم.لیگش مدلت تبهاسگلشبهه ل61سرگکوگسول
-Neighbor وایسظالباگسهسلاو للیههلعتددگلت تبهاسگ
joining1گفلاگسلللولبهلگس هی لگسلسلا للMEGAدلشلللر تاسللل
ل(.2)شو،ل
ل
ل
.گیری بحث و تیج
لیهللهلیبللهک الگسلمللعربهلۀگسلل هیلا،رللگخلیهللهلسلله لیا
لت فاوشلولل،رللقبلگسل خ الفلل تصلمهللنلونایللۀدکممدرگک
لرلۀلتهلنره چملللولیشلهاللیهلهللخهسلعلرۀلتصل لل،یفالزلل عهی
لقلاگاللیش اربلتودعل وایل،یکشهواسلیال تسلیکویهه
لیکشللهواسلیالهللهلیبللهک النتللگلگسلگسلل هی .لگسلل لناف للع
لکلای للیدرگسلللبلهلله ،رللنلهسر وایسلنونایلنرتأ لبالملو
لز،رللسله رللنلهسرسل وایلت غ:گلممهصالاتسهلد:بلبعلط،ر
لضل نلل، ل لتسلیکویههلنتگلگسلگس هی لولکمدل لک ک
ل م للل طللر ل ل لتسلگثلاگتلله ،رللنلیالم اوایل تگفزگ
ل،63)لیگش لسخوگهدل پلیالزرسلاگلت هر رشلیکویههل باخ
پللژوه ،للنتللحهصلل،لگسلگلجتس للهل ،رللتاتلنتبللد(2ل،61
لیکهانشلهلبهشلدلکلعلبلاگللللل تکویلسلعرتهلیباگلتوگسدل
ل.ناییل لشمههیرپل، آتلقهترت ق
Page 9
6931لتهب ه ،ل22 ش ها للل،لشش سه للللهه،للشمهس ل رواوگانهسر لپژوهش لست ل-فصامه علما لل621
لمدی.لS rRNA61لژ لیههل توگللزرآسهللگسل م جلNighor-Joiningلاو لباگسهسلنونایلگک ردکممدۀلیههلعتددگلت تبهاسگلیاخ ل-2لشو،
ل.گس ل6111لbootstrapلۀیهمدلسشه لهه،لنا لیالشد لیگی لسشه
Thiobacillus thiophilus (NR044555) Thiobacillus sajanensis (NR115758)
Thiobacillus denitrificans
Thiobacillus thioparus (NR117864) Thiobacillus thioparus (NR117817)
Thiobacillus aquaesulis (NR117675) 158
190 192 156
Thiobacillus plumbophilus (NR114805) Neisseria sicca (NR121688) 153
Thermithiobacillus tepidarius
Acidithiobacillus ferrivorans (NR074660) 148
Acidithiobacillus caldus
Acidithiobacillus thiooxidans (NR115265) Acidithiobacillus ferridurans NR 117036 184
155 182
Thermaerobacter subterraneus (NR028814) Thermaerobacter marianensis (NR074944)
Sulfobacillus acidophilus
Sulfobacillus benefaciens (NR044352)
Sulfobacillus sibiricus (NR042730) Sulfobacillus thermosulfidooxidans
Acidithiobacillus ferridurans (NR117036)
Agrobacterium vitis
Rhizobium loessense (NR115123) Blastochloris viridis (NR115543)
Starkeya novella (NR074219) 129
103 Starkeya koreensis (NR041013)
Azorhizobium oxalatiphilum (NR108517) Xanthobacter flavus (NR113665)
Alpha proteobacteriu
Ancylobacter abiegnus (NR117472) Ancylobacter polymorphus (NR042795) Ancylobacter sp. (EU289805)
85 87
87 99
100
100 100
63
71 97
90
100
70
69
60 97
99
57
90
91
52
89
100
93
95
84
78 86
58
75
79 72
0.02
Page 10
ل626لنونایل تگک هم اوایلل بااسلولیکشهواسنونایلیالخه،للۀدکممدرگک لیههلیبهک الت ولشمهسهلیددگسهس
آ للتلۀلکلعلیولددگللشلدلل بااسلعتددگل1 طهلعع،للنتیالگ
لول3/33لبللهل رللتاتل)بللعلسرگکوگسللوللاوسروبهسللرتلتۀبللهلسللو
ل گسل هاکللتۀبلهلسلولللالالتیلتۀ(،لیولددگشبهه لیاصد6/31لبلهللعتللددگل6ل،(یاصلدل9/31لول11/33لبلهلل رللتاتل)بلعلل61سووال
لعتللددگل6(لولیاصلدل3/39)بلهلللالوسلروفرتلاوسروبهسرتلتۀسو
لشبهه (لیاصد3/39)بهللوپهاوسرتلاوسروبهسرتلتۀبهلسولزرس
کللعلیاصللدلشللبهه للت هللهلعتللددگل.یگیسللدلسشلله لت تبللهاسگ
ک للالگسلل، قبالللۀشلدللشللمهخ علیهلهللعتبللهلسلوللآسهلهللت تبلهاسگل
بهشلمدلکلعللللیدتللددلیههلعتبویلگح ه لیگایلددگلیاصد33
یگای.لل اللرتو لهلهیلل تآس هلگسجه لبعلهسرسل طا ،لنتگلدأترت
دللمسللیهللهلعتنلسللوتللگلز،رللسلاللاتیلهللهیلیالنللزگا
لجتس للهول(21شللد لبللویل)لت یالخلله،لشمهسللهلاوسروبهسللرت
لبلهاۀلیا(،26)لهلهللپلژوه للالالتیلجتپژوه لحهضلا،لبلهلس لهللل
ل خلوگسللهل لده ،للتنگسلگنونایللۀگک ردکممدلیههلیبهک ا
لسشه لیگی.لل
نلونای،ل صلوالتلللل تگک لهلل تسلمدتآفال یالط
لت یالهلالحله ل صلو لسهلهللللل ولللل یشول لدرتولل موم
یالکملهالشلهخ لللل رللتاکلنتللکلعلگسلگل(22)لگس سول هتل
نلونایللل تتلوگ لگک لهللل هبتیالگاسلتوگ ل ل ع،تدرگسلاررتغ
ولل عتدرگسلللاررتغلت گسلتوگسهلزرپژوه لسلنتگس هی لکای.لیالگ
نلونایللل تگک لهللت توگسلهلل هبتللگاسلیسلول هتلبلاگلللدرللتول
پهاگ اهله،لشلهخ للللنتللدلکلعلگلش،لگس هی لههلیتوسطلبهک ا
ل(.29مدل)ه لنونایل تگک هلت سمج لتوگسهلیباگل خوب
لت توگسللهلنتشلل اربل619لتللۀ،لددگعتللددگل1لنتللگله رللگسل
یاصلدلل9/31،لبلهلل619لتۀنونایلاگلسشه لیگی.لددگل تگک ه
لنتشل الریگشل لولبللت تبهاسگشبهه لسوواللل گس هاکلتۀسوبعل
سشله لللهلهللعتللددگل ت ه له رنونایلاگلگسل ل تگک هلت توگسه
سله لیگشل لللل61سووللوسللاوسروبهسللرتلقلبلًللکعلنوسعلنتیگی.لگ
،لاوسروبهسللللرتل عمللللتولدللللمسلوگب لللل علبللللعلآ لل(21)
لۀگک للردکممدلیهللهلیدللمسلگسلبللهک النتتللالشللد لشللمهخ ع
قلاگالللهتللپاوتئوبهک الب لهللکللسللیالش ارنونایله مدلکعلب
لیهلللهلیبلللهک الت طهلعلللهتلشمهسلللهلنتشللل اریگاسلللدلولب
ل (21آسهلهلگسجله لشلد لگسل ل)لللللبلاللزرسنونایللۀگک ردکممد
لهتللپاوتئوبهک الیالکللسلآل لهلللسووللوسللاوسروبهسرتناچعل
لیهلللهلیپلللژوه ،لبلللهک الکتللل(.لیال21قلللاگالیگشللل ل)
ل1یوله لعلتلهلللل اگلطلللطر لۀ تدرنونای،لگسلۀگک ردکممد
نلا للل ار ل21سول هتلتهللدروگحدلکهه لیگیسدلول قدگالتول
لالا،لتیل پژوهشللیالکلعلل(21نونایلبالنا لنزگا لشدل)
لالونا لربلالکللنا لنلونایلل ار ل11تهلل61له ر لا،ت قهیلنتگ
لباگسلهسلل(21نزگا لشد لبویل)له عل61ل دتل طلخه،،
ک لالگسللل ع،تدرگسلللولسلول هتللاگتررللتغلپلژوه للنتگلجتس ه
لت یالتوگسلهللت لهوتلل،رللیللبلعللتوگسلدلل بلویلکلعل للللل قبالجتس ه
ل.هشدبلههلینونایلتوسطلبهک ال تگک ه
لاوسروبهسللرتل،رلل زوفلیهلهللنوسلعللبهاۀیالوعگتملودویلبه
لیهلهللنوسلعللبلهاۀلیا،لصواتلناف لعلگسل لللیهیت طهلعهتلس
صواتلناف لعلگسل لکلعلگسلللللیآ ل طهلعهتلک ال،رتا وف
(.ل27)لکلایللشلها لگلسرگکوگسوللاوسروبهسرتبعللتوگ ل له ر
نللونایلاگللگک للردکممدۀلیهللهیبللهک ا(ل21)لیگل طهلعللعلیا
ولل67واسلللوتوسلاوسروبهسلللرتلوپلللهاوس،رتلاوسروبهسلللرت
لپژوه لجتکایسدلکعلبهلس هل عافلسرگکوگسوللاوسروبهسرت
ل هل شهبه لیگش مد.لل
ل632ولل619لتلۀلددگحهضلا،لیولللپلژوه للجتس هلباگسهس
لنتللنونایلاگلسشله لیگیسلدلکلعلگلللل تگک هلت توگسهلنتش ارب
لول11/33ل رللتاتلبلعللعتددگیوللنتسشه لیگیلگل ولووللزرآسهل
للسلوواللل گس هاکلبهلیاصد3/33 لسرگکوگسلولللاوسروبهسللرتوگسللیالالتیلجتس هلباگسهسلنره چم.لیگش مدلت تبهاسگشبهه ل
ل632لتۀددگ،ل632ولل619لتۀددگیولله رحهضا،لگسل لپژوه
وللااگیریادللعلسللهس ل11لیی للهل عمللتل،تللالسللخ لطتشللاگ
یاللزرللسلجتس لهللنتللکلعلگللدکمللل اگلبه الت ،ل للل1/1لۀ تدرگس
ل،ریللنره لبعل (23ولل2)لبوینزگا لشد للههلپژوه لااتی
لهیوسل لرقالول رهسعلیوسل للیبهک الکتلمموگ لبعلعتددگلنتگ
لز،رللللللسلیاللللللاتیلپللللللژوه لیا.لدشلللللللت شمهسلللللله
Page 11
6931لتهب ه ،ل22 ش ها للل،لشش سه للللهه،للشمهس ل رواوگانهسر لپژوهش لست ل-فصامه علما لل622
لد شللگس خهبلل،باتالتۀددگلمموگ لبعلسرگکوگسوللاوسروبهسرت
.(91)لبوی
ه ل مدللل،رنونایلیخل تیالگک هل خ ا لیههل تآسزل
لگسلcytochrome cلیدرللکال تآسلزللسووالل گس هاکیال.ل(96)TOMESل للرالطاتلل
نللونایلیخهللل لل تگک للهلیا،ل61
سله للبلعللsoxگسلگپلاو للل بخشلۀاروسلعبل تآسزلنتگلدر.لتولیگای
soxAXل تگک لهلل تآسلزلل(.91ولل99،ل92)لایرللنل گسجه ل ل
ل،رللنللونایلگسلقبلگک للردکممد لیهللهل،رللنللونایلیال زوف
وللگسلل بللهاللح للهسللیی للهلبللعل،وپللهاوسرتلاوسروبهسللرت
ولل91)لیهللدل گسلیسلل ل لللهللهی هلنتللخللویلاگلیالگل رللفعهل
بلهالتالگسلللییالی لهلل619لتۀددگلاشدلمد ل ،رتاتلنتبد(.91
ل رللفعهللکلهه لل،رللیللبلعلل ونلگس لااگی،ریادعلسهس ل91
ل.بهشدل تآسزلنتگ
لۀدکممدرگک لللیهلهللیت هوتلبهک ال،تگسلیاللااتیل وت
لتملو ل ابلو لبلعلللله،تللپاوتئوبهک الب لهللولآل لهللکلسنونایل
گپاو لل،هتپاوتئوبهک الآل هلکعلیطوالبعل ل(92)لآسههس ل ژس
ل ولللللل اگلیگاسللللدلsox (sulfur oxidizing)که لللل،ل
ل عمللتل یگاسلدللسلهق للطلواللاگلبعلsoxلگپاو ل،هتب هپاوتئوبهک ا
لیبعلدلهللواگلسدگاسدللداوژسهسرسول والیهلۀکممدکدلیههلژ
لیا(.ل97)لیگاسلدللاگل63سلول هتلل بانشل للیهرللگحل رآ لس
شللبهه للیاصلدل11/33لبلهل)ل619لتللۀددگلز،رللپلژوه لسللنتللگ
بلویلللهتللآل هلپاوتئوبهک البع(ل عا لسووالل گس هاکبهللت تبهاسگ
بللهللت شللبهه لتبللهاسگلیاصللد3/33لبلله)ل632لتللۀددگل وللل
لکلعللبلویللهتللپاوتئوبهک ال(ل عا لبعلب لهلوپهاوسرتلاوسروبهسرت
لیولنتللگلم اولایللت لهوتلل،تللیاللگسلالالتیل وللتلخلویللنتگ
ل.للبویلیبهک ا
لیکلعلی لهلللنتللگلیاسظانلاف نللولجتس لهللنتللگلبلعللتودعلبه
لیالبللوی،لااگیریادللعلسللهس ل91یالحللدللیخلله،لکشللهواس
لبهشلد،للت هرقاتهلل یالحدلخمثلزرخه،لسلۀ تدرگسلکعل صوات
ل،ییالکشلهواسلل ل لتکویلسلرۀتهلیباگل619لتۀددگکهابایل
،ل632لتلۀلددگکلعلگسل هی لگسللللت ولگسلآسجلهللیشول لشمههیرپ
کلهابایلللااگیریادلعلسلهس للل11لیولی لهللت هرللقالطتشاگلیباگ
لشلللمههیر لللاتبط،لپل تااصلللمهتیگای،لگسللل هی لگسلآ لیالی
ل.یشول
لتعللدگیل،رللقبلگسل خ ا لللیفهک واهللهل،یکشللهواسلیا
ل للرگقالطتشاگل، واوبر ل رد علتمو ل، واوبر ل رد ع
ل (،لخله،للیالآبل،رپ هس ل، هوگیهلحاگات،لیادعل،رقب)گس
ذاگت،للۀگسللدگسلط،رنللونایلیالت للهسلبللهل لللۀژتللولسللطح
ل ولفاگوگسلللطره اتاو ل ودویلیال لیههلیبهک ال فاگوگس
لهترلللولسلللو لم ال ول علللدسل آلللللبلللهترتاکلیسوب للل اگ
ل،رللیخلنللونایل تگک للهلیال(11ولل93،ل91)لیکشللهواس
ل تگک لهللدنه تیلگسلحهضا،لپژوه لکعلت آسجهلگس.له مد
لهلهیللپلژوه للیبلاگللبلوی،للسظال وایلینونایل عدسل وگی
لاگلنلونایلل تگک لهللیال آللبهترتاکلسق لتوگ ل ل، آت
ل.للیگیلقاگالتودعل وایلزرس
لول ولووللت شمهسهلجتس هلباگسهسلحهضا،لپژوه لیا
لنلونایللگک لردکممدۀللتلۀلددگل1لشلد ،للگسجله للههیل تآس ه
ل،(611لول631ل،623ل،619)لآ لتللۀددگل1لکلعللدشلللت شمهسلهل
ل،9/31ل،11/33ل رللتاتلبلعللولبویسلدللیوسل لل خمثلول،ر زوف
ل،سلللووالل گسللل هاکلیهلللهلعتسلللولبلللهلیاصلللد3/39لول3/39
وللوپللللللهاوسرتلاوسروبهسللللللرتلسللللللووال،ل گسلللللل هاک
ل یگشللل مدللت تبلللهاسگشلللبهه لللالللوسروفرتلاوسروبهسلللرت
لیوسل للل،(611لول632)لااتیلتۀددگلیولکعل یاحهل لول رهسلع
لبللهلیاصللد6/31لول3/33ل رللتاتلبللعلولبویسللدلهیوسلل رقا
لسشله للت تبلهاسگلشلبهه لللسرگکوگسوللاوسروبهسرتلیههلعتسو
لت توگسلهللنتشل الربل619لتلۀلددگلع،تللددگل1لنتگله ر لگس.لیگیسد
ل.للیگیلسشه لاگلنونایل تگک ه یقدردا تشکر و
ل لسلل تصلمهلل الشاک ل هلل تح هلبهلپژوه ،لنتگ
لگسجله ل(لتوسلععللول رت قلگ والساچش ع،ل س) ج للاگ تگ
ل.یشول ل تشوالولقدایگسلاع،روسلنتبدلکعلشد
Page 12
ل629لنونایل تگک هم اوایلل بااسلولیکشهواسنونایلیالخه،للۀدکممدرگک لیههلیبهک الت ولشمهسهلیددگسهس
References
(1) Benson SW. Thermochemistry and kinetics
of sulfur-containing molecules and radicals.
Chemical Reviews 1978; 78(1): 23- 43.
(2) Hussain SA., Ahmad K., Arif-un-Nisa
Naqvi TK., Ahmed M., Nafees MH., Abass
Q. The colossal influence of biological
fertilization on medicinal and aromatic
plants. Journal of Biodiversity and
Environmental Sciences 2014; 5(5): 299-
314.
(3) Havlin J., Beaton JD., Tisdale SL., Nelson
WL. Soil fertility and fertilizers: An
Introduction to Nutrient Management: 6th
ed. Upper Saddle River, NewJersey: Pearson
Prentice Hall; 2005: 515-205.
(4) Georgievskii V., Annenkov BN., Samokhin
V. Mineral nutrition of animals: Studies in
the Agricultural and Food Sciences.
London: Elsevier; 2013: 459.
(5) Eriksen J. Soil sulfur cycling in temperate
agricultural systems. Advances in Agronomy
2009; 102 (1): 55- 89.
(6) Hallberg KB., Lindström EB.
Characterization of Thiobacillus caldus sp.
nov., a moderately thermophilic acidophile.
Microbiology 1994; 140(12): 3451- 6.
(7) Pronk J., Meulenberg R., Hazeu W., Bos P.,
Kuenen J. Oxidation of reduced inorganic
sulphur compounds by acidophilic
thiobacilli. FEMS Microbiol Rev. 1990; 75:
(2-3): 293- 306.
(8) Friedrich CG., Rother D., Bardischewsky
F., Quentmeier A., Fischer J. Oxidation of
reduced inorganic sulfur compounds by
bacteria: emergence of a common
mechanism? Applied and Environmental
Microbiology 2001; 67(7): 2873- 82.
(9) Liu J-Y., Xiu X-X., Cai P. Study of
formation of jarosite mediated by
Thiobacillus ferrooxidans in 9K medium.
Procedia Earth and Planetary Science 2009;
1(1): 706- 12.
(10) Garrity GM., Bell JA., Lilburn T. Bergey’s
Manual of Systematic Bacteriology.
Acidithiobacillales ord. nov. Verlag US:
Springer; 2005. 2 (B): 60- 63.
(11) Nemati M., Harrison SA. comparative
study on thermophilic and mesophilic
biooxidation of ferrous iron. Minerals
Engineering 2000; 13(1): 19- 24.
(12) Valdebenito-Rolack EH., Araya TC.,
Abarzua LE., Ruiz-Tagle NM., Sossa KE.,
Aroca GE., Urrutia HE. Thiosulphate
oxidation by Thiobacillus thioparus and
Halothiobacillus neapolitanus strains
isolated from the petrochemical industry.
Electronic Journal of Biotechnology 2011;
14 (1): 7-8.
(13) Øvreås L., Torsvik V. Microbial diversity
and community structure in two different
agricultural soil communities. Microbial
Ecology 1998;15 -303 :(4 -3)36ل.
(14) Nowaczyk K., Domka F. Kinetic Model of
CuS Oxidation by. Polish Journal of
Environmental Studies 2000; 9 (3): 195-201.
(15) Thompson JD., Gibson T., Higgins DG.
Multiple sequence alignment using
ClustalW and ClustalX. Current Protocols
in Bioinformatics 2002; 2 (1): 2- 3.
(16) Hiraishi A., Nagashima KV., Matsuura K.,
Shimada K., Takaichi S., Wakao N.
Phylogeny and photosynthetic features of
Thiobacillus acidophilus and related
acidophilic bacteria: its transfer to the genus
Acidiphilium as Acidiphilium acidophilum
comb. nov. International Journal of
Systematic Bacteriology 1998; 48(4): 1389-
98.
(17) White C., Shaman AK., Gadd GM. An
integrated microbial process for the
bioremediation of soil contaminated with
toxic metals. Nature Biotechnology 1998;
16(6): 572- 5.
(18) Pasricha N., Abrol Y. Food production and
plant nutrient sulphur. Sulphur in Plants.
Netherlands: Springer; 2003: 29- 44.
(19) Kashirad A., Bazargani J. Effect of sulfur
on pH and availability of phoshorus in
calcareous soils, influence of sulfur and
nitrogen on yield and chemical composition
Page 13
6931لتهب ه ،ل22 ش ها للل،لشش سه للللهه،للشمهس ل رواوگانهسر لپژوهش لست ل-فصامه علما لل621
of corn. Zeitschrift für Pflanzenernährung
und Bodenkunde 1972; 131(1): 6- 13.
(20) Brito EM., Piñón-Castillo HA.,
Guyoneaud R., Caretta CA., Gutiérrez-
Corona J F., Duran R. Bacterial biodiversity
from anthropogenic extreme environments:
a hyper-alkaline and hyper-saline industrial
residue contaminated by chromium and iron.
Applied Microbiology and Biotechnology
2013; 97(1): 369- 78.
(21) Kappler U., Davenport K., Beatson S.,
Lucas S., Lapidus A., Copeland A.
Complete genome sequence of the
facultatively chemolithoautotrophic and
methylotrophic alpha proteobacterium
Starkeya novella type strain (ATCC 8093T).
Standards in Genomic Sciences 2012; 7(1):
44.
(22) Alam M., Pyne P., Mazumdar A., Peketi
A., Ghosh W. Kinetic enrichment of 34
S
during proteobacterial thiosulfate oxidation
and the conserved role of SoxB in SS bond
breaking. Applied and Environmental
Microbiology 2013; 79(14): 4455- 64.
(23) Bardsley C., Lancaster J. Determination of
reserve sulfur and soluble sulfates in soils.
Soil Science Society of America Journal
1960; 24(4): 265- 8.
(24) Kelly DP., McDonald IR., Wood AP.
Proposal for the reclassification of
Thiobacillus novellus as Starkeya novella
gen. nov., comb. nov., in the alpha-subclass
of the Proteobacteria. International Journal
of Systematic and Evolutionary
Microbiology 2000; 50(5): 1797- 802.
(25) Okabe S., Odagiri M., Ito T., Satoh H.
Succession of sulfur-oxidizing bacteria in
the microbial community on corroding
concrete in sewer systems. Applied and
Environmental Microbiology 2007; 73(3):
971- 80.
(26) Riffaldi R., Saviozzi A., Cardelli R.,
Cipolli S., Levi-Minzi R. Sulphur
mineralization kinetics as influenced by soil
properties. Biology and Fertility of Soils
2006; 43(2): 209- 14.
(27) McDonald IR., Kelly DP., Murrell JC.,
Wood AP. Taxonomic relationships of
Thiobacillus halophilus, T. aquaesulis, and
other species of Thiobacillus, as determined
using 16S rDNA sequencing. Archives of
Microbiology 1996; 166(6): 394- 8.
(28) Kelly DP., Wood AP. Reclassification of
some species of Thiobacillus to the newly
designated genera Acidithiobacillus gen.
nov., Halothiobacillus gen. nov. and
Thermithiobacillus gen. nov. International
Journal of Systematic and Evolutionary
Microbiology 2000; 50(2): 511- 6.
(29) Robertson LA., Kuenen JG. The genus
Thiobacillus. The Prokaryotes: New York:
Springer; 2006: 812- 27.
(30) Wood AP., Kelly DP. Isolation and
physiological characterisation of
Thiobacillus thyasiris sp. nov., a novel
marine facultative autotroph and the putative
symbiont of Thyaspira flexuosa. Archives of
Microbiology 1989; 152(2): 160- 6.
(31) Kappler U., Bacterial sulfite-oxidizing
enzymes. Biochimica et Biophysica Acta
(BBA)-Bioenergetics 2011; 1807(1): 1- 10.
(32) Rzhepishevska O. Physiology and
Genetics of Acidithiobacillus species:
Applications for Biomining. Umea
university, Sweden. 2008; 1- 73.
(33) Kappler U., Aguey-Zinsou K-F., Hanson
GR., Bernhardt PV., McEwan AG.
Cytochrome c551 from Starkeya novella
characterization, spectroscopic properties,
and phylogeny of adiheme protein of the
soxAX family. Journal of Biological
Chemistry 2004; 279(8): 6252- 60.
(34) Dambe T., Quentmeier A., Rother D.,
Friedrich C., Scheidig AJ. Structure of the
cytochrome complex soxXA of Paracoccus
pantotrophus, a heme enzyme initiating
chemotrophic sulfur oxidation. Journal of
Structural Biology 2005; 152(3): 229- 34.
(35) Middaugh C., MacElroy R. The Effect of
Temperature on Ribose-5-phosphate
Isomerase from a Mesophile, Thiobacillus
thioparus, and a Thermophile, Bacillus
Page 14
ل621لنونایل تگک هم اوایلل بااسلولیکشهواسنونایلیالخه،للۀدکممدرگک لیههلیبهک الت ولشمهسهلیددگسهس
caldolyticus. Journal of Biochemistry 1976;
79(6): 1331- 44.
(36) Lyric RM., Suzuk I. Enzymes involved in
the metabolism of thiosulfate by
Thiobacillus thioparus. I. Survey of
enzymes and properties of sulfite:
cytochrome c oxidoreductase. Canadian
Journal of Biochemistry 1970; 48(3): 334-
43.
(37) Ghosh W., Dam B. Biochemistry and
molecular biology of lithotrophic sulfur
oxidation by taxonomically and ecologically
diverse bacteria and archaea. FEMS
Microbiology Reviews 2009; 33(6): 999-
1043.
(38) Attoe O., Olson R. Factors affecting rate of
oxidation in soils of elemental sulfur and
that added in rock phosphate-sulfur fusions.
Soil Science 1966; 101(4): 317- 25.
(39) Germida J., Janzen H. Factors affecting the
oxidation of elemental sulfur in soils.
Fertilizer Research 1993; 35(1- 2): 101- 14.
(40) Salmanian N., Ebrahimipour G.,
Ghasemi M., Fakhari J. Isolation and
characterization of a Facultative
chemolithotrophic sulphur and iron
oxidizing bacterium from Ardabil acidic
springs. Biological Journal of
Microorganism 2012; 1(1): 1- 10.
1- Starkeya 2- Thiobacillus 3- Acidiphilium 4- Acidianus 5- Sulfolobus 6- Conductronic Unicam 2000 pH/EC meter 7- Pour plate method 8- TOP General Genomic DNA Purification Kit,(mini-
prep), Topaz Gen Research, Iran. 9- NanoDrop 2000c spectrophotometry (Thermo
Scientific, USA) 10- InsTAclone PCR Cloning Kit, (Fermentas, USA) 11- ABI 3730 capillary sequencer 12- Thiobacillus thioparus 13- Thiobacillus thiophilus 14- Thiobacillus aquaesulis 15- Starkeya novella 16- Thiobacilluc novellus 17- Thiobacillus versutus 18- Thiosulfate-Oxidizing Multi-Enzyme System, TOMES 19- Reverse-acting sulfate-reducing systems
