JOURNEES DES AVRIL 2014 ROUEN

PLAN - Introduction

- Tube digestif

- Définition du Microbiote intestinal

- Méthodes de caractérisation

- Composition

- Établissement, stabilité, Adaptabilité

- Fonctions

- Dysbiose

- Applications thérapeutiques

- Conclusion

- Bibliographie

TUBE DIGESTIF

10x plus de bactéries dans l'intestin que de cellules dans le corps humain !!!!!!!

Grande Surface 400m2 !!!

X2

DEFINITION MICROBIOTE INTESTINAL

MICROBIOTE = communautés de micro-organismes qui résident ou transitent dans le tube digestif.

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-10 bactéries : 10 fois le nb de cellule de l’organisme environ 100 fois plus de gènes que le génome humain

- >500 espèces différentes réparties le long du tube digestif

METHODES DE CARACTERISATIONS

Seulement 20-30% des bactéries du tractus digestif sont cultivables par les méthodes classiques de culture A-

> Utilisation ARN ribosomal 16S en tant que marqueur de la diversité génétique > Gène codant l’ARN 16S (ADNr 16S) présent chez toutes les bactéries

- méthodes de séquençage

- empreintes

- PCR quantitative

- Hybridation in situ

- METAGENOMIQUE = étude des génomes de l’ensemble des organismes présents dans un échantillon( MICROBIOME <-> Génome associé au Microbiote)

COMPOSITION

COMPOSITION ET FACTEURS DE VARIATIONS

FLORE COLIQUE

FLORE DOMINANTE – SOUS DOMINANTE

Flore DOMINANTE 10-20 espèces avec Niveau de population élevé

Flore SOUS-DOMINANTE

Bactéries Anaérobies Surtout BGN non sporulés Bacteroides +++ BG+ = eubacteria, clostridiaBifidobacteriumCatenabacteriumCocci GP

Bactéries aero/anaérobies facultatives Enterobacteries, strepto,

Flore de passage

Entérobacteries Citrobacter, klebsiella, proteusLevures Candia albicans présent dans 50-60% cultures.

ETABLISSEMENT, STABILITE, ADAPTABILITE

DU MICROBIOTE

CONDITIONS D' HYGIENE

3. SPECIFICITE.

On peut classer les individus selon leur Entérotype.

Chaque individu : Héberge environ 200 espècesA un Microbiote qui lui est propre

FONCTIONS

ÉpithéliumIntestinal

Synthèse

Absorption

Fermentation des glucides ++++++

AGCCGAZ

- - BUTYRATE : directement utilisé par l’épithélium colique tirant 60-70% de son énergie des produits de fermentation bactérienne. - ACETATE : fournit énergie au tissu musculaire + substrat à la synthèse de cholestérol. - PROPIONATE : utilisé par le foie pour la néoglucogénèse

Métabolisme des protéines

Par Protéases

désamination

désamination

Cellule de paneth

Cellule souche

Différenciation + Prolifération des cellules épithéliales intestinales

Développement de l’angiogenèse

- Maturation épithélium intestinal- Vascularisation des villosités - Renforcement des jonctions cellulaires- Augmentation de la cellularité du chorion- Augmentation des cryptes

Jonctions renforcées

5. FONCTIONS EMERGENTES

- Neuromodulation Relation Microbiote -Intestin- Cerveau

- Rôle dans la régulation du stockage des graisses

DYSBIOSEET

PATHOLOGIES

DYSBIOSE = état de déséquilibre

Prise IPP

Prise ATB

Ingestions de micro-organismes

Voyages, changements d'environnements

Implications de la Dysbiose dans :

- Infections intestinales

- Diarrhées aux ATB

- Pullulation du grêle

- Colites de diversion

- MICI

- SII

- Cancérogènése dans le tractus digestif

- Maladies extra-digestives :

Syndrome Métabolique, Obésité

Allergies

Sokol et al. IBD 2009

=>=> Rôle anti-inflammatoire de F. prausnitzii

homéostasie Dysbiose Transitoire

Dysbiose Persistante INFECTION à CD

Exposition à C.D

Ex : Diarrhées à Clostrium Difficile

Exposition à un ATB

MODULATIONS THERAPEUTIQUES

c v=> OBJECTIF = EUBIOSE

=> MOYENS :

Approche Nutritionnelle modification des apports en fibres fermentescibles

Approche Microbiologique Probiotique Prébiotique Symbiotiques ATB

Transplantation Fécale

- Microbiote intestinal = véritable organe complexe et riche- Unique = carte d’identité d’un individu- Interactions majeures avec l’hôte- Rôles : barrière + métabolique + immunologique- Implication dans de nombreuse pathologies en cas de déséquilibre - De nombreuses implications restent à explorer…

Gigantesque et passionnant défi à relever !

CONCLUSION