Nagoya.R #6 LT Beanplot

beanplot で密度を観察する

2011/08/27 Nagoya.R #6 @ 名古屋大学地球水循環研究センター

阪上　辰也（　　　　　　　　外国語教育研究センター）

1Saturday, August 27, 2011

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•阪上辰也 (SAKAUE, Tatsuya)• ID: sakaue でｺｿｺｿ• 所属: 広島大学 ... 特任講師（言語習得研究とか...）• Nagoya.R / Hiroshima.R 主催• Osaka.R #5, #6 でもしゃべりました• 詳しくは...


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経緯など...

•先日，箱ひげ図を描きました

• (・∀・)ｲｲ!! ので皆さんも描いてみてください

•さらに良さ気な図を見つけました

•今日はそんなご報告を


Agenda

1. 箱ひげいいよ箱ひげ2. beanplot も(・∀・)ｲｲ!!3. 作図 tips（時間があれば）


Agenda

1. 箱ひげいいよ箱ひげ2. beanplot も(・∀・)ｲｲ!!3. 作図 tips


1. 箱ひげ図いいよ箱ひげ図

•正式名：box-and-whisker plot [Tukey, 1977]

•複数の標本を比較するのに利用•箱の長さからデータの「幅」を比較

• 3つ以上の標本でも比較しやすい

•なぜかあまり見かけない... 気のせい？


•boxplot() 関数であっさり作図• usage: boxplot(x, horizontal=TRUE)

• horizontal は，箱を横にするオプション




図：英語のフレーズを読んだ際の反応時間の分布（8月20日発表）



図：英語のフレーズを読んだ際の反応時間の分布（8月20日発表）

中央値

外れ値

箱の端＋四分位値＊1.5の範囲で一番大きな値（ひげ先）

四分位値


> x <- read.csv(sample.csv)> boxplot(x[,1])> boxplot(x[,1], horizontal=TRUE)

サンプルデータで作図




ということでもっと「箱ひげ図」を使いましょう


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2. beanplot も(・∀・)ｲｲ!!

•正規分布しない分布もある

•コーパス中のある言葉の頻度•反応時間

•箱ヒゲ図では，分布の密度が分からない•密度を示せる図として beanplot を利用


2. beanplot も(・∀・)ｲｲ!!> library(beanplot)> g <- rnorm(200,mean=0,sd=1)> bm <- c(rnorm(100,mean=-1,sd=0.5),rnorm(100,mean=1,sd=0.5))> uni <- runif(200,min=-2,max=2)> d = data.frame(uni=uni,bm=bm,gaus=g)> par(mfrow = c(1,2))> boxplot(d, col = "lightblue")> beanplot(d, col = "lightpink")

drkcore「Beanplotは密度を視覚的にわかりやすくしたBoxplotの亜種」よりhttp://blog.kzfmix.com/entry/1306409057


http://blog.kzfmix.com/entry/1306409057

http://blog.kzfmix.com/entry/1306409057


手元のデータで描いてみました（英語表現を見た際の反応時間）



【緩募】縦のラインが飛び出る理由...



【緩募】beanplot の日本語名... 空豆図...



分布比較にもってこいの箱ヒゲ図・beanplot

を描いてみてください22Saturday, August 27, 2011

Agenda



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3. 作図 tips: フォント

• windowsFonts() 関数でフォント設定•デフォルトは英文フォント(?)

•日本語の設定なら...

> windowsFonts(JP1=windowsFont("MS Gothic"),JP2=windowsFont("MS Mincho"))


• xaxt="n" というオプションの指定

•軸ごとのフォントを変えたかった

•後から指定するため，作図時の出力を回避（X軸に項目を表示しない）

• Y軸なら yaxt="n"

3. 作図 tips: 軸いじり


3. 作図 tips: 今回の作図> x <- read.csv("hoge.csv") # データの入ったCSV ファイルの読み込み

> par(family="JP2", ps=16) # 出力される文字のフォント（MS Mincho）を指定。ps はフォントサイズ

> boxplot(x, horizontal=TRUE, xaxt="n") # 箱を横に描き、X軸のみ何も表示しない設定

> axis(1, family="serif", ps=12) # X軸の項目について、フォントを serif（Time New Roman）に指定して出力


まとめ

分布比較にもってこいの箱ヒゲ図・beanplot

を描いてみてください28Saturday, August 27, 2011

参考文献


ご清聴ありがとうございました

twitter: @sakaue

e-mail: tsakaue<at>hiroshima-u.ac.jp


Date post:	24-Dec-2014
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