P
LICENCE PROFESSIONNELLE
Sciences, Technologies, Santé (STS)
R
Mention
BIO-INDUSTRIES ET BIOTECHNOLOGIES (BIB)
O
G
R
A
M
M
E
2015-2016
Université Pierre et Marie Curie – Paris 6 Licences Professionnelles Bât. F. Sud - 6ème étage, porte 657 Boîte postale 43 - 4 place Jussieu - 75252 Paris Cedex 05 http://www.licence.chimie.upmc.fr/fr/02_licences_professionnelles.html http://www.facebook.com/LicencesProfessionnellesIcp
Bio-Industries et Biotechnologies (BIB)
Intitulé de l’UE 1 : ADN et Protéines : Rappels
Code de l’UE : 3C900
Responsable de l’UE : Bruno Collinet ([email protected])
Plateforme de rattachement : Secrétariat des Licences Professionnelles
1. Descriptif de l’UE
Nombre de crédits de l’UE : 3 ECTS
Semestre où l’enseignement est proposé : S5 - 1er
semestre
Effectifs prévus : 10 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
Remise à niveau et rappels sur la structure des acides nucléiques et des protéines.
a) Objectifs de l'UE Rappeler les notions de base de biochimie des protéines et des acides nucléiques devant être acquises au sortir de
la 2ème
année de licence.
b) Thèmes abordés Structure et propriétés des acides aminés
Organisation de la structure des protéines (différents niveau structuraux : primaire, secondaire, tertiaire et
quaternaire)
Structure des acides nucléiques (nucléosides, nucléotides). Organisation de la molécule d’ADN en double hélice
Comparaison ADN et ARN.
c) Organisation pédagogique
d) Modalités d’évaluation
Ecrit /0
Travaux Pratiques (TP)
Contrôle Continu (CC) /100
Oral /
Volume horaire
Cours (CM) 15
Travaux Dirigés (TD) 15
Travaux Pratiques (TP)
Bio-Industries et Biotechnologies (BIB)
Intitulé de l’UE 2 : Technologie des Protéines et Analyses
Code de l’UE : 3C901
Responsable de l’UE : Bruno Collinet ([email protected])
Plateforme de rattachement : Secrétariat des Licences Professionnelles
1. Descriptif de l’UE
Nombre de crédits de l’UE : 9 ECTS
Semestre où l’enseignement est proposé : S5 - 1er
semestre
Effectifs prévus : 10 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
Structures, interactions et méthodes d’analyse des protéines.
a) Objectifs de l'UE Acquérir des connaissances théoriques sur la structure des protéines en relation avec leur fonction et sur les
interactions protéine-ligand ou protéine-protéine, ainsi que sur les méthodes de purification et d’analyse
spectroscopiques des protéines
Acquérir un savoir faire pratique sur les méthodes de séparation, de caractérisation / identification des protéines
et de mesure d’activité enzymatique.
b) Thèmes abordés Structures et interactions des protéines
Méthodes de purification des protéines (fractionnement, chromatographie, électrophorèse, conditionnement)
Spectroscopie optique (fluorescence, infra-rouge, dichroïsme circulaire)
Spectrométrie de masse.
c) Organisation pédagogique
d) Modalités d’évaluation
Ecrit /0
Travaux Pratiques (TP) /30
Contrôle Continu (CC) /70
Oral /0
Volume horaire
Cours (CM) 18
Travaux Dirigés (TD) 18
Travaux Pratiques (TP) 24
Bio-Industries et Biotechnologies (BIB)
Intitulé de l’UE 3 : Technologie des Acides Nucléiques
Code de l’UE : 3C902
Responsable de l’UE : Catherine Esnault ([email protected])
Plateforme de rattachement : Secrétariat des Licences Professionnelles
1. Descriptif de l’UE
Nombre de crédits de l’UE : 9 ECTS
Semestre où l’enseignement est proposé : S5 - 1er
semestre
Effectifs prévus : 10 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
Acides nucléiques : structures, méthodes d’analyse, interactions et outils biotechnologiques.
a) Objectifs de l'UE Acquérir les bases structurales des acides nucléiques en relation avec leurs propriétés physico-chimiques,
permettant de comprendre les interactions moléculaires et les méthodes d’analyse
Introduction aux techniques du clonage moléculaire et aux technologies de PCR.
b) Thèmes abordés Les structures des bases à celles de la double hélice d’ADN. Réactivité chimique, propriétés physico-
chimiques. Purification, analyse. Hybridation, Southern, enzymologie, marquage radioactif et fluorescent des
fragments d’ADN. Séquençage haut débit. Interaction ADN-protéine, chromatine et étude du complexe de
transcription. Maintien de l’information génétique.
Les structures de l’ARN et leurs fonctions. Méthodes d’étude, purification de l’ARN, transcription in-vitro,
reverse transcription, Northern. Nucléosides d’intérêt thérapeutique et pharmacologique. ARN non codants,
siRNA et miRNA. Ribozymes naturels et artificiels. Une méthodologie prometteuse, la méthode SELEX et
caractérisation des aptamères. Distribution phylogénétique des ARN.
Les vecteurs de clonage moléculaire, les plasmides et leurs utilisations. Méthodes de purification et d'insertion
d'un fragment d'ADN. La technique de PCR : ses variantes et ses applications. Introduction à la PCR en temps
réel.
Travaux Pratiques : Clonage du gène dans un vecteur d’expression (bio-informatique, purification d’ADN,
enzymologie, transformation bactérienne, PCR). Etude de la migration des différentes formes d’ADN.
c) Organisation pédagogique
d) Modalités d’évaluation
Ecrit /0
Travaux Pratiques (TP) /30
Contrôle Continu (CC) /70
Oral /0
Volume horaire
Cours (CM) 14
Travaux Dirigés (TD) 14
Travaux Pratiques (TP) 32
Bio-Industries et Biotechnologies (BIB)
Intitulé de l’UE 4 : Projet Tuteuré - BIB
Code de l’UE : 3C903
Responsable de l’UE : Hubert Becker ([email protected])
Plateforme de rattachement : Secrétariat des Licences Professionnelles
1. Descriptif de l’UE
Nombre de crédits de l’UE : 9 ECTS
Semestre où l’enseignement est proposé : S5 - 1er
semestre
Effectifs prévus : 10 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'UE Acquérir une pratique expérimentale de haut niveau.
b) Thèmes abordés Travail sur des projets de recherche fondamentale ou appliquée.
c) Organisation pédagogique
Le Projet Tuteuré se déroule au sein des équipes de recherche de Paris Centre sous la responsabilité d’un maître
de stage qui est aussi tuteur pédagogique, c’est-à-dire qu’il assure le suivi en entreprise.
Il assiste l’étudiant lors de la rédaction du rapport et de la préparation à la soutenance orale.
Ce choix d’organisation permet une meilleure connaissance de l’étudiant.
Dans la mesure du possible, le domaine d'étude sera en accord avec la mission en entreprise.
d) Modalités d’évaluation
Ecrit /0
Travaux Pratiques (TP) /20
Contrôle Continu (CC) /30
Oral /50
Volume horaire
Cours (CM)
Travaux Dirigés (TD)
Travaux Pratiques (TP) 150
Bio-Industries et Biotechnologies (BIB)
Intitulé de l’UE 5 : Ingénierie des Protéines et Pharmacologie
Code de l’UE : 3C904
Responsable de l’UE : Hubert Becker ([email protected])
Plateforme de rattachement : Secrétariat des Licences Professionnelles
1. Descriptif de l’UE
Nombre de crédits de l’UE : 6 ECTS
Semestre où l’enseignement est proposé : S6 – 2ème
semestre
Effectifs prévus : 10 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
Module de Biologie Moléculaire et de Biochimie des Protéines.
a) Objectifs de l'UE Savoir produire une protéine recombinante
Acquérir des techniques de base en génie génétique
Être en mesure de relier la structure et la fonction des protéines
Acquérir les notions de base en pharmacologie.
b) Thèmes abordés Systèmes d’expression de protéines : description des vecteurs et souches
Optimisation de l’expression de protéines (condition de culture, co-transformation, souches spécialisées)
Techniques de génie-génétique et ingénierie des protéines (ADN recombinant, PCR, vecteurs, clonage,
mutagénèse dirigée et aléatoire, évolution dirigée)
Pharmacologie des récepteurs (formation du complexe, quantification, caractérisation)
Protéines et médicaments : de la découverte à la mise sur le marché.
c) Organisation pédagogique
Production de protéines recombinantes et Ingénierie des protéines (cours + TD)
Expression, purification et caractérisation d’une protéine recombinante (TP)
Pharmacologie (cours + TD)
Conférences dispensées par des partenaires industriels.
d) Modalités d’évaluation
Ecrit /0
Travaux Pratiques (TP) /30
Contrôle Continu (CC) /70
Oral /0
Volume horaire
Cours (CM) 29
Travaux Dirigés (TD) 29
Travaux Pratiques (TP) 32
Bio-Industries et Biotechnologies (BIB)
Intitulé de l’UE 6 : Génie Génomique et Cellulaire
Code de l’UE : 3C905
Responsable de l’UE : Martine Boccara ([email protected])
Plateforme de rattachement : Secrétariat des Licences Professionnelles
1. Descriptif de l’UE
Nombre de crédits de l’UE : 6 ECTS
Semestre où l’enseignement est proposé : S6 – 2ème
semestre
Effectifs prévus : 10 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'UE Acquérir les bases des méthodes de la génomique et approfondir les connaissances et les savoir-faire concernant
les cultures cellulaires animales et leurs applications.
b) Thèmes abordés
Génomique structurale et fonctionnelle (30h) :
Génomique structurale :
Organisation des génomes eucaryotes (séquences répétées et séquences uniques)
Les outils de la génomique (manipuler et conserver le génome)
Les différents types de banques (phages, BAC, YAC)
Cartes génétiques et cartes physiques (marche chromosomique)
TD : application de la cartographie.
Génomique fonctionnelle :
La méthode cDNA AFLP, Construire des banques soustractives, Profils d’expression (transcriptome, protéome),
TD : banque soustractive exemple
Conférences : (2h) Puces à ADN, (2h) Proteomique, (2h) Séquençage des génomes, (1j) Visite au Génoscope
Travaux pratiques, transformation de la levure, génotypage (en alternance).
Génie cellulaire (30h) :
Le cycle cellulaire, sa régulation et ses dérèglements
L’apoptose : phases, acteurs, rôles
Cultures cellulaires animales : obtention, entretien, conservation des lignées cellulaires animales
Applications biotechnologiques des cultures cellulaires animales :
Production de protéines recombinantes
Technologie des anticorps monoclonaux
Etude de différentes lignées de cellules cellulaires utilisées en Recherche, Développement et Production
Méthodes de quantification cellulaire, tests de cytotoxicité
Mise en évidence et quantification de l’apoptose
Transfection transitoire de gènes rapporteurs
Conférence : Ingénierie des anticorps monoclonaux (3h).
c) Organisation pédagogique
d) Modalités d’évaluation
Ecrit /0
Travaux Pratiques (TP) /30
Contrôle Continu (CC) /70
Oral /0
Volume horaire
Cours (CM) 17
Travaux Dirigés (TD) 17
Travaux Pratiques (TP) 26
Bio-Industries et Biotechnologies (BIB)
Intitulé de l’UE 7 : Séquences, Structures et Assemblages Macromoléculaires
Code de l’UE : 3C906
Responsable de l’UE : Julien Henri ([email protected])
Plateforme de rattachement : Secrétariat des Licences Professionnelles
1. Descriptif de l’UE
Nombre de crédits de l’UE : 6 ECTS
Semestre où l’enseignement est proposé : S6 – 2ème
semestre
Effectifs prévus : 10 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'UE Acquérir des compétences dans le domaine de la bioinformatique et de la modélisation moléculaire, afin de
comprendre le mode d’assemblage, d’interactions et la fonction des complexes macromoléculaires.
b) Thèmes abordés
Analyses de séquences et de structures des acides nucléiques et des protéines :
Banques de données, Comparaison de séquences, Alignements, Recherche de cadres ouverts de lecture
Modélisation de complexes protéines-ligands :
Visualisation de structures en 3D, Modélisation par homologie, Reconnaissance de repliements, Docking.
c) Organisation pédagogique
d) Modalités d’évaluation
Ecrit /0
Travaux Pratiques (TP) /30
Contrôle Continu (CC) /70
Oral /0
Volume horaire
Cours (CM) 17
Travaux Dirigés (TD) 17
Travaux Pratiques (TP) 26
Bio-Industries et Biotechnologies (BIB)
Intitulé de l’UE 8 : Formation pour l’Entreprise - BIB
Code de l’UE : 3C907
Responsable de l’UE : Virginie Mansuy ([email protected])
Plateforme de rattachement : Secrétariat des Licences Professionnelles
1. Descriptif de l’UE
Nombre de crédits de l’UE : 3 ECTS
Semestre où l’enseignement est proposé : S6 – 2ème
semestre
Effectifs prévus : 10 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'UE Cette UE a pour objectif de donner aux étudiants une formation complémentaire, leur permettant de mieux
connaître le monde de l’entreprise pour leur future intégration.
b) Thèmes abordés
Les enseignements dispensés sont les suivants :
Cours d’hygiène et sécurité, avec passage du brevet de Sauvetage Secourisme du Travail
Une formation en anglais en laboratoire de langue, avec passage du TOEIC
Cours de communication
Ce module est découpé par tranche de 30h par enseignement.
c) Organisation pédagogique
d) Modalités d’évaluation
Ecrit /0
Travaux Pratiques (TP) /0
Contrôle Continu (CC) /100
Oral /0
Volume horaire
Cours (CM) 45
Travaux Dirigés (TD) 45
Travaux Pratiques (TP)
Bio-Industries et Biotechnologies (BIB)
Intitulé de l’UE 9 : Apprentissage en Entreprise - BIB
Code de l’UE : 3C908
Responsable de l’UE : Bruno Collinet ([email protected])
Plateforme de rattachement : Secrétariat des Licences Professionnelles
1. Descriptif de l’UE
Nombre de crédits de l’UE : 9 ECTS
Semestre où l’enseignement est proposé : S5 et S6 – 1er
et 2ème
semestre
Effectifs prévus : 10 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'UE Acquérir une pratique du travail en entreprise.
b) Thèmes abordés
Missions de recherche, de fabrication …, en relation avec la formation théorique et pratique à l’Université.
c) Organisation pédagogique
Le maître d’apprentissage encadre l’étudiant au quotidien, pour lui permettre d’acquérir les compétences
relatives aux métiers préparés.
d) Modalités d’évaluation
Quinze critères prédéfinis sont évalués par le maître d’apprentissage, pour permettre de noter le travail de
l’étudiant (TP).
Un rapport d’activité est rédigé et évalué par une note de Contrôle Continu (CC).
Une soutenance orale permet d’apprécier la présentation et les connaissances du candidat.
Ecrit /0
Travaux Pratiques (TP) /20
Contrôle Continu (CC) /30
Oral /50
Volume horaire
Cours (CM)
Travaux Dirigés (TD)
Travaux Pratiques (TP) 24 semaines