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Transicin del Estado de la
Cromatina durante el Proceso de
Recuperacin de Estrs Hdrico enArabidopsis thaliana
Programa Doctorado en Ciencias m. Ingeniera Gentica Vegetal
Instituto de Biologa Vegetal y Biotecnologa
Universidad de Talca
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Introduccin
En Eucariontes las modificaciones epigenticas se correlacionan conla actividad gnica de varios procesos biolgicos, incluyendo
respuesta a estrs.
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NucleosomaCore de histonasextremo
N-terminalmodificaciones en K, S,R.
Enzimas modificadoras de histonas: HAT
HDAC
HMT
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H3K4me3
H3K9ac
Pueden ser usados como marcadores de estado activo de
la expresin de genes (Justin et al., 2010)
Se han observado modificaciones en las lisinas de la
histona H3, que forman parte de nucleosomas de
genes de respuesta a estrs hdrico (Kim et al., 2008).
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Kim et al.
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Estudios de perfiles de expresin usando DNA microarray mostraron
que genes inducibles por deshidratacin son inactivados por
rehidratacin (Oono et al., 2003).
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Se sabe poco acerca de cambios en la estructura de
la cromatina en respuesta a la deshidratacin.
Se determin la ocupancia del nucleosoma,acumulacin de RNAP II, alteraciones de H3Km3 y
H3K9ac, mediante ChIP en:
Genes inducidos por sequa: RD29A, RD20 yAtGOLS2
Genes inducidos por rehidratacin: ProDH
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Materiales y mtodos
Plantas deArabidopsis thaliana ecotipo Columbia, de
15 das, crecidas en placas petri en medio GM, con
sales MS, 1% sacarosa, 0,8% bacto-agar bajo
condiciones de da largo (16h luz/ 8h osc.) a 22C. Sometidas a estrs por shock deshidratante.
Las muestras de plantas se tomaron antes del
tratamiento por deshidratacin, 4 h despus de
tratamiento, y 1, 2, 3 y 5 h despus de los
tratamientos de rehidratacin.
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Se aisl RNA total
Se realiz sntesis de cDNA, con primers especficos, mediante
RT-PCR. Producto se ti con SYBR-Gold, se detect seal con
Flourolmager SI.
Observar perfiles de acumulacin de RNA durante el ensayo.
At5g52310 spliced RD29A
unspliced RD29A
At2g3380 RD20
At1g56600 AtGOLS2
At3g30775 ProDH
At5g09810 ACT7
At5g55670
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Immnunoprecipitacin de Cromatina (ChIP)
Se realiz utilizando los siguientes anticuerpos: Anti-H3K4me3
Anti-H3K9ac
anti-histone H3
Anti-RNAPII
Evaluacin por qPCR
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Resultados
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RNAP II responde rpidamente a la inactivacin por
rehidratacin de los genes de respuesta a estrs por
deshidratacin.
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Cambios en la densidad del nucleosoma ocurren
durante el proceso de recuperacin de estrs por
deshidratacin.
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Enriquecimiento de H3K4me3 es mantenido en genes
inducidos por deshidratacin despus de la inactivacin
por rehidratacin.
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H3K9ac rpidamente responde a la inactivacin de
genes por rehidratacin y es drsticamente reducida en
genes inducidos por deshidratacin.
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En resumen
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Conclusiones y proyecciones futuras
La alteracin de modificaciones de histonas, tales comola adicin y remocin de H3K4me3 y H3K9ac, afectan laactivacin e inactivacin de genes regulados porestrs.
Se sabe poco acerca de cuales enzimas modificadorasde histonas y factores de remodelacin de cromatinacatalizan estas reacciones.
La identificacin de estas enzimas ser esencial para
aumentar el conocimiento de las redes regulatoriastranscripcionales en respuesta a estrs abitico.
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