Red Temática del Código de Barras de la Vida –MexBoL, Laboratorio del nodo IBUNAM Taller de Introducción al Proyecto Internacional del Código de Barras de la Vida (iBOL) y su Sistema BOLD Instituto de Biología, UNAM Agosto 11-13 de 2010 Impartido por: Lidia I. Cabrera, Patricia Escalante y Patricia Rosas El curso está dirigido a personas interesadas en desarrollar proyectos para producir y publicar códigos de barras del ADN, utilizando sus datos en el sistema de datos
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Red Temática del Código de Barras de la Vida –MexBoL,Laboratorio del nodo IBUNAM
Taller de Introducción alProyecto Internacional del Código de Barras de la Vida (iBOL) y su Sistema
BOLD
Instituto de Biología, UNAMAgosto 11-13 de 2010
Impartido por: Lidia I. Cabrera, Patricia Escalante y Patricia Rosas
El curso está dirigido a personas interesadas en desarrollar proyectos para producir y publicar códigos de barras del ADN, utilizando sus datos en el sistema de datos del código de barras de la vida (BOLD), que sean o no miembros de la Red Temática del Código de Barras de la Vida del CONACYT.
Lugar: Sala de Videoconferencias, Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México, Tercer Circuito Exterior, Ciudad Universitaria, México, D. F.
Inscripciones: Llenar y enviar el formato adjunto por correo electrónico a alguno de los correos del párrafo anterior. De haber más demanda de lo proyectado se programará en un par de meses otro curso.
Requisitos: Es recomendable que cada participante traiga una computadora portátil, con tarjeta de red inalámbrica o acceso a Internet por banda ancha (no cables). Es recomendable leer la literatura o páginas Web que se mencionan al final de este programa.
Duración: 20 horas.Cupo: Limitado a 25 personas.Costo: Ninguno.
Programa11 de agosto.9:00-10:00. Patricia Escalante. Introducción general:
La iniciativa iBOLPapel del CBOL y comunidad internacional de profesionistas de
códigos de barras moleculares.Apoyos del CONACYT y CONABIO a la Red MexBoLIntroducción al Proyecto del Código de Barras de la Vida.
Definición del código de barras molecular para animales, hongos y plantas.
Requisitos, acuerdos y compromisos para la participación de los investigadores en proyectos de códigos de barras moleculares.
Repercusiones en la comunidad de los profesionistas de las colecciones científicas, otras iniciativas informáticas.
Aplicaciones de los códigos de barras moleculares en ciencia, manejo y conservación de la biodiversidad.
10:00-11:00. Lidia I. Cabrera.Protocolo de colecta de muestras para los códigos de barras moleculares:
Colecta y manejo de muestras de plantas, animales y hongos para código de barras. Preservación en frío, en seco, en alcohol.
Características de un ejemplar para candidato a código de barras, estado de preservación, datos georeferenciados, fotografía del ejemplar y otros.
Especímenes de colecciones científicas.Identificación taxonómica preliminar.
11:00-11:15. Café.
11:15-13:45. Lidia I. Cabrera.Captura de datos en los formatos del sistema BOLD y de las
fotografías del ejemplar de referencia.
13:45-15:00. Comida.
15:00-16:00. Lidia I. Cabrera.Preparación pre-laboratorio:
Diseño o selección de muestras para el llenado de microplacas
Hoja de captura de datos de la placa.Laboratorio:
Métodos y protocolos del proyecto iBOL;Extracción de ADN genómico por medio de placas con fibras de
vidrio (glass fiber plate).VertebradosInsectos (protocolo destructivo y no destructivo de muestras)Plantas
16:00-16:15. Café.16:15-17:00. Lidia I. Cabrera.
Amplificación (PCR)Secuenciación
12 de agosto.9:00-11:00. Patricia Rosas.Bioinformática.General:
Introducción al Barcode of Life Data Systems (BOLDSYSTEMS.org).Taxonomía. Buscador. Listas autorizadas.Registro personal en BOLDProyectos publicados en BOLDCreando un nuevo proyecto.Buscando datos
11:00-11:15. Café.11:15-13:45. Patricia Rosas.Manejo de datos:
Integrando imágenes de los ejemplares de respaldoIntegrando cromatogramas y iniciadores oligonucleótidos
“primers”Integrando secuencias alineadas.Herramientas de análisis.
Síntesis de proyectos13:45-15:00. Comida.15:00-16:00. Patricia Rosas.Publicando:
Envío de datos a “GenBank”16:00-16:15. Café16:15-17:00. Patricia Rosas.
Preguntas.
13 de agosto.9:00-11:00 Patricia Rosas.Herramientas de análisis:
Biblioteca de imágenesMapas de distribuciónIdentificador del taxón en el árbol de distancia (NJ)“Engine” de identificación (semejante a BLAST)“Barcode index Numbers (BINs)”Síntesis de distanciaComposición de la secuencia
11:00-11:15. Café.11:15-14:00. Lidia I. Cabrera.
Síntesis de “Nearest Neighbour”Prueba de degradación de ADNCurva de acumulación de código de barras y muestras.Visor de alineamiento.
Conectividad externa:Servicio Web.
Clausura del curso y entrega de certificados de asistencia.
Literatura o páginas Web recomendadas.
CBOL Plant working Group. 2009. A DNA barcode for land plants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106: 12794-12797
Hebert, P. d. N., a. Cywinska, S. L. Ball y J. r. deWaard. 2003. Biological identifications through DNA barcodes. Proceedings of Royal Society of London B, 70: 313-321
Indique brevemente su interés en el curso (por ejemplo, estudio el grupo X y me gustaría añadir este conjunto de caracteres al estudio de su filogenia, ya he empezado un proyecto de códigos de barras pero tengo algunas dudas que quisiera despejar, etc.): ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
Algún detalle que quisiera ver en el programa:_______________________________________________________________
