+ All Categories
Home > Documents > Evolution of the genetic variability of eight French dairy cattle ...

Evolution of the genetic variability of eight French dairy cattle ...

Date post: 12-Mar-2023
Category:
Upload: khangminh22
View: 0 times
Download: 0 times
Share this document with a friend
21
HAL Id: hal-00999874 https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00999874 Submitted on 18 Jun 2014 HAL is a multi-disciplinary open access archive for the deposit and dissemination of sci- entific research documents, whether they are pub- lished or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers. L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d’enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés. Evolution of the genetic variability of eight French dairy cattle breeds assessed by pedigree analysis Coralie Danchin-Burge, Grégoire Leroy, M. Brochard, S. Moureaux, Etienne Verrier To cite this version: Coralie Danchin-Burge, Grégoire Leroy, M. Brochard, S. Moureaux, Etienne Verrier. Evolution of the genetic variability of eight French dairy cattle breeds assessed by pedigree analysis. Journal of Animal Breeding and Genetics, Wiley, 2012, 129 (3), pp.206-217. 10.1111/j.1439-0388.2011.00967.x. hal-00999874
Transcript

HAL Id: hal-00999874https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00999874

Submitted on 18 Jun 2014

HAL is a multi-disciplinary open accessarchive for the deposit and dissemination of sci-entific research documents, whether they are pub-lished or not. The documents may come fromteaching and research institutions in France orabroad, or from public or private research centers.

L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, estdestinée au dépôt et à la diffusion de documentsscientifiques de niveau recherche, publiés ou non,émanant des établissements d’enseignement et derecherche français ou étrangers, des laboratoirespublics ou privés.

Evolution of the genetic variability of eight French dairycattle breeds assessed by pedigree analysis

Coralie Danchin-Burge, Grégoire Leroy, M. Brochard, S. Moureaux, EtienneVerrier

To cite this version:Coralie Danchin-Burge, Grégoire Leroy, M. Brochard, S. Moureaux, Etienne Verrier. Evolution ofthe genetic variability of eight French dairy cattle breeds assessed by pedigree analysis. Journal ofAnimal Breeding and Genetics, Wiley, 2012, 129 (3), pp.206-217. �10.1111/j.1439-0388.2011.00967.x�.�hal-00999874�

��

��������������

������������Journal of Animal Breeding and Genetics����������������������

��������������� ������������������������������������������������

���������������� ������������

������� �������!��������"��#�$������%���&�����'��(�)�!�������"��

*� ����'������+"��,������-����������

��.���/����0�����1'2��"�"�#$�$�3���.��4�����!�������5�$����6����7��7�/������8�������592.��1'2��"�"�#$�$�3���.��4�����!�������5�$����6����:"7��;��&����;������8������

"5��������<,�6������7����/������8������

To maintain a sufficient amount of within�population genetic variability is required,

in order to allow the future generations of animals to be more and more adapted

to changing environmental conditions and breeding goals.��

8�4�����=�=��4����>�����������������������.���/����0�����+ ���4����=��4�

/�����,44������!�������

��

��������

.� �����������&����?��� ��=��4�����������8����������&������������������������������

����������������������6�������&���������=�������&������4 �������������0���>�������

9��4���������'���$������������������������ ����������&�?����6�������������=�

��������� ��?�� ���������� ��� ��� ��=��4����� ���������� �&��4�� 0����� ������� ����

����������&� ������� ��� ?��� �4���� ��4����� �=� ��?�� ��� 8������ �!��?��*?�����

8������ *�44���� ���� 8������ 2��� /������ 0��� ��� ?�� ��4������� ������� �.���������

����0��������������������������������6���0����==���6����4������=�����������=���?��

����� ��?���� ���@� ���� ����� 6������ ��?���� �7� �.��������� ���� 0���������� ���� 7��

�8������2���/������0����==���6�� � ��������A������������� �������6��������?����7"�

�.���������� ���� ���� �8������ 2��� /������ 0���� ������ ���� ��4 ����� ��� �������

6�������&� �=� ��� �+� ���� ���������� �=� ��� 8������ ������� ��&����(�� ���� ��� ����

� �������� 0��� ������ ?���� ��44����� ��� �������� ?��� ��� ������ �����&� �=� �����

=�?�� ��� ��� ��==����� ������� ��� ?�� ��� ��� �+������� �=� 4���� ��� ���� ��������

������(��� ���� ������ ���?��� ��� ?���6��� ��� ��A�� �=� ��� �������� ����� �������

��6����&��4 �6��������3������ ��&������������������&�������������������������3����

����=��4������������6����&� �����=�6��?��5����?����������=���������� ���&����(�����

����� �����6����� ��� ?�� ��� ���������� ��������� �����4�� ��� ������� ���� �=� �������

��6����&���������������������� ���4������

���������

���������6����&������&������8�������������������4���� ����������=��4��������&����(�

"�

�����������

������ ��� ��� =��&� &������ ��������� �����4�� ��� ��6�� ��� ��������� ���������� ��

4�B��� �������� ��� ���4����6����� �=� �������&� ���� � ������� =����� ������� �=� �����

������/��� ������������������� ������������������=�4�(�&���������������=�����=������

�������������� ����������=����� ��A��� �4 ��6�4����=�������4�� ����&������������=�

=�4���=����&������*�6����=��������?�������������������&�����=���=�?�����������

������6������6��&��������4�����=��==� �������������������6��������A������=�����������

�����6�� 4����=����=��4�����&������������ ������������������������������6�������

�=�&���������?�����������������&�� �����&��������������?������4����6�������������

����==������&��������6��&���==������ ������������==������&�.��=�����5���4��������.5���

��

5������������&���4�����������==�������4�����=�?����� � �������������6�������&��

��������������������������������������&������������4 ��6��=�����������������?��

�� �����6����C������=������D�=��� �����?��4��������� ������=��������������������

=��������� 8��� ���>������ ������� ������ �������� ��� ��==����� ���������� ?��� 6�������

����������� ���?��� ��� 4�������� ��� ������� 6�������&� �=� ���� ?���?���� ������

�����6���4������������������-��� ���4������������7E�F����������������E�F�4�����

F��( ����(������E� �������!������������������5�����������������4����������������

6�������&�?��������������&������������������6������&������� �����������&�����������

!��4��������*G(���������E�*H����������������7E�'���������������E�'��/��������

�����������

5������������4�����4����==���6��?�&��� �����6������������6�������&�������������

� ������ ��� �� �4 �4��� �� 4����� �������� �� � �4�A�� ��� ������� ����� ��� ��4��

���������������������������=�������������'��?������������������4���4�A����������=�

������������������������������=�����6�������������������������������@���0����������

6�������&� �=� �6����(� ������� ���� ���� ��� �����6��� ���(�� �� ��� ������6����� �=�

��������� 4������ ���4��� ���� �4��&��� 4��&�� =��A��� ��� �3���� �������� � �������

!����� ������ �������0���� ��� ���4���� ������� =��� ��� �������� �=�������� ��&����(�� =���

�6����(�� �����������4����������������������9�������������"�����1*.������������

8��������������8��������������+��=���������4����8����������&���������������� ����=�

��� ��������� �=� ��� 8������ ��&����(� �=��� �� ��4����� ��6����&� � ����� ����

???���&����(�������

5����� ������ � ����������������=���������4����8����������&������������?�����

���&A��� ����������,4 ������?�� ��� �� ��� �i�� ��� �6������ �=� ���?����� � ������

�������6�������&��6����4���&���4 ��������� ��6��������������������4�������������

�ii�� �����4 ��������=� ��� ������� � �������?�������+������������������+��� ���

���8��������&����(��5������������������ ������������?����������=����������&��0��&�

��?� ��� ������4��� �=� ��� ?����� � ������ ������� 6�������&� ��� ��4�� �=�

������������=������������������=�����������&�����������������6����=�����&�������

�����?�����4�����������������!������������������E�!��4�������������"E�8�������A�

���������7���

@�

��������������������

������������� � �� � �������������

.4���� ��� 6������� ����&� ���� ������� ������� ��� 8������� ����� �=� ��4� ����=�� =��4� ��

��������� �����4��?��� �����&��������=�&�����������������=������6��4�������*�4��

���������������=��������������������?�����0�����������������������(����&������������

� ��������A���0���>�������������>�%��������4����8����������&������������������

������� ��� �4��� �� ��� ����������� 0��� '���$������ �'�9�� ���� 9��4����� �9�2��

����������������=��4�?����==�����8���������������������?���==�����=�����������������

������������ � ��������A���=�'�9�����������?����������9�2������������.� �������

'�9� ��� ������� ��� �� �����4�B���&� �=� ��� ������&� ?������� 9�2� ��� 4���&� ������� ���

9��4���&��0��������������������4�&� ���!��?��*?���� �!*I��� ���*�44���� �*5'��

���� ���2���/���� �82/���������� ���� ���8������������ �=� ��������������������������

4���&������������������?��8���������������0���.����������.!�������0����������0.2��

���������������&��������4���&��������������8������9�������. ������=��4�����&��4�

��6�6����������4�������?����6��&���������������� ��������-����������������7���

��

8�����������������������������������4�����=���?��?��� ��=��4����������������0����

�������.5��������4����+����6�����������?�&��.4�����������������?��������4 ��&�

������ � ������� �9�2�����0.2��� ������������ �����4��=� ?���=� ��4����� ��������

��������=�9����.4�������2���>����������=���������=� �������������:���=������.!��

�����������������=������'�9���������� �����4���=�������=������������!*I��82/��

*5'��>�%������������?�����+��������=���������������6����=�����������������

8��������������=�����=��4����������A����������� �����4������������?�����������������

��� ��4� �=� ��� 8������ ��&����(� ��� �� �����6�� ��� =����� ����������� =��� �� ��6���

� ����������������������������������&�(�� �����6�������� �������6����4 ����=�

�����==����� � �����������==����� �������� �������!������������������!&�;�����&�

�������������� ������?����� ����������������&����(��&������4����������=��7������

=��4��� ����=��"���==������������� �����������+���������4���� ���������������������

>�%���7����'�9����7���9�2����7���!*I���7���.!���@:������0.2��7"���

.� ��� �������� ��=��4����� ��4�� =��4� ��� 8������ ������� ���� ��������� �����

CSystème d’Information Génétique”� �*5#�� ?����� ��� ����� =��� ��� ������� �������

�6�������� 0��� ��� ��4���� �=� ���4��� ��� ��� =��� ��� ��6��� ��� 0���� ��� 0��� ����

�6������ =��� ���� ������ ���� ��4���� �� ��� ���������� ��� ��6����� ��������������?���

����� �����8������ �������� ���� =���4���� ������'������ �� ���� ����E�'������+� �� ����

����E�����'������������������

7�

������ � � !��� ������� ���������������"� ���� ���� ������ ��� �������� ��������� #��� ������� ���� �� �$$�%&''&(� ��� ����

�� ����������������������������������

!����� �����

9����=�4�(�

���������

��?���������

0�����A���=�

��� ��������

=���

*�A���=����

��=�������

� ������

�=�4���������

���������� ��

����@J������

9����=��!9�

����� ��������

�� �������������

�����

9����=����6��

����� ��������

�� �������������

�����

#���������

����6��

>������ >�%� ���7:�"�@� ���������"� ������"���J����� �7��J�����J�:�7� "�"�J�����J����� 7���

'���$������ '�9� @�����"� "�"���"��� @7����@�J����� ��7�J���7�J�:�@� ���J���7�J����� ����

9��4����� 9�2� �@������ "�7������� "�������J�:�"� ��7�J���7�J����� @��J���"�J����� ����

.��������� .!�� ����"�� �:���"�� �:�����J�7�7� @:�J�7�"�J�:��� �"�J�7�"�J���:� ����

!��?��*?���� !*I� ������� �7��7""� �������J�7�:� �7�J�7�"�J����� ��J�7���J���:� ��7�

8������*�44���� *5'� �7�"�:� ����7�7� �:�":"�J�7�"� J� ���J�@���J����� 7���

8������2���/���� 82/� ����7� �@@�7�7� �������J�7��� J� :�J�7���J����� ��7�

0��������� 0.2� ���:@� �"��"�� ��7�@�J�7�7� 7"�J�@�:�J�:�7� �7�J�@���J�:�@� ��7�

��

5������������4 ��������+�����������������������6�������&��=��������������������&��

?�� �+������ ��� ��� �=� �� ��� ��&����(� ����&� ���� ���� ��!9�� ��� ��� ��&����(�

����������;�����&�������0�� ����=����������������6�������&����&����?����4 ���

=��4� ��� *5#� �������� �� � ������ �=� .��6��'���� �.'��?��� ��� =��?���� ���������

�������������������������8�����E����� �������=�������?����(��?�E�������������

�����������&���8�����������������4 ��&��������������7J����� �������*�4����������

��� ����=�����4��� � ��������������!9�����.'��0����6�������������������=����4���

��=������� � ���������!9�����.'��?����������������

�������������������������

!&� ������ ��� /, 5#� ��=?���� �� �JJ???��B��&������=�J����K���J�������������J0���

��6�� 4��J/������ !�������� ������� ?�� ���4���� ��� ������� 6�������&� �=� �����

��=������� � ��������������6�������6����4���

��

/�������� �� �� ���� ���������� ��4 ���� =��4� ��� ����&� �=� ��� ����������� �=� �����

�������?�������&A��� =����� =�4��� ��=������� � ������ �=� ���4��� �8��=��� ����� ��?�������

=��4� ���@� �� ����� ?��� ���� ������ (��?��� ���� =��� ?��4��� � ������� �.'� ����

�!9���0��� ����� ����=����4�������������������������������!������������������������

��6��?������?���&��������� �������6����(������������6�����������6���� ����������

�!��4��������*G(���������E� �������!������������������/���������� ���������������

�&�����3��6����������������4�����EqGi������4�����=�����������4���i���0���EqG�=���

����� � ������?�����4 ����������4�����=����EqGi��0�����������������6���������

=���� ��?�&��?�������4�����������6�����������&������==���������?���� �����������

������ ���������:����������������� ����������==� ������������==� �������6������4��6���

�� ���������==� �����(��?�����������������0����6��������������������6�� =��������

� �����������=������������6�������=����=���� ��?�&���%��&����:����

.� ����������4 �����=� ���?�����������&���� ��� ����� =�������� ������ ���4���?���

�==� �����������(��?�� �������������������������������������0����==���6����4�����=�

=�������� �fe�� ���� ��������� �fa�� ���� ��4���� �=� ��������� ����������� ��� 4��� =��� ��

��4������+ �����������������=�7�L��=�����������N50�������=������&�!�������������

�������?������������=�������������=������� � ��������8��=��.'������!9���0���feJfa�

�������������������� �����������4 ����=����������(�������6�����������=��4����

=������������� ������ � �������!����������������������������������feJfa����������

4���� �������� ��� ������(��� 0��� �==���6����4���� �=� ��������� ��������?��� ����

=�4�����=������� � ������?�������4 �����?��������������������=�4�����=�������

� ������������������ ���������::�������'���������������������"�������'������+���

����������������������"��'������������������� ���6�&��

��

0����6�������=�����������������=������==������������������ �����������������?�����

���������������������6������������������������ �������>�%��!*I��*5'�����82/��������

������� ��������&��'�9��.!���?�������������&���������� �������&��=�����������������

��������� �� �����&� ��� ������ �=� ������� �� ����� =�������� 0��� ������������ ?����

�������� =��� �� ��� =�4���� ?��� ?�� ������ (��?�� ����� ��?���� ��:�� ���� �����

��������������6��������&������&�����

��

0������==�������=� ������������=���������4�� ������=���?�����4 �����&����4������=�

'��?����������%�����������0��������=������������ ��������������∆F��?������4�����&�

������ ?��4�������8�����∆F�?��� ��4 ������� ��������� �=� ��� �������� =��4��� ������

������8�������M�'��(�&��������

t

tt

F

FFF

−−=∆ +

11

� � � � � � �N�O��

?�����Ft��������6���������==�������=������������������������t��0���6������=�Ft�����FtP��

?���� ��4 ���� �&� ��4 &�4�� &���� ��� �6������ ���������� ����6�� ���� ��� ������

�����=���������������4�����&�������������������6����4���5�����������P��?����������

��������������&�����=�����=�4�����=������� � ������������������

*�������∆F�?�����4 ����?������4������&�#��$���A��������������8�����������4���i��

=��4� ��� ��=������� ��?� � ������� ��� ����6����� ���� �=� ����������� =��4� ��� =��������

�∆Fi��?�����4 �������=��?���

( )1 11 − −−=∆ iEqGii FF � N�O��

?����� Fi� ��� ��� ���==������ �=� ����������� �=� i� ���� EqGi� ��� ��� ����6����� �3��6����

����������������������4 ����?���,3����0�������������=�������������∆F��?�����4 &�

��4 ���� ��� ��� �6������ �=� �� ����6����� ����� �=� ����������� �∆Fi�� �=� ���4��� ��� ���

��=������� � �������

��

0��� �==���6�� � ������ ��A�� �Ne�� ?��� ���� ��4 ���� =��� ����� ������ ?��� ��� ?��

���4�������=�∆F������������������������=��4����

FNe

∆=

2

1� N"O�

.������Ne�?�����4 ���������������� ��������� �����������&�=��?�������4������&�

���6���������� �������������������������������&�cij���?����?�� ����6������ i����� j��

�������������������������&�∆cij ?��������������=��?��

( )2 11EqGjEqGi

ijij

i

cc+

−−=∆ � N@O�

.�� � ��������A���?����������������4 ����6��������������&�����6���� � �������

���������������������&�?�����6��������6����������� ����������4&���4 ���?����������

=�4�����=������� � �������2���A����==���6�� � ��������A�����������������������Nec�

?���������4 �������=��?��

c2

1

∆=cNe � N7O�

0�����������&����==�������?�����������?��������������=������� � ��������8��=��.'�

�����!9��?������4 ����������4 ����� �� ����6���������==�������=� ����������� �8���=�

��� 8��=� � ������� 5�� ���������I����<�� 8��������� �FIS�� ?���� ���4���� =��� ��� 8��=�

� ������ �&� ������������ �+ ����� �����A&����� ��� �����������&�� ���� �����6���

�����A&�����������F����� ���6�&��%���&�����!��4������������8IS�6�����?��������=����

�������������

)1(

)1(1

coancestry

FFis

−−−= �� � � � � � N�O�

:�

)�������

�� ����� �����

0���������?�������4�����=��3��6���������������������?������������=��4�7�"��*5'��

��:�"��9�2���*����6�����������������������������������&���������������=������ ������

>�������*H����������������7��������������@���=������5�����*�44�����'��/��������

���� ������� .4���� ��� ����� ������� ������ ���&� ��� ������� ��������� �=� EqG� ���

��4 �������?������=�������&��&�'������������������?��������6���������82/�������

�P��:L���0�����==�����������,3#�=��������������6����������J����� ��������3�����"�������

����&����������������+ �������4�����=������������� ����������4�� ��������3���

�� ��7��� 0���� ������ ��� ��������&� ���� �� ��� ��4 ����� �=� ���������?��� ��=��4�����

=��4����������������8�������6�������������EqG� =�����=������4���������?�&���?���

������������=������=�4��������� � ��������0�������?�������+�� �����=�����!9�

4����=������>�%��������0������������4��&��+ �������&�����6����������������=����

��==����� � ��������?����� ��� �?��� =��� ���4��� � ��������0������������� ������

6������ =��4�7��� �>�%�� �� ��7� �0.2���0��&� ���� ���������� =��� ��� ?��8������ ��������

��������.!������0.2���

0����!9���������������������.'�����������>�%��'�9�����9�2���������0��������

5���� �����&����������=�������������&�������������?�������������������������

?�����4 ���=��4�������������������

����������������������

0���������?������������=���==�����������������6���=��4��������&��=���� �����������

�=��������������8�������� � ����������������&�����fe��fa ����N50����������������������

�4�� ���� ��� ����������� �=� ���4�B��� �������� ��� �����?���� ��4 ����� ?��� �����

���������������������?�����4���� ���������� �������������� ���������EqG���?����

@�������:������ �������!�����������������������=�������������EqG��3�����7�7�=������

%�4���������������'��/�������������������0��&������=������4��4�����������������

=��4��������������������&�������������*H����������������7���

0���� �� ���?�� ��� ���������� 6���� �=�N50� ��:�� =���82/�� ��� ��� =����� =��� ��� �������

��=������� � ������ �?����� ��� ���>�%� ��������?���� ��� 82/� ��� ��� ������� �4����

������ ��0��������0���4��� � �������� ���� in situ� ����ex situ�� ��6�� �?��������� ���

��4���=� ������������=���������������������=�4�����=������� � ��������>�?�6������

�������?���� ���6�������&�������� ���������� =��� ��� =�4�������4��� � ������� ���

4�����4������������������?�������=�4�������4��� � ���������A���

��

������& �*����������������������������� ������ ��������������� ��������������������������������������������+�� �

���,�����������������&''-.&''/"�*�,������������"�012,������+�������

!�����0��������=�

=��������

,==���6������

�=�=���������fe)

,==���6������

�=����������

�fa)

2����faJfe

�����������

�=����� �

��������

9����=�� ������������

�������������������=���

7�L��=�����������N50)

>�%�8��=� ������"� :�� ��� ��L� ���:� :�

>�%�.'� :�:� ��� �@� ��L� �"��� 7�

>�%��!9� ����7� ���� �7� �7L� �@�7� 7�

'�9�8��=� �"��:�@� �7� ��� ��L� �7��� ��

'�9�.'� 7�:� 7�� �@� �7L� ����� 7�

'�9��!9� 7"�� 7�� �7� ��L� �:�"� ��

9�2�8��=� �������� :�� �"� �:L� ���:� :�

9�2�.'� "�:� ��� ��� �"L� �7��� ��

9�2��!9� ��:� ��� ��� �:L� ����� ��

.!��8��=� ����:� @�� �7� "�L� �:��� 7�

.!��.'� ���� ��� :� @�L� ����� "�

.!���!9� ��7� ��� ��� ":L� �"�7� @�

!*I�8��=� ������ ��� �:� "7L� ����� ���

!*I�'� �"�� @"� ��� ��L� ����� "�

!*I��!9� ���� 77� �:� ""L� �"�:� ��

*5'�8��=� ����"� ���� "�� ""L� :�@� �@�

82/�8��=� 7����� ���� 7�� �@L� 7��� �:�

0.2�8��=� "��@�� @�� �7� "�L� �7��� 7�

0.2�.'� �@�� ��� ��� ":L� �:��� @�

0.2��!9� ���� ""� ��� "�L� ����� @�

���

0����� ������ ����&� ������� ��� �� ��4���� ���� ���4���� ��� ��4 �� ��� ��� �����

� ������ ��A�� �=� �� ������ ��� ��� ������� �� �+ ���� ��� ������ ��� �4���� �=� �������

6�������&��0�����4 ���������?�������4������� =�4��� � ������������&��������

��� ��� �4 ��� �=� .5� ��� ����� ������� ��� ��� ����� ��� ��� ��� ���� ���� ��� �������

6�������&��=����=�4��� � �������������4�����=�������=�����������6�������&��=���

4�����4���� � �������?����� �������������&����.5������ 5�����������=� ���!*I�

�������������������������� ���?�������fa��=����4�������=�4��� � �����������=���

����������������5���� �����&����������=������=��4������������������.5��������

�������������� ���8���������������=����������� ����=� ����!9���� ���.'���4 ����

?������������4������6����&�������=�4��� � ����������������������������+��4�&�

�����?��������=����4��� � �������=����.!�������������������������������������

����������=�����������6�������&��=����=�4��� � �������

*��������:��<� ���6������=� fa�����N50���6������������Q���4��4����������&��� =�����

������� ��6�� =��� ��� *5'� ���� ��� !*I� �8���� ���� !��� ���4����� �N7�� ���� fa�� ���� ���

�+��&� �=� ��� ��4�� ������ ���� ��4 �������� ������ ��� ����� �������������� .�� ���

�+�4 ���N50� ���4���� ������6�� �� ��� ��A�� �=� ��� ��=������� � ������ �!��������������

�������8��4������::��������������@������ ����������N50�?������������&�7"L�������

9�2���7L����'�9�������L����>�%��.��=������fa����?������������ ��+�4��&��&�@�L�

������.!������9�2��7�L�������>�%�������L�=������'�9��0���0.2��4�����������

�=� ��������&������?��������6�������&� ����L��0���������=� ���82/������==�����������

��� �������� (��?����� �=� ��� ������ ���� ������ ����������&� ��?���� ��� ��::������

�������������=��?�������������(��������4 ��������=���?� ���������=������������

������*5#����������2����������������4 �����?���������������� ���������&��

0��� .!��� !*I�� 82/� ���� *5'� ������ ��6�� �3��6���� �������� �� �� ���� �������

� ������ ��A�� �0���� ���� ����=���� ��� �������� ?�� �������� ������ ��� ����� ��������

��=��4����� ��� ��4 ������?�����������0���.!��� ����� �0����������8���� ��� ��� ���

�����������==��������?���������=��������6�������&��������������������?��������

Q������?�������4��������&����������������&�����0.2��������������&����������

�������� ���!*I��82/�����*5'����?� ���������� 6����� �=� ��� ��==����� ���������� �=�

������� 6�������&�� I���� ��(���� �� ��� ��=������ �=� 6������� ��������� ��� ������� �=�

���������6����4���8��������?����6����4���+ ����������������==��������=�������?����

�����@���������0���.!�����?����� ���=������������?��������������������=�2���>������

������������������������������&����������?������ �� �������=�2���>������������

��������� ���4�+�4�4� 6���� �=� ���L� ��� ������ ���� �� ������� ��������� �=� ���� 6����

������ ����L�����������.�� =��� ���'�9�����4�+�4�4� �� �������=�2���>������������

?����������� �������� �7�:L������ ��������������6��&���?&��6��� ���&������������1��(��

?��� �� ����� ��� ��� .!�� ������� ����� ��� ��� �� � ���=��� ���&� �� ��������� ��� 2���

>������������������'�9��������

���

�� ����� ��������������������������#��(������������������������� �

���������������� ����3'4������� ����#23'(������-����������������������

�������������������������������

���

�� ���� & � 0�� �� �� ���� ���� ��� �� ��� ���� *������"� ����5������� #&�("� ������ )��� 6���"� ������ ��������� #&�(�

7����������1�����������������#&�(�����������������������������������+��8�

&�� &�� &��

� � ��

�"�

0���*5'��82/� ������� ���� �� �� ������ �+��� ���!*I�������� �������� ��� ���(�� �=�

��������=������������������������������&������8��������.4��������+����������������

��=������� ��� 82/� ������� ��� '�����2�����R���� ������ �'2R�� ?��� ��� =���� ������

8������������&����?����������=�������=����'2R�?�����?����������=�������=����

2����������� �=��4�#��4��&��?���� � ��� ������������ ����� ��������6�&� �� ������&�

���2���>�������������=��4����1*���0���82/�� �������?��������4 �����������?���

�+����������������������=��4����1*�2���>�������@�L������2������"�L����������

'2R���7L����������.��=������*5'�����=������=������?������*?�����������?�����?���

��������6�&��� ������&����#��4����������5�����������=����!*I���?������������

����������� ��� ��� ��������,��� ����!��?��*?���� ������?���� ������ �� ��� �� �����

��4 ��&��&�1*���������������������>�?�6������������������ ����������=�,��� ����

��������������&����?����?�������9����.4����������������������A�����

��

.�� =��� ���>�%�� ��� ��������� �=�9����.4������� ������ ��� ���8������ � ������ ���

=��?���������&4 ���� ���6��?����� ��� ��� & ���� ��=����=���&� � ������?����� ���

4����������������L�=��4����������������

����� �������������������������� ������

8��� �� ������� ��� �==���6�� � ������ ��A�� �������� =��4� ��� ���� �=� �����������

���4���� �&� ��� #��$���A� 4����� ��� �?�&�� ������� ���� ��� ���� ���4���� �&� ���

��������� �������8����"���0��������� ���&�������?���������� ���������� �������������

?�������+�� �����=����82/�������?������4������==��������P�"L���=������*5'�

�P�7L��?���� �� ��� ��� ��� ������ �&� ��� 6���� �=� ��� �������� �� ������� ����=� ��� ���

������ ���&� ��� �+ ������ �&� ��� =��� ��� ���� ������ ��� ��� ���� ��� ������� ��� 4���

����������=��4�������������:���P�@�L���?������:������������������������?�������

����������������Nec����������&�������6�����4���������?�&���4�����������

�������������&����#��$���A�4������?�������+�� �����=����>�%��0�����4 �������

��?�������9�����������&�������6�����4��������������������4��������?�����

������&��

I��� ��� �������� � ������� 7� ������� ��6�� ��� �==���6�� � ������ ��A�� ������� 7�� ���

�?���� ?����� 4����� ��� ��&� ���� ��� ����������� �� ��� �� ���(� ���������� �� ��� 8.��

����44��������� �8.��� ���:��� 0��� ������ ��� ��� ��� ���(� ?���� ������������ ���Ne�

��������?������#��$���A����������6�����4������������������������������(���

��� ��4�� �+�� � =��� ��� �������?��� ���4���� ���������6����&� ����� ���82/��*5'�����

!*I��I��������������� ����������.!��������������?�������?���Ne��=��?����&�

���0.2���������'�9��>�%�����9�2���������8����"��� �==����������?����4����������

�����&������6���������������=�?����������������&�-���������������������������������

�� �������=���������4�����0�����������4���������������������=�+��� �������?���

�6�����������������������������=���� �������?�������#��$���A�� �������(�������

����������?���� ��������(��?������?����6�������������������������3�������4����

��� ��������(��?������=���������������4� ��?�&����

�@�

�� ���� 9 � :������ �� 2�� ����������� ����� ������ ������� ���� 98� :����� �������� ��� �� ��� ������ ������ ������� ������"� ���

���� �2��#;���5���<�������(�

��

�7�

0���� "� ���?�� ��� �6������ ���==������� �=� (����� � ��4 ���� ��?���� ��� ��==�����

� ��������0����������6����� =��� ���8��=� � ����������� =����� =��� ���9�2� �7��L���

'�9��7��L������0.2��@��L����������0���6������������=��������������������?������

��4 �������?������9�2�����'�9��������� �����&����������=�����?���EqG��0���82/�

����*5'����������6������?���8��=�(����� �6��������� ���6�&����L�������"L���.��=���

��� ���4����� �=� �������&� �=� ����� �������� ��� ������ =����� =��4� ��� =�4���

� �����������3�������������������=�����=������4��� � ��������.�������(����� �

��?����.'�����?�&����������������(����� ���?�����!9�4�����0���������?����

���� ��� �� ����6�� ��� ��� ��&����(� 4������� �� �����6�� ��4�� �=� ��� 4��� �������

6�������&��=��������&�������������&���4 ������������������������������==�����������

����� ������������������+��4������+�6��������� ����=�����4����A���=���������������

��4����������8���&��������?�����0����"�������85*�6��������������6���?�����?����

�4 &�����������������������������������==����������������I�������==�����

!���������

.����4��?���������&���������������������������6������?����������4��������������

?���� �� ������������������������6�������&��=����4����8������������������*�����

���=����������4����=������������<��������6�������&��'��������������������8������

9������ ��&����(� ���� ����� ��� � � ��� �� ?�&� �� ������� ��� ������� 6�������&� �=� ����

���������������0��������������������� �����&�����4 ��������������6�������&��=�

����+��������� ������� � ��������������� �=������4 ���������=��� �����&����(� �����

�������=��4������� �����6��������������6����&��=��������������

-��������������?���� ����������� ����������6�������&��=� �6����(�� ������ ����������

%���&����������E�������� �� �������!��������������E�������=� �����#��$���A������

���"���*�4���������� ���=���&�����?�������&������!��4�������������"E�F��������

��� ������ '�� /������ �� ��� ����E� *H������� �� ��� ���7��� >�?�6��� 4��� �=� ��4� ����

�����������������&�����=�������������R��!�����������������������?�����!��4������

��� ����"�� ?������ ����� ��� ������6�&� �=� ���� ���4���� �� ����4 ��� ����������

.����������������4�����&�������6�������=��������&��=���� �������&��=�������������

�������������������6�������&��=������������������������������4 �������?���4������

��������� �������&��=������&���4 ��������������������.������?�&����4�����������

������4 ��������������4 ����������������������������������������������6���������

����� ���� �=� ��������&�� 0��� ������ =����� �&� ��� #��$���A� ������������ ������ ����

���6����� ���������&� ������ 4������ ���� ���?���� ��4�� ������ �������� 0��� �4����

��==������������=�����=��� ������������������>�%��'�9��9�2������������ �����&����

�+ �������&��������������A�� 1������������4 �����=������4�4�����?��������=�����

� ������ ��A�� ��� �3�������4�� ����������� ���� ��������&� ���� �3���� 5�� ��� ����� �=�

�4���� � �������� ��� �����4�4����� ����������� ��� ��������� �=� 4����� ��?����

���������4������������=����������������������0����=�������&��==����=��4����=��4������

�6����4�������?�������������4�����6������4 ��������������������&������?����

��==������� ���� ��� ��4���� �=� �� ��������� ����������� ��?���� �6������ ��������&� ����

��������������������?���������������=������*5'�����82/�4��&��

���

������9 �*���� ��������� �������#�(����=�� ��>���%�����������#���(������������������������������8�*���� �����������

��+������#ΚΚΚΚ(����������������������������������������������#���(������������������������#012����*�(8�*�����

���ΚΚΚΚ������������ ������48�

!�����

8�

� � � Κ � � �

85*� 8��=S8��=� 8��=S��!9� 8��=S.'� �!9S�!9� .'S.'� .'S��!9�

>������ "�:� �����"� @��� @��� 7��� ��@� ���� 7�:�

'���$������ "�:� �����"� 7��� 7��� 7��� 7��� ��@� 7�:�

9��4����� @��� ������� 7��� 7�"� 7��� 7��� ��@� 7���

.��������� "��� ������� @��� ��@� ���� ��7� ��"� ����

!��?��*?���� ���� ������� "�7� @��� @�7� @��� 7��� ��"�

8������*�44���� ��@� ������� ��"� J� ��"� J� ��:� J�

8������2���/���� ���� �����:� ���� J� ���� J� ���� J�

0��������� "�@� ������� @��� 7��� 7�"� 7�"� 7��� ��@�

0���=����������4����=�����������6�������&��=�����������8�����������������&�����

�������?��������&���������������?��������=��������������'�������������������0����

���4�������������?���?����=�������&������������?�����.5���������������4����?�&�

�=��� ��������������?���������4�����=�.5������� ������������������&��������������

�6�����������=����������=������>�%���������������������=������ ���4����&��������

�4 �4�������� �=� ���������� �� 4���4�A�� ����������� ��� ����� �6������� �����4��

�'��?����������������������������@��?������6�� ����*�����������������?���������=�

������4���� ���� �=� ������� 6�������&� �=� ������������� �� �������&�����4��� ��� ���

������ � � �=� � ���=��� ������� �����4�� ������ ��� C-.2#,9D�VARiabilité GENétique� Q�

������� 6�������&� Q� �� 8������ �����4� ������ ��� ��� ������ �� ��� ���@�4������ ����

��?��� ��?�� ��� �������� .��?�� ��6�� B��� ������ ��� ���� �=� ���� ������ ����� ��� �6��&�

������� �� ����6�� ��� ��� ������� 6�������&� �=� ����4���� ����&� ���� ������� ���� ���

3���(&����������?�������+�� �����=��������������!*I��82/��*5'���

���� �+ ������� �=� ��� ���� �=� ������� 6�������&�4�������� ��� ���9�2��>�%��'�9��

.!������0.2����������������4 ��=����������� ����������=��4�����?�������� ��6���

��� &������ >�?�6��� �� ������ ��� ��� ��&� �+ ������� ������ ��� ����4�������� ��� ���

�������4���������������!*I��*5'��82/��������������������8�����4�����!��4������

��� ����"�� ���?��� ��� ?���� ��� �3��6���� ���������� �6�� �������� �� �6�� �=� 7�� ���

��������� ��� ��� �������� ��=��4����� ���� �� �4�� �4 ��� ��� ����������� �6�������� .�

4���� �(�&� �+ �������?���� ��� ��� ��� ������� ������(�� ������� ��� ��� ���������

?������4����6�������=��������������=�?�.5�����������!�5*%,-59�������'�9�������

?���������@�L��=���� �����&���������� ������"��������@���� 5.',02,�������9�2�

������?���������@7L��=���� �����&���������������������@��������7Q�%��'�A����������

���� ��� ��6���� ����� �==����� ������ ����� ���� ���� ��?� ��� ������=������ ��� ��� �����

������ =������ �=� 4��� .5� ���� ����� ���&�� .��� �� ?��� �+ ����� ��� ��� -.2#,9�

�����4�?������6��������4��==��������=���������������=�.5������������?�������

4����� ��������&���?�������������?�����4��������������==� �����?���������������

������ � ���������������&��

0��� ����� ������ 4�������� =��� ��� !*I�� 82/� ���� *5'� ������� ���� 4���=��������

0����������������������.5����� =��4�6�����������������������������������������������

�����4���������==����������&���6�������� ���=��������?���������������������&4����

=��� ��� >�%� ������ =��� �+�4 ��� .�� ��� �+�4 ��� =��� ��� !*I�� �� ?��� �+ ����� ���

=��?����?���?����� ������?������ ����8����������������4 ��&�������������

�&����9����.4�������>�������-��4������������������������?��������4����9����

.4�������!��?��*?��������� ������ ���?� ��� ��� ���&� ���� ��� ��� ��� ������.���� ��

����� ������� ?��� ������� 4�B��� ������� �=� ����������� �6��� ��� &������ ��� ?�� ��?�

��6����&� �8���� ���� ?����� =�6����� ����� ������� 6�������&�� 0��� �4 ����� =����� ��� ��

��������������������?�����=������������4��������=��������=��� ����������������.��

����+�4 ��������.!������������������������2���>������������?�������������������

������ �� ��������� ��� ��������� �6�� ���� ������� 6�������&� �=� ��� ������ �8���� ����

>�?�6��� ��� �������� �=� ��=������ ���� ?��� ��� ?�� ���� ��� �&� ��� =��4���� �=� ���

������� ?����� ���� �� =�?� &����� ���� �� ��� ��������� �=� �� .5� ����?��� 2���>������

�������!&������������������������(�?�����������������������������&������������?�

�������6�������&���������������?�������������������������������

�����������?��� ����� ������� ��� �=��� �==����� ���?�&� �� ��6�� ����������� �==���� ��� ��

=����� � ������ �!G���� �� ��� ������� >�?�6��� �� ?�� �4 &� �� 6��&� ��==����

������A������ ?��� �� ������� ��� ��6���� ������� ���� =������� ?�&�� �� (�� � ��������

������� =��(���.���?�� B������?��� �����8�����������������&����������6��3������

�?� ������� 6�������&�� ���� ����� ������ ���� �����&� �������� ��� ����� ����&� ����

�������� 0��� �������� � ������ ?���� ��� ������� 3���� �� ��&� ��=� ��� � ���=���

4�����4������� ������� �����=����������6����&������� ��������������� ���4����

�����4 �4������������4����������������=�����&��������������6����������>������

������ �� ��������� ����� ����&� ��=��4������ ��� ?�� ���?��� ��� ��� 82/� ��� .!�� �������

.������ ?�&� ��� ��� �&� ������ ��� ����� ����&� �=� �+������ ���� �� �����6�� �������

6�������&�� ?����� ����� =��4� =��?���� 3���� ��4 �� ��4���� ���� ����� �� ��� ?�&� ��

3������ ���������� �4�A�����4���������������������@���

8���&��?�����?�����������4 ����4����������=������8������9��������&����(����

3���� �==��������� ��� ��� =��� �� ��� �� =���&���?� ���� �������� �����������6���� �?���

(����� �?���=�4����������.'�S�=�4���(����� ��0����"���>�?�6���(����� ����3����

��������������(����� ��=����=�4��� � �������?������������������&���������������

��������������4����������� ��������������?��=��4����.5��������4��������+���

��������&��������� �������!������������������

I����6�����?�������� �����������=��������6�������&��=����������4��������&�����

������� ��6�� ���������� �������&� ������ ��� =���� ���&� ������� ��� ?��� ����� ��� ���

���B���� ?��� ��� �+�� ���� �=� "� ������� ��� ��6�� �����&� �����A��� ����� �����������

#�6��� ��� ����&� �=� ����� ������� ����� ��� �6��&� ������� �� ����6�� ��� ��� 4����

������(�� ��� ?���� ������� ��� ��� �������� ��� ��6�� �� �����6�� �4 ��� ��� ���

� ������ �=� ��?�� ���?��� �����&� ����� ����@J���������� ��� ����� ������ �� � �����

�(�&�����&�6��&����������������=������.5���������!��?��*?��������8������2���/����

�������8������*�44��������������6����?�����?����� ��������I���������� �����&�

���6�������������==�����=����-.2#,9�4�����4��� ���������&������������������

����==� ������=����=����.5�������������&����� �����4�?����������=������ � ������

���������&��

I�������������������������4���� ����������6������=� ��� �����&����������?����

(��?��6��&� ������&���������������&������������=�������������8�������������������

�=�������?��������=�����=�?���������C����D��=���� �����&������� �����4���I������

����6���=�����4������������ =��4������6����?�������� ����?����� �����=������?�����

�������6��������������������������=�����������������4����5����4��������=��4��������

��&������C ��(D��=�������=���?������������6��������������6������������4�����6������

��=��4�����?���������������=�����4����� � ����������==��������4��������������=�

��?�������(����

*�+����� �����

0����������?���������(������==������������������=������==�����������������������

=��������������������������&�����4�����4����=��������������I��������������=����

����������������������&4������=������=����� =����44����������4������� ��

)��������

!��4�����2���*G(�����>���������.��&�����=� ����������=�0�+�T����������������!����

������������/��A�������� � ���������.�������J.�Anim. Breed. Genet.,��������7�

�:���

!��4����� 2��� *G(����� ;�� ����"�� /�������� ���� 4��(��� ��=��4����� ��3����4���� ��

4�������������6�������&��Genet. Sel. Evol.�"7��"��Q:"��

!G����� *��� >������ !�;��� I������ �������=�� '��� >������� %�!��� *?�6��� >�>�� �������

!��?��*?����U�>�������������������4 �����?��� ����>�������=�����6����������

���&�?������ ���(=�� ���(������ =����&�� �������&�4������4�����J. Dairy Sci��� �@��

��7:����:��

!��������� ���������/, 5#����=������ ��(����=��� �����������&����������=��������

� ��������5���/������������=�������I��������������=�#�������. ������

%�6����(�/����������'�� ������8����������Q�"�.������������ �2�4����44�����

�:Q�"��'�� ������8�������

!�������� ���'������%���-�������,���������-�����=������� ������������=���������������

4��������������6�������&������ � �������Genet. Sel. Evol.�����7��"��

���6������ 5���#�&������8���'������.���-�����'���#��$���A�� ;�/�� �������,��4����� �=�

�==���6�� � ��������A��=��4���������=���������&���� ��������� � �������;. Anim.

Breed. Genet.���:��7�Q�"��

�������;�;���'������+��*���!�������'���!$�����;������@��.�4�����=�������&��4���

4�����4����=��������6�������&��������&������Genet. Sel. Evol.�"���"�"�"�@��

�������!������ ���� -�������� ,��� '������+�� *��� 0�+����!��������� '�� ������� *�4 ����

�������������6��?��=����8������9��������&����(�����������5���/������������=�

���:��I��������������=�#�������. ������%�6����(�/����������!���>���A����

'#�� �!��A���� �"��:� .����� ������ � �2�4�� ��44�� ��� ""�"� !��� >���A���� '#��

�!��A����

�������!������ ���� /���V���� 5��� 8���W����� ��� !��$�� !��� %���&�� #��� -�������� ,�� �������

/�����������&���� �=� ��6��� �4��8������ ���� � � ����������� �4 �������� =��� ���

4�����4����=��������������J. Anim. Sci.,�::��7�7�7����

�������!������ ���� >��4����� *�;��� !��(������ >�� ������� ,+� ���� ������6����� �=�

>������8�������� ���� �� ��4 ������ ��� ����� 8������ ���� 1*.� ���4 ��4�

����������J. Dairy Sci����@��@���Q@��:��

8������� �*���'��(�&�0�8�����������Introduction to Quantitative Genetics��,��@��

%���4��<��#������>���?�,���+��1F��

8.�� ����:�� Secondary Guidelines for Development of National Farm Animal Genetic

Resources Management Plans��8.���2�4���5�&�� ���"��

8�������A��;���-������6���!���/����I�����2���0�����'�.������7��,==������&��=���������=�

������������4���������=��4��������������6����� �����4���Genet.��������"�"��"����

#��$���A�� ;�/��� .�������� ;��� X�A� ����Y��������� 2��� ��Z[��� ;��� /�����=���� ;�� ����"��

/�����������&�����=������* ���������=�������������Genet. Sel. Evol.,�"7��@"��"��

#��$���A�� ;�/������6������ 5���#�&������8�� ������� 54 ��6���� ��� ���4����� �=� ����A���

�==���6�� � ��������A������=��4����4����J. Anim. Breed. Genet. �����"���""���

F�4�� ,�*��� F��( ����(�� !�� I�� ������� %��(���� ����3�������4� ��� ��� 9���� .4�������

>������ � �������Anim. Genet���@������Q�::���

F������� *��� *�4������� >�� ������� . �������� �� ��� 4�����4��� �=� ����������� ����

��������� �������#��4���>����������&����� � �������Livest. Sci.����"��@�Q7"��

%��&��2���� ���:���.��&���� �=� =������� �� ���������� ��� ���������� =������� �3��6�����

����=�����������4���3��6������Zoo Biol.,�:��������"��

%�� '�A���� /�� ������� Utilisation des ressources paternelles et maternelles dans les

programmes de sélection des races montbéliarde, normande et prim’holstein. Période

1996�2008��5��������<,�6�����/������8�������

%���&��#��� ����!��4�����2�� �������'����� �������� ���� ��� �����4������� �=� �������

���������� �����4��������4�����������������+�4 ���=���������������Anim. Genet���

@�������@�

'�������%���!��������� ���-��������,�� �������#������6�������&��=�8����������&��������

���4����=��4� ����������=��4������Interbull Bull.���@��@��7@��

'������ *��� !������ .��� �������!������ ���� !��������� '��� %�� '$A���� /��� '��$�&�� *���

;������� #��� -��� ���4���� !��� -�������� ,�� ������� %�� 6�������$� �$�$�3��� ����

����� ������������6��������V����=���W�������3�����$6��������3�������4 ���������

�������������\�Renc. Rech. Rum.,��"���"���@���

'�� /������� *��� F�����&�� ;�8��� 2���� '��� !���&�� �/�� ������� 5���������� ������ ����

�����������&�����=�5���������&��������=����� � ��������J. Anim. Sci���:7��"���""���

'��?�������0�>�,���������'�+�4�A���������� ���������������?����� ����=����������=�

������������J. Anim. Sci����7���"@��@���

'��?�������0�>�,���%����T�����������4 �������������������==�������������� � ��������

Genet. Sel. Evol���@��"�7�"�"��

'������+�*���!�������� ���-�������,��� �������1����������� <��=��4����� �$�$����3���

���� <���4����� ��� �� 6�������$� �$�$�3��� ��� ���� ������ ��6����� =���W������

�<�+�������������������$��������Renc. Rech. Rum.,�����@���7���

/��� ������ ;��� 8���������� 8�� ;�(������� ;�>�� ������� '��������� ����������&� �=�

���������������&���������InterBull.�Bull., @����:��������

*H�������� .����� *H�������� '�F��� !����� /�� ����7�� 5���������� ��� ������ ���&� ����

!�������J. Dairy Sci���::���:�7��:����

-��� ���4����!���'�������8���F���4�(����#���!�����/�������7��#��������6����=��������=�

���>������������������������������������&��Interbull Bull.,�""���"�����

-�������� ,��� 0�+����!��������� '��� !���������� 2��� 9�6���� '�� ����7�� ������6����� ����

6����� �=� ���� �6����(� �������� ���=������ �=� ������ ������� ���J��� ��� ����� ��

� ���=�����6����4�����Anim. Genet. Resources Info.��"������"���

-�������� ,��� %���&�� #��� !������ ���� '$����+�� ;����� 2������� ]��� >�� ���� 8�� �������

��4 ������ 4������ =��� ���4����� ��� �==���6�� � ������ ��A�� =��4� �������� ���

4������������ �� ��������&���� ?��8���������������������������Genet. Sel. Evol.�

����4������

-��4��� .�2��� #������ .�8�� ������� #������ ����������� ��?���� ����6�&� ����

���=��4���������� ������� ������������&����� � �������J. Dairy Sci.��:���"����

"��@��


Recommended