Forskningsprofil Mikrobiologi & Mikrobiel Økologi mikroorganismers rolle i naturen (inkl. bioteknologi og samspil med planter & dyr)
vi kender kun <1% af alle mikrober på jorden vi finder stadigvæk nye processer i jordens stofkredsløb
OPDAGELSE → FORSTÅELSE → ANVENDELSE
• Akvatisk Mikrobiel Økologi & Biogeokemi Marin sediment & den dybe biosfære N kredsløb, N2O produktion Iltsvindszoner
• Ekstreme miljøer – ”limits of life” skyer gletsjer life on Mars (exoplaneter)
• Symbioser mellem bakterier og invertebrater regnorme marine invertebrater (søpunge mm.)
• Anvendt Mikrobiologi biogas produktion spildevandsrensning biofilter biofilm off shore olieproduktion
bio-energetik (øko) fysiologi
(genom) evolution fylogeni
http://bios.medarbejdere.au.dk/fileadmin/bioscience/ Documents/2013/2013-03-07_Mikrobiologi_info_kandidatuddannelse.pdf
(Meta)Genomik
substratum
100
200
200
100
0
300
100 200 µM
µm
O2
NO3-
water
biofilm
mikrogradienter mikrobielle processer
Mikrobiel samfund fylogenetiske & funktionelle gener
in situ identifikation/imaging, biodiversitet
Biogeokemi
Aktivitet Mikromiljø
mikrokosmos-inkubationer radioisotoper
stabile isotoper
02468
101214161820
15NH
4
++
14NO
3
-nm
ol cm
-3
0
2
4
6
8
10
RF1
15NH
4
+ 29
N2
30
N2
0 1 2 3 4 5 6
0
20
40
60
80
100
12014
NH4
++
15NO
3
-
Time (hours)
Interaktioner konkurrence
symbiose biofilm
Geokemi
Anvendt mikrobiologi enzymer, biogas,
biofilter, olie, fødevareproduktion
dental biofilm
Dyrkning (øko)fysiologi
nye arter evolution
Arbejdsområder Mikrobiologi & Mikrobiel Økologi
nedbrydning af organisk stof
Arbejdsområder til dagligt på Mikrobiologi:
Arbejdsområder til dagligt på Mikrobiologi:
Data behandling, statistik, modellering, bioinformatik…
Hvilke fag anbefaler vi for at skrive speciale i mikrobiologi -1
Mikrobiologiske Fag Bachelor (mindst en af de 2 kurser som basis): • Mikrobiel Stofomsætning (Q2, 5 ECTS) • Mikrobiel Fysiologi og Identifikation (Q3+4, 10 ECTS) Kandidat: • Geomikrobiologi (Q1, 10 ECTS, NYT KURSUS) • Molekylær Mikrobiel Økologi (Q2, 5 ECTS) • Mikrobiel Fermentering & Bioteknologi (Q3, 5 ECTS) • Anvendt Mikrobiologi (Q4, 5 ECTS, NYT KURSUS)
Biologisk Projektarbejde (som bachelorprojekt eller under kandidatuddannelsen)
Andre Biologiske Fag (kandidat): • Biologisk-Fysisk Oceanografi (Q1, 5 ECTS) • Vandløbsøkologi (Q1+Q2, 10 ECTS) • Søers Økologi (Q3, 5 ECTS) • Modellering af Biologiske Processer (Q3, 5 ECTS)
Tilvalg: Generel egnet: Molekylærbiologi, Kemi, Datalogi (Bioinformatik), Jordbrugsvidenskab, evt. Geologi Specifikke kurser: • Genomer og Proteinstrukturer (Q2, 5 ECTS - BiRC) • Analyse af Genomdata (Q3, 5 ECTS - BiRC) • Medicinsk Mikrobiologi & Immunologi (Q3, 10 ECTS – Molekylærbiologi) • Eksperimentel belysning af samspillet mellem mikrober og deres værtsorganismer
(Q3, 5 ECTS – Molekylærbiologi) • Biofilm (Q4, 5 ECTS, NYT KURSUS fra 2014 – Nanoteknologi & Bioscience) • Det hydrogeokemiske kredsløb (Q1+Q2, 10 ECTS - Geoscience) • Næringsstofomsætning og miljøstyring (Q1+Q2, 10 ECTS, - Institut for Fødevarer) Særlige tilvalg: • M18 Biomasse til biobrændstoffer og energi (Q1+Q2, 10 ECTS – Ingeniørvidenskab)
Hvilke fag anbefaler vi for at skrive speciale i mikrobiologi -2
Karrieremuligheder for mikrobiologer Generel: • Biologisk rådgivning og R&D indenfor miljø, industri, og landbrug • Miljø- og bioteknologi • Miljø- og naturforvaltning • Hospitaler og medico-industri • Undervisning Census de sidste 10 år (ca. 40 kandidater): • 50% gik videre til PhD: => 2/3 private virksomheder, 1/3 academia
• konsulent- og rådgivningsvirksomheder (miljø, landbrug etc.): 7 • virksomhed, udvikling & produktion (Novo, Danisco, Arla etc. ): 3 • virksomhed, mikrobiel & molekylær analyseservice: 3 • gymnasielærer: 3 • lærer på laborantskolen: 2 • biolog ved kommunen: 1 • hospital, klinisk mikrobiel diagnostik: 1 • akademisk sekretær for PhD uddannelse: 1
Nuværende Projekter (et udsnit)
åbent lab i morgen 14:00 – 17:00: 1540 - 116
Brint omsætning i biogasanlæg
Kabelbakterier og elektriske
samfund