helix-turn-helix motif (Homeodomain protein)
α-helix が major groove にはまりこみ、２量体としてDNAに結合する
α-helix (recognition helix)
赤色のα-helixがDNAの溝にはまりこむ
Essential 細胞生物学２ p272 及び 図8-5
tryptophan repressor
lambda Cro
lamda repressor
catabolite activator protein (CAP)
major groove
minor groove
C2H2 type ----Cys---Cys-----His---His------
Zinc finger proteinCys と His が一定の間隔で並んでいる。
Zn2+ をキレートしている。
C4 type ----Cys---Cys-----Cys---Cys------
Zn finger モチーフが複数連続してならび、DNAのみぞにはまるように結合
H
H
C
C
ひとつのタンパク質にZnを結合する部分が数個所有り、それぞれがDNAに結合
leucine zipper 部分で２量体を形成
leucine zipper protein
α-helixLeu
Leu
Leu
Leu
Leu
Leu
Leu
Leu
α-helix
CH3 CH3
CH2
CH
CHNH
CO
Leu
Leu残基どおしが疎水結合を形成7 アミノ酸残基ごとにLeuが存在
Helix-Loop-Helix (HLH) motif
HLH タンパク質が２量体を形成しDNAを挟むようにして結合
DNA
cis-element(enhancer)
DNA 結合ドメイン
TATA-box
general transcription factors
TFIID
RNA polymerase II
mRNA 合成
活性化ドメイン
活性化
DNA 結合ドメインは、構造上の特徴から、クラスに分類されている。Homeo-domain proteins (Helix-turn-helix)Zinc-finger proteinsWinged-helix (forkhead) proteinsLeucine-Zipper proteinsHelix-Loop-Helix
transcription factor
活性化ドメイン 特別な特徴的な構造を持たない酸性アミノ酸が多い場合 （Glu, Asp）グルタミン（Gln）が多い場合Pro が多い場合Ser, Thr (-OH 基)が多い場合
RNApol II のTATA-boxへの結合を促進し、転写開始速度を速める。mRNAの合成量が増える。
Chromosome
nucleosome
Essential 細胞生物学 p186
染色体
nucleosomeを形成するビーズ状の蛋白質
＝ Hisotne
Histones nucleosome
H2A H2B H3 H4
Histone H1
Core Histones
Core histones のＮ末端がとびだしている Histone tails
core histones のまわりに DNA が巻き付いている
各２ヶずつが結合してひとつの core histone 複合体を形成
nucleosome
H3, H4 のN末tails の Lys 残基（+ 荷電）が脱アセチル化すると、DNA（- 荷電）に結合し、chromatinが凝集する。heterochromatin
Essential 細胞生物学 p185
Bone marrow の stem cell の電子顕微鏡写真
nucleolus 仁（核小体）rRNA が合成されている部分
nucleus 核
mitochondria
濃く見える部分 heterochromatin染色体（DNA）が強く凝集している部分遺伝子発現（RNA合成）は起きていない
うすく見える部分euchromatin染色体（DNA）があまり凝集していない部分遺伝子発現が起きている
essential細胞生物学p183 図5-19
