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Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

Date post: 30-Dec-2015
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Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9) Editorial Rueda, Madrid. James Watson (L) and Francis Crick (R), and the model they built of the structure of DNA in 1953. ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO. ..\..\PcMolecule Lite (Demo)\Mols\DNA.mcm. - PowerPoint PPT Presentation
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M O N O N U C LE Ó TID O S Base Pentosa F osfato P irim ídica P úrica Timina (U racilo) C itosina Adenina G uanina G A C U T D esoxirribosa R ibosa Elementos y Moléculas de la Vida ada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9) torial Rueda, Madrid
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Page 1: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

MO

NO

NU

CL

TID

OS

Base

Pentosa

F osfato

P irim íd ica

Pú rica

Tim ina(U rac ilo )

C itos ina

Adenina

G uaninaG

A

C

UT

D esoxirribosa

R ibosa

Los Elementos y Moléculas de la VidaLosada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)Editorial Rueda, Madrid

Page 2: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

James Watson (L) and Francis Crick (R), and the model they built of the structure of DNA in 1953

Page 3: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO

..\..\PcMolecule Lite (Demo)\Mols\DNA.mcm

..\..\PcMolecule Lite (Demo)\Mols\DNA.mcm

..\..\..\Mis documentos\webdpto\biomoleculas\biomodel\model1\INICIO.HTM

Los Elementos y Moléculas de la VidaLosada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)Editorial Rueda, Madrid

Page 4: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

BIO SÍN TESIS D E ÁC ID O S NU CLEIC O S Y PRO TEÍN AS

D NA D NA

m R NA

Prote ína

t

R ep licación

Transcripción

Traducción 30 R N A

20 am inoácidos

ribosom as

4 nucleótidos4 nucleótidos

Los Elementos y Moléculas de la VidaLosada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)Editorial Rueda, Madrid

Page 5: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

International Human Genome Sequencing ConsortiumNature 409, 860 - 921 (2001)

Page 6: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

International Human Genome Sequencing ConsortiumNature 409, 860 - 921 (2001)

The automated production line for sample preparation at the Whitehead Institute, Center for Genome Research

Page 7: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

International Human Genome Sequencing ConsortiumNature 409, 860 - 921 (2001)

Conserved segments in the human and mouse genome

Human chromosomes, with segments containing at least two genes whose order is conserved in the mouse genome as colour blocks. Each colour corresponds to a particular mouse chromosome.

Page 8: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

Distribution of the molecular functions of 26,383 human genes

The sequence of Human GenomeVenter et al. (2001) Science 291, 1304-1351

Page 9: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

International Human Genome Sequencing ConsortiumNature 409, 860 - 921 (2001)

Conservation of architectures between animal species

Page 10: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

The Helicobacter pylori chromosome

Each color represents a different functional group of genes

Tomb et al. (1997) Nature 388, 539

Page 11: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

Mycobacterium tuberculosis

Page 12: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

The first tree genome (Populus) will be sequenced by 2003

News in Nature (2002) 415, 724 - 725

Page 13: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

8.2 Example mutants in Drosophila

Figure 8-8

Mutations may cause only subtle changes or may produce significant changes in development, cellular function, appearance and/or behavior

Page 14: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

Genes y Proteínas

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InteraccionesÁc. nucleicos - Proteínas

Fuertes (t = s, min) Nucleosoma (DNA)

Ribosoma (RNA)

Débiles (t = s, ms)Polimerasas

..\..\..\Mis documentos\webdpto\biomoleculas\biomodel\model1\INICIO.HTM

Page 16: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

9.5 Nucleosomes are complexes of histones

Figure 9-30

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9.5 The solenoid model of condensed chromatin

Figure 9-31

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9.6 A model for chromatin packing in metaphase chromosomes

Figure 9-35

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9.6 Chromosome number, size and shape at metaphase are species

specific

Figure 9-33

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10.5 Transcriptional activators are modular proteins composed of distinct functional

domains

Figure 10-39

Page 21: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

DNA-binding domains can be classified into numerous structural types

Homeodomain proteins

Zinc-finger proteins

Winged-helix (forkhead) proteins

Leucine-zipper proteins

Helix-loop-helix proteins

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Interaction between a zinc-finger protein and DNA

Page 23: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

Interaction of a homodimeric leucine-zipper protein and DNA

Page 24: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

Interaction of a helix-loop-helix in a homodimeric protein and DNA

Page 25: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

A new family of plant transcription factorsdisplays a novel ssDNA-binding surface

Desveaux et al. (2002) Nature Struct Biol 9, 512

Whirligig tetrameric structure of p24 The p24 protomer

Page 26: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

A new family of plant transcription factorsdisplays a novel ssDNA-binding surface

Desveaux et al. (2002) Nature Struct Biol 9, 512

Putative ssDNA-binding residues of a p24 protomer, corresponding to the subunit shown in the lower left hand corner of the left picture

Binding of p24 to melted dsDNA

Page 27: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

D.J. Patel (2002) Nature 417, 807

Basics of the quadruplex topology of human telomeric repeat sequences

Telomeres are protein–DNA structures protecting the ends of chromosomes

Page 28: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

G.N. Parkinson et al. (2002) Nature 417, 876

Structure of the quadruplex formed by the four-repeat TTAGGG human telomere DNA sequence.

The central potassium counter ion is coordinated in a bipyramidyl antiprismatic arrangement by the electronegative carbonyl groups of guanine O6

Page 29: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

D.J. Patel (2002) Nature 417, 807

a) The K+-stabilized crystal structure b) The Na+-stabilized solution structure

The folding and appearance of the telomeric DNA sequence is fundamentally different in K+- and Na+-containing quadruplex structures

Page 30: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

Clinical implications.

The enzyme telomerase is highly expressed only in tumour cells, enabling them to carry on replicating their chromosomes almost indefinitely. (In non-tumour cells, by contrast, telomerase is not expressed and telomeres gradually erode to the point at which cells cannot duplicate their DNA safely, and so no longer divide.) So telomerase is a promising drug target. It binds to single-stranded telomere ends, and could potentially be inhibited by drugs that compete for these ends (in their quadruplex form).

D.J. Patel (2002) Nature 417, 807

Page 31: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)
Page 32: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

N

N

H N

H N

N H

N H

H N

OO

N

N

N

N

N N

N N

2

2

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O H

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P O H C2

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- P O H C2

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OO-

-

P O H C2

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O

OO-

- P O H C2

O

O

OO-

-

U r i d í n - 5 ' - f o s f a t o

A d e n o s í n - 5 ' - f o s f a t o

C i t i d í n - 5 ' - f o s f a t o

G u a n o s í n - 5 ' - f o s f a t o

( r id i l a t o )U

( d e n i l a t o )A

( i t i d i l a t o )C

( u a n i la t o )G

( M P )U

( M P )A

( M P )C

( M P )G

U r i d i n a

A d e n o s in a

C i t i d i n a

G u a n o s in a

R IBO N U C LEÓ S ID O S Y R IBO N U C LEÓ TID O S

Page 33: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

O

O

O

O

O

O

O

O

H

H

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1 '

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P

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C H5 ' 2

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A

A

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A

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C

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fosfato - 5' - p

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- 3' - fo

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sa - 3' - fosfato - 5

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tosa

- 3'

fosf

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0,3

4 n

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- C

- C

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-

E STR U C T U R A Q U ÍM IC A D E L D N A

Page 34: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

T U ( ) = = = A

C = = = G= = =

A P A R E A M I E N T O D E B A S E S

N N

N

N

NN

N

C H 3

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O

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T i m i n a d e n i n aA= = =

O

N N

N

H

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N

C i t o s i n a = = = G u a n i n a

H

H

H

= = =

Page 35: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

N

N

H N

H NH N

N H

N H

C H

N H

O OO

N

NH

N

NH

NH

NH

NH

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i m in a ( ) T T r a c i l o ( )U U

d e n i n a ( )A A u a n i n a ( )G G

i t o s i n a ( )C C

2

2

3

2

O

OO

B A S E S P I R I M Í D I C A S

B A S E S P Ú R I C A S

Page 36: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

A

G

G

G

G

A

A

T

C

C

C

C

T

T

ESTRUCTURA DEL DNA

T

T A

A

Page 37: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

2 n m

R E P L I C A C I Ó N D E L D N A

Page 38: Los Elementos y Moléculas de la Vida Losada, Vargas, Florencio y De la Rosa (1998-9)

Tam año de los genom as de d istin tos organ ism os

O rganism o

Virus ~ ~

~

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~

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10 10

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1

m m

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1000

10000

100000

1000000

100 100 ma a

Bacterias

Eucariotas

Levadura

D rosophila

H om bre

Pares de bases(en kb)

Long itud


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