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Mokrab & Sansom, Fig. B S1 S2 S3 S4 Link er Paddle loop **** A
Mokrab & Sansom, Fig. 1
B
S1
S2 S3
S4 LinkerPaddle loop
* * * *
A
Mokrab & Sansom, Fig. 2
0 ns 30 ns 60 ns
Mokrab & Sansom, Fig. 3
NachBac
MlotiK1
Chimera
KcsA
Hv1
KvAP VS
Ci-VSP
x (Å)
y (Å
)
dPP (Å)
Mokrab & Sansom, Fig. 4
B
Tetramers in DOPC Tetramers in DOTAPDOPC DOTAP
Ad Z
(Å
), u
pper
d Z (
Å),
low
erT
hick
ness
(Å
)
Mokrab & Sansom, Fig. 5
A
Chimera Kv1.2 Mlotik1NachBac KcsAHv1Ci-VSPKvAP VS
B C
0
50
100
150
200
250
300
350
Chimera Kv1.2 KvAP NachBac Mlotik1 Ci-vsp Hv1
Ave
rag
e n
um
ber
of c
on
tact
s
DOPC heads DOPC tails
0
50
100
150
200
250
300
350
Chimera Kv1.2 NachBac Mlotik1
Ave
rag
e n
um
be
r o
f co
nta
cts
DOPC heads nativeDOPC heads isolated
DOPC tails native
DOPC tails isolated
Mokrab & Sansom, Fig. 6
A BDOPC headsDOTAP heads
DOPC tailsDOTAP ta ils
0
50
100
150
200
250
300
350
Chimera Kv1.2 KvAP NachBac Mlotik1 Ci-vsp Hv1
Ave
rag
e n
um
ber
of c
on
tact
s
DOPC heads DOTAP heads DOPC PO4
0
10
20
30
40
50
60
70
Chimera Kv1.2 KvAP NachBac Mlotik1 Ci-vsp Hv1
Ave
rag
e n
um
ber
of c
on
tact
s
Mokrab & Sansom, Fig. 7
S1 S2 S3 S4 S5 S60
2
4
6
8
10
12
140
2
4
6
8
10
12
14
18 23 28 33 38 43 48 53 58 63 68 73 78 83 88 93 98
103
108
113
118
123
128
133
138
143
148
153
158
163
168
173
178
183
188
193
198
203
208
213
218
223
228
233
Ave
rage
nu
mbe
r of c
onta
cts
S1 S2 S3 S4 S5 S60
2
4
6
8
10
12
140
2
4
6
8
10
12
14
9 14 19 24 29 34 39 44 49 54 59 64 69 74 79 84 89 94 99
104
109
114
119
124
129
134
139
144
149
154
159
164
169
174
179
184
189
194
199
204
209
214
219
224
Ave
rage
nu
mbe
r of c
onta
cts
S1 S2 S3 S40
2
4
6
8
10
12
140
2
4
6
8
10
12
14
111
116
121
126
131
136
141
146
151
156
161
166
171
176
181
186
191
196
201
206
211
216
221
226
231
236
241
246
Ave
rage
nu
mbe
r of c
onta
cts
DOPC heads DOPC tails
0
2
4
6
8
10
120
2
4
6
8
10
12
14
16
2
16
7
17
2
17
7
18
2
18
7
19
2
19
7
20
2
20
7
21
2
21
7
22
2
22
7
23
2
23
7
24
2
24
7
25
2
25
7
26
2
26
7
27
2
27
7
28
2
28
7
29
2
29
7
30
2
30
7
31
2
31
7
32
2
32
7
33
2
33
7
34
2
34
7
35
2
35
7
36
2
36
7
37
2
37
7
38
2
38
7
39
2
39
7
40
2
40
7
41
2
41
7
Ave
rag
e n
um
be
r of c
on
tact
s
S1 S2 S3 S4 S5 S6
0
2
4
6
8
10
12
140
2
4
6
8
10
12
14
162
167
172
177
182
187
192
197
202
207
212
217
222
227
232
237
242
247
252
257
262
267
272
277
282
287
292
297
302
307
312
317
322
327
332
337
342
347
352
357
362
367
372
377
382
387
392
397
402
407
412
417
Ave
rage
nu
mb
er o
f co
nta
cts
S1 S2 S3 S4 S5 S6
0123456789100
2
4
6
8
10
12
14
94
99
104
109 11
411
91
241
291
341
391
441
491
541
591
641
691
741
791
841
891
941
992
042
092
142
192
242
292
34
Ave
rage
nu
mb
er o
f co
nta
cts
S1 S2 S3 S4
NachBac
MlotiK1
Chimera
Hv1
KvAP VS
Ci-VSP
DOPC heads DOPC tails
