Qualitative Compound Report
MS Spectrum
IRM Calibration Status Success DA Method BioConfirmIntactProteinHighMass-Default.m
Data File Intact_MyoglobinNewMyo-010012.d Sample Name NewMyo-01Sample Type Sample Position P1-B-03
Comment IntProt
Instrument Name MH Instrument User Name wadminAcq Method Intact_MyoglobinNovartis.m Acquired Time 3/4/2014 2:08:13 PM
Intact Acq + Myo-DA
6200 series TOF/6500 series Q-TOF B.06.00 (B502)
Column2Sample Group
Protein Sequence
Mass
Mod Pro�le1
Custom
Column3
horse_myo.txt16951||| Phospho&OxA,B,C
S1
Column2Info.
Mod Pro�le
Protein Sequence 1
Mass1
Custom1
Stream NameWalkup Method Description
Acquisition SW Version
Column3
||| MyoMyoglobin2.psq16951test
Compound TableMass
16951.778Sequence Name
Myoglobin (horse)Target Mass
16951.6073MaxZ
18Z Count
13Fit Score
0
RuleIntact protein
Rule
Intact proteinUncertainty
0.05Signi�cance
100Algorithm
Peak Modeling Deconvolution# Hits
3Data File
Intact_MyoglobinNewMyo-010012.dDelta ppm
10.07Height
201650689MinZ
6
998.1704
Spectrum
Spectrum
AlgorithmPeak Modeling Deconvolution
Mass16951.778
Sequence NameMyoglobin (horse)
Target mass16951.6073
Delta ppm10.07
MinZ6
MaxZ18
Z Count13
Fit Score0
Uncertainty0.05
Signi�cance100
1131.15781211.88291305.02721413.69551542.1217
MS Spectrum Peak Listm/z
998.19891060.5234
Calc m/z
1060.49311131.12551211.84831304.98991413.65521542.0777
-28.54
z
1716151413
Di�(ppm)
-28.52-28.53
Abund
23654.564051.1
121533.45159260.59
-28.53
-28.53-28.53-28.53-28.53
98
1696.18481884.53792119.9793
1884.59172120.0398
1696.2332 -28.54-28.54
--- End Of Report ---
169176.91153094.25129325.84
76638.532788.913695.6
121110
Page 1 of 1 Printed at: 3:13 PM on:3/14/2014
Agilent MassHunter BioConfirm 소프트웨어
단백질 및 펩타이드 특성 분석 솔루션
2
단백질/펩타이드 특성 분석의 신뢰성 개선
애질런트의 정교한 MassHunter BioConfirm 소프트웨어는 단백질/펩타이드 분석에 높은 신뢰성을 제공합니다. 애질런트의 고성능 액체 크로마토그래피/질량 분석(LC/MS) 시스템과 함께 사용하며, 합성 펩타이드의 빠른 확인과 단백질 및 펩타이드의 특성 분석을 위한 지능형 솔루션입니다. 이제 확실하고 쉽게 데이터를 확인함으로써 탐색 결과를 개선할 수 있습니다.
AGILENT MASSHUNTER BIOCONFIRM 소프트웨어
BioConfirm 소프트웨어는 다음과 같은 사항을 제공합니다.• 정밀하고 빠른 단백질 확인
• 배치와 배치간의 분석 용이
• 포괄적인 펩타이드 매핑
3
Counts vs. Deconvoluted Mass (amu)
2.82.42.01.61.20.80.4
0
x106
3.22.82.42.01.61.20.80.4
0
x104
144600 144800 145000 145200 145400 145600
144783.28
144946.75
145106.77
145265.67
144582.58
144786.27
144947.23 145107.68
145268.27
145583.41
(a) 최대
(b) 피크 모델링
원형 단백질 워크플로
Deconvolute단백질 시퀀스 일치 및 PTM 예측
보고서 생성MS 통합 및 추출데이터 획득
Qualitative Compound Report
MS Spectrum
IRM Calibration Status Success DA Method BioConfirmIntactProteinHighMass-Default.m
Data File Intact_MyoglobinNewMyo-010012.d Sample Name NewMyo-01Sample Type Sample Position P1-B-03
Comment IntProt
Instrument Name MH Instrument User Name wadminAcq Method Intact_MyoglobinNovartis.m Acquired Time 3/4/2014 2:08:13 PM
Intact Acq + Myo-DA
6200 series TOF/6500 series Q-TOF B.06.00 (B502)
Column2Sample Group
Protein Sequence
Mass
Mod Pro�le1
Custom
Column3
horse_myo.txt16951||| Phospho&OxA,B,C
S1
Column2Info.
Mod Pro�le
Protein Sequence 1
Mass1
Custom1
Stream NameWalkup Method Description
Acquisition SW Version
Column3
||| MyoMyoglobin2.psq16951test
Compound TableMass
16951.778Sequence Name
Myoglobin (horse)Target Mass
16951.6073MaxZ
18Z Count
13Fit Score
0
RuleIntact protein
Rule
Intact proteinUncertainty
0.05Signi�cance
100Algorithm
Peak Modeling Deconvolution# Hits
3Data File
Intact_MyoglobinNewMyo-010012.dDelta ppm
10.07Height
201650689MinZ
6
998.1704
Spectrum
Spectrum
AlgorithmPeak Modeling Deconvolution
Mass16951.778
Sequence NameMyoglobin (horse)
Target mass16951.6073
Delta ppm10.07
MinZ6
MaxZ18
Z Count13
Fit Score0
Uncertainty0.05
Signi�cance100
1131.15781211.88291305.02721413.69551542.1217
MS Spectrum Peak Listm/z
998.19891060.5234
Calc m/z
1060.49311131.12551211.84831304.98991413.65521542.0777
-28.54
z
1716151413
Di�(ppm)
-28.52-28.53
Abund
23654.564051.1
121533.45159260.59
-28.53
-28.53-28.53-28.53-28.53
98
1696.18481884.53792119.9793
1884.59172120.0398
1696.2332 -28.54-28.54
--- End Of Report ---
169176.91153094.25129325.84
76638.532788.913695.6
121110
Page 1 of 1 Printed at: 3:13 PM on:3/14/2014
Deconvoluted 스펙트럼. (a) maximum entropy deconvoluted 스펙트럼. (b) 피크 모델링 deconvoluted
스펙트럼.
정밀한 단백질 확인
BioConfirm은 원형 단백질의 분자량을 결정하기 위해 전통적인 maximum entropy deconvolution 알고리즘과 고급 피크 모델링(pMod) 알고리즘 모두를 제공합니다.
Maximum entropy deconvolution은 특히 단순 단백질 혼합물을 위한 빠른 질량 분리능을 제공합니다. 복잡한 단백질 혼합물의 경우 고급 pMod 알고리즘을 이용해 더 깨끗한 스펙트럼과 정밀한 질량 측정치를 제공하여 스펙트럼에서 인공물을 제거하고, 심각하게 중첩되는 피크라 하더라도 중첩 피크를 분리하는 데 도움을 줍니다. 이렇게 하여 원형 단백질 시퀀스와 modification을 빠르게 확인할 수 있습니다.
BioConfirm 소프트웨어는 다음과 같은 사항을 제공합니다.• 정밀하고 빠른 단백질 확인
• 배치와 배치간의 분석 용이
• 포괄적인 펩타이드 매핑
4
Counts vs. Mass-to-Charge (m/z)
7.26.66.05.44.84.23.63.02.41.81.20.6
0
x104
100 200 300 400 500 600 700 800 900 1,000 1,100
펩타이드 맵핑 워크플로
단백질 시퀀스 일치 및 PTM 식별
시퀀스 커버리지 시각화
보고서 생성Compounds 추출
데이터 획득
BioConfirm은 원활한 매핑 및 데이터 해석을 위해 MS/MS 데이터 처리를 개선합니다.
강력한 펩타이드 매핑 기능
BioConfirm은 MS/MS 스펙트럼에서 펩타이드 질량 및 product ion(b, y 및 immonium)을 바탕으로 펩타이드 및 PTM을 식별합니다. BioConfirm을 이용하면 펩타이드 매핑을 위해 MS/MS 데이터를 더 빠르고 원활하게 처리할 수 있습니다.
펩타이드 MS/MS 스펙트럼 product ion 할당.
5
Counts vs. Mass-to-Charge (m/z)
1.050.9
0.750.6
0.450.3
0.150
x102
100 400 700 1,000 1,300 100 400 700 1,000 1,300
Counts vs. Mass-to-Charge (m/z)
0.8
0.5
0.2
-0.1
x102
0.8
0.5
0.2
-0.1
x102
300 450 600 750 900 1050 1,200 1,350 1,500 1,650
Counts vs. Deconvoluted Mass (amu)
2.4
1.8
1.2
0.6
0
-0.6
-1.2
-1.8
-2.4
-3.0
-3.6
x103
147100 1474000 147700 148000 148300 148600 148900
편리한 배치 간 비교
BioConfirm은 단백질과 펩타이드 수준 모두에 대해 배치 간 분석을 더 빠르게 실행할 수 있으므로, 분석 시료를 쉽게 시각적으로 비교할 수 있습니다.
Mirror Plot 기능을 이용하면 -바이오의약품분석의 필수적인 부분인-설계된 단백질 또는 바이오시밀러의 배치와 같이 두 가지 시료를 빠르고 확실하게 비교할 수 있습니다. Mirror Plot 안의 샘플들은 데이터 재처리 없이 빠르게 전환할 수 있습니다.
시료와 참조 물질을 신속하게 비교하여 바이오시밀러 및 배치 간 편차 모니터링
비교 분석 모듈을 이용해 두 배치간의 데이터 차이를 쉽게 식별하고 시각화하는 간편한 시험법을 구축할 수 있습니다. 시료와 대조물질과의 비교를 위해 크로마토그램, MS 및 MS/MS 스펙트럼을 이용합니다.
두 가지 설계된 단백질의 Mirror Plot.
MS/MS 스펙트럼 비교 결과.
MS 스펙트럼 비교 결과.
6
mAb Glycan 워크플로
Compounds 추출데이터베이스 검색 및 Glycan 식별
백분율 계산 및 보고서 생성
데이터 획득
N
빠르고 정확한 mAb GLYCAN 분석
BioConfirm을 이용하면 애질런트의 Glycan Personal Compound Database(PCD) 및 사전 정의된 폭 넓은 glycan modifications를 사용하여 mAb 시료에서 glycan 구조를 정확하게 식별하고 시각화할 수 있습니다. 애질런트의 mAb-Glyco 칩을 이용하여 mAb의 on-chip deglycosylation 뿐만 아니라 분할된 glycna의 농축, 크로마토그래피 분리 및 검출을 포함한 하드웨어, 소프트웨어 및 소모품이 있는 종합적인 워크플로를 확보할 수 있습니다. BioConfirm을 이용한 데이터 처리를 포함하여 모든 작업은 15분 이내에 완료할 수 있습니다.
BioConfirm은 mAb Glycan의 분석을 위해 쉽고 효과적인 워크플로를 제공합니다.
7
간편한 3단계 시료 제출
시료 정보 입력 ALS에 바이알 배치
전자메일 수신함으로 보고서 전달
로그인
1 2 3
초보 MS 사용자를 위한 WALK UP 분석
BioConfirm 소프트웨어는 애질런트 MassHunter Walkup 솔루션의 일부입니다.
MassHunter Walkup은 초보 사용자가 최소의 교육을 통해 3개의 간편한 단계를 이용하여 단백질과 펩타이드 시료를 분석할 수 있는 사용이 편리한 인터페이스를 제공합니다. 사용자는 복잡한 질량 분석 조건을 걱정할 필요가 없으며, 표준 수집 및 데이터 처리 방법에 따라 시료를 분석할 수 있습니다. 그 결과는 직접 사용자의 전자메일 수신함에 전달됩니다.
기타 정보 www.agilent.com/chem/masshunter
온라인 구매 www.agilent.com/chem/store
지역 애질런트 고객 센터 www.agilent.com/chem/contactus
미국 및 캐나다 1-800-227-9770 [email protected]
아시아 태평양 [email protected]
이 발간물은 연구용으로만 사용하십시오. 이 발간물의 정보, 설명 및 사양은 사전 공지 없이 변경될 수 있습니다. 애질런트 테크놀로지스는 이 발간물에 포함된 오류나, 이 발간물의 제공, 이행 또는 사용과 관련하여 발생한 부수적인 또는 결과적인 손해에 대해 책임을 지지 않습니다.
© Agilent Technologies, Inc., 2014 2014년 4월 7일 한국에서 인쇄 5991-3643KO
경기도 수원시 영통구 광교로 109 9층 (KANC) 우)443-270서울 강남구 역삼로 542 신사제2빌딩 2층 우)135-848한국애질런트테크놀로지스(주) 생명과학/화학분석 사업부 고객지원센터 080-004-5090 www.agilent.co.kr